В XIII веке не раз звучала критика в адрес тамплиеров, подобная той, с которой выступил Гийом Тирский. Да и папство теперь оказывало ордену менее щедрую поддержку. В 1207 году Иннокентий III обвинил тамплиеров в необузданной гордыне и недостойном использовании своего привилегированного положения. Папа писал, что члены ордена «по наущению дьявола ставят знак Святого креста на груди любого бродяги… не задумываясь, громоздят один грех на другой, позволяя каждому, кто за год сумел собрать для них хотя бы два-три денария, присоединяться к братству и, благодаря этому, быть похороненным по церковному обряду, даже если этот человек отлучен от церкви; таким образом, даже прелюбодеи, мошенники-ростовщики и прочие преступники получают возможность быть похороненными в освященной земле, подобно истинно верующим католикам».
Примечательное сочинение написал в 1306 году, накануне разгрома ордена Храма, ярый сторонник Филиппа Красивого адвокат Пьер Дюбуа. Он составил длинный трактат «О возвращении утраченной Святой земли». Составной частью предложенного им плана было объединение рыцарских орденов, которые, по его словам, получают огромный доход и собирают невероятные урожаи со своих бескрайних земельных владений по эту сторону Средиземного моря, однако же крайне мало делают для укрепления и защиты границ самой Святой земли. Члены орденов, проживающие как в Святой земле, так и на Кипре, должны быть лишены своего имущества. По мнению Дюбуа, как только в результате подобной политики будет получен реальный ежегодный доход, «сразу станет явным недостаток веры как у тамплиеров, так и у госпитальеров, которые вплоть до сего дня ради собственного обогащения предавали Святую землю и грешили против нее… весьма желательно полностью уничтожить даже саму память об ордене тамплиеров и, справедливости ради, стереть его с лица земли». Известный средневековый писатель Раймунд Луллий, посвятивший значительную часть своей жизни изучению исламских проблем, даже проклинал тех, кто выступал против объединения орденов.
Объединение было, по мнению многих, необходимым условием для организации нового крестового похода. Так полагал и Папа Римский. Видя слабость византийского императора, позволившего госпитальерам безнаказанно оккупировать крупный остров Родос, Филипп задумал отвоевать константинопольский трон для своего брата Карла Валуа. Этот план не слишком вписывался в схему Климента V, однако Франция, Венеция, Арагон и Неаполь уже определенно нацелились на византийскую корону.
Магистр Жак де Моле отреагировал на призыв объединяться. В ответ на предложение папы он составил меморандум, где изложил свой взгляд на ситуацию, начав с того, как зародилась идея о слиянии двух орденов – это произошло на Лионском соборе в 1274 году. Магистр перечислил и всех прелатов, выступивших тогда против этого предложения, не забыл и Бонифация VIII. Жак де Моле признавал, что в объединении орденов есть определенный смысл – столь мощное братство могло бы более эффективно бороться со своими врагами, но вместе с тем по отдельности госпитальеры и тамплиеры обладали большей тактической гибкостью и маневренностью. Соперничество орденов Госпиталя и Храма давало несомненную выгоду, и хотя их цели практически совпадали, сам характер действий различался: госпитальеры занимались преимущественно благотворительностью, а храмовники выполняли функции вооруженной охраны единоверцев. Де Моле соглашался, что ордена должны сплотить свои усилия как в деле опеки и защиты паломников, так и в борьбе с сарацинами, но при этом оставаться независимыми братствами.
Второй меморандум Жака де Моле стал его ответом на призыв Папы Римского к новому крестовому походу. И снова Великий магистр выступил против укоренившегося в те времена взгляда на такую экспедицию как на особое военное предприятие с исключительным участием профессионалов и опорой на киликийских армян-христиан. Он писал, что горький опыт, полученный тамплиерами после потери их последней ближневосточной базы на острове Руад, показал, что такие мелкомасштабные операции обречены на неудачу. Кроме того, многолетние отношения тамплиеров с армянами свидетельствуют, что те не заслуживают доверия и часто подводят в самые ответственные моменты. Из-за подозрительности и нелюбви к франкам армяне, как правило, не пускают латинян в свои замки. Наконец, климат в тех местах весьма вреден для здоровья, и многие крестоносцы гибнут от болезней.