В городах продолжались междоусобицы между рыцарями, знатью и горожанами, а также столкновения муниципальных властей и королевских чиновников. Для «наведения порядка» короли ежегодно назначали в города специальных должностных лиц — коррехидоров, подчинявшихся королевским судьям-ревизорам. Во многих городах выборные должности стали замещаться пожизненно назначаемыми короной чиновниками. Короли предприняли попытку уничтожить автономный союз городов — эрмандаду. В противовес ей в 1476 г. было принято решение о создании новой генеральной эрмандады с центром в Толедо, полномочия которой распространялись на Кастилию, Леон и Астурию. В состав эрмандады вошли и сеньоры. Главными ее функциями стали полицейские.
Все более ограничивалась сфера деятельности и влияния кортесов. Они созывались все реже: кастильские — 9 раз в 1475—1503 гг., а на протяжении десятилетия 1482—1492 гг., когда происходили отвоевание Гранады, открытие Америки, создание новой инквизиции и другие важные мероприятия, кортесы не созывались ни разу; число городских представителей в кортесах резко сократилось. Редакция постановлений кортесов поручалась теперь членам королевского совета.
С 80-х годов XV в. в королевском совете большинство мест заняли должностные лица короля, которые и решали все дела. Герцоги, графы, маркизы лишь присутствовали на заседаниях совета, но не имели права решающего голоса. Совет ведал административными, но все более и судебными делами по мере реорганизации местных судебных органов (аудиенсий). В конце XV в. были созданы такие органы, как высший совет инквизиции, совет духовно-рыцарских орденов, совет по делам Индий. Кастилия и Арагоно-Каталонская области имели свои отдельные советы. Были проведены меры по упорядочению и централизации королевских финансов, а также военная реформа: возрос контингент наемных войск, однако немалый вес сохраняли еще милиционные ополчения городов.
В соответствии с папской буллой 1478 г. и последующими постановлениями 1482—1499 гг. была учреждена испанская инквизиция — церковный суд, члены которого назначались папой с согласия короля. Он вошел в историю как особо жестокое судилище. Первоначально суд инквизиции ведал только делами еретиков, обращенных в христианство мусульман и евреев, а затем стал разбирать и дела, касающиеся всего населения страны. Страшные пытки, жестокие меры наказания — нередко вплоть до сожжения на костре — оставили в памяти потомков «деятельность» этого учреждения. Каннибальской жестокостью «прославился» уже первый генеральный инквизитор Торквемада.
Новые формы эксплуатации в раннекапиталистических мануфактурах в городах Италии вызвали и новые формы классовой борьбы: выступления наемных рабочих со своими специфическими программными требованиями. Первое стихийное выступление шерстобитов произошло в 1289 г. в Болонье. В 1345 г. во Флоренции чесальщик шерсти Чуто Брандини пытался создать союз наемных рабочих, за что был присужден к смертной казни.
Наемные рабочие сукнодельческих мастерских Перуджи в 1371 г. подожгли дома богатых пополанов и явились активной силой восстания, которое привело к падению правительства городской верхушки. Крупнейшим восстанием предпролетариата в Италии XIV в. и по существу первым в мире выступлением наемных рабочих было восстание чомпи (чесальщиков шерсти и других наемных рабочих) во Флоренции в 1378 г. 22 июня вооруженные отряды наемных рабочих и ремесленников младших цехов начали поджоги домов магнатов, что вынудило правительство «жирных пополанов» принять некоторые антимагнатские постановления. Но восставшие хотели добиться улучшения своего положения и политических прав. Одним из главных их требований было предоставление им четвертой части всех мест в правительственных органах (где они раньше не были представлены) и поста главы правительства — гонфалоньера справедливости. Поскольку политическими правами в городе пользовались только члены цеха, чомпи и другие наемные рабочие выдвигали требование о создании особого цеха наемных рабочих. 21 июля им удалось после долгой борьбы занять дворец подеста, а 22 июля — дворец Синьории, из которого они изгнали правительство приоров. В число вновь избранных приоров вошли и чомпи, им, как и мелким ремесленникам, удалось также создать и свои особые цехи.
Но «жирные пополаны» сумели поставить на пост главы нового правительства своего ставленника, надсмотрщика в мастерской Микеле ди Ландо, который саботировал мероприятия восставших. Хозяева не открывали сукнодельческие мастерские, установили голодную блокаду города. Вынужденное решение правительства о повышении на 50% заработной платы чомпи не было выполнено. Близкий к чомпи хронист писал: «Жирный народ все делает для себя и подносит вам ко рту пустую ложку».