Погибшего голову местных стрельцов заменил его сын — Иван Дмитриевич Зубов, командовавший приказом более двадцати лет21. Летом 1656 г. Иванов приказ Зубова в составе полка воеводы Ф.Б.Долматова-Карпова был направлен к Риге. Затянувшиеся военные действия, завершившиеся «невзятием» крепости, значительно подорвали боевой дух царской рати. Смотр, проведенный воеводой на пороге Кегоме в ходе отступления, показал, что в строю зубовских стрельцов оставалось всего 322 человека, а 117 из похода сбежало.
К началу февраля 1657 г. местные стрельцы уже находились в столице. Однако спокойная жизнь на Москве продлилась немногим более года. В мае 1658 г. на службу в Киев были посланы с боярином и воеводой В.Б.Шереметевым стольники князь Ю.Н.Барятинский и И. И.Чаадаев да дьяк А.Постников с ратными людьми, в числе которых был и приказ И.Д.Зубова. Накануне похода стрелецкий голова «бил челом Государю, что ему с Иваном Чаадаевым быти не вмест-но». После разбора этого местнического дела государь указал стольнику Ивану Зубову «быть с одним боярином»
По прибытии полка Шереметева в Киев, авангард московской рати оказался в центре событий, охвативших Украину летом 1658 г. В августе к стенам города подступило войско гетмана И.Выговского, изменившего России и вступившего в союз с крымским ханом. Осажденный киевский гарнизон успешно оборонялся вплоть до подхода основных сил и наносил противнику ощутимые ответные удары. Во время одной из вылазок отличился приказ Зубова, выбивший отряд черкас из пригородного Киселева городка. Трофеем стрельцов стала казачья хоругвь.
В последующие годы стрельцы Зубова еще не раз несли службу в украинных городах. В начале февраля 1668 г., накануне очередного похода, государь жаловал стрелецкого голову И.Д.Зубова за прошлую службу в Севске 50 ведрами вина и 10 полотами ветчины. 16 февраля последовал указ о посылке приказа в поход против запорожских черкас гетмана И.Брюховецкого в составе полка воеводы князя Ю.А.Долгорукого. Многие местные стрельцы не вернулись из похода сборного стрелецкого приказа головы И.Т.Лопатина, разгромленного разницами под Царицыным весной 1670 г. В ноябре 1672 г. приказ
Ивана Зубова был вновь послан на службу в Киев с боярином и воеводой князем Ю.П.Трубецким, где оставался вплоть до начала 1675 г.
После возвращения в столицу в командовании приказом произошли изменения. Документы умалчивают имя преемника И.Д.Зубова, что не позволяет воссоздать историю полка в последующие годы. Но за три десятилетия, в течение которых отец и сын Зубовы командовали местными стрельцами, их фамилия прочно отложилась в памяти москвичей, дав название местности, прилегавшей к Пречистенским воротам Земляного города «по левой стороне большой улицы».
В 90-е годы стрельцы-прихожане церкви Живоначальной Троицы в Зубове возвели рядом со своим храмом самую высокую в Москве шатровую колокольню с Никольским и Покровским пределами, освященными в 1696 г. В это время полком командовал обрусевший немец, бывший стрелецкий полуполковник, стольник Тихон Христофорович Гундертмарк23. Под его командованием местные стрельцы в составе полка генерала А.М.Головина приняли участие во взятии Азова летом 1696 г. Здесь они были оставлены на годовую гарнизонную службу в числе нескольких стрелецких и солдатских полков, переданных в подчинение воеводе князю П.Г.Львову.
Спустя год, вместо ожидаемого возвращения в Москву полк Гун-дертмарка получает приказ выдвинуться в Великие Луки, а затем в Дорогобуж. На пути к новому месту службы стрельцов, с трудом сдерживавших свое негодование, настигает весточка от царевны Софьи, призывавшая их в столицу. Вместе с тремя другими стрелецкими полками, изгнав своих начальников, они двинулись с берегов Двины к Москве. Однако встреча с «белокаменной» для большинства из них так и не состоялась.
В скоротечном бою с полками боярина и воеводы А.С.Шеина, произошедшем 18 июня 1698 г. на берегу реки Истры, близ подмосковного Воскресенского монастыря, погибло трое стрельцов полка Гундертмарка. К 1 июля по розыску, проведенному Шеиным, были казнены первые 12 их однополчан. Еще 478 человек в колодах были разосланы по тюрьмам окрестных городов и монастырей. После возвращения из-за границы царя Петра в Москву для повторного розыска было доставлено всего 366 гундертмарковских стрельцов. Прочим из мест заточения удалось скрыться. Для большинства их сослуживцев долгожданная встреча со столицей стала последней в жизни. Старшие стрелецкие чины полка Гундертмарка, не принимавшие участие в бунте, были расписаны по другим воинским частям. Сам стрелецкий полковник получил назначение командиром одного из солдатских полков.