Гитлеровцы отторгли от Чехословакии одну треть территории, на которой находилось 40 % всей промышленности и 33 % населения. Сотни тысяч тонн угля, тысячи тонн цветных металлов, большие запасы хлопка, пряжи, готовых изделий и продовольствия были вывезены в Германию.
16 марта Гитлер издал указ о ликвидации Чехословацкой республики и присоединении ее территории к Германской империи в виде протектората Чехии и Моравии. Во главе протектората был поставлен немецкий наместник — имперский протектор, пользовавшийся неограниченными полномочиями. Имперским протектором Гитлер назначил фон Нейрата, его секретарем — ген-лейновца Франка (генлейновцы — это фашисты, завербованные из немецкого населения, проживавшего в Чехословакии. Во главе этой фашистской партии стоял К. Генлейн, тайный агент Гитлера. По его имени вся партия стала называться генлейновской. В дни Мюнхена она сыграла роль пятой колонны).
Словакия оказалась на положении немецкой полуколонии. Она попала в экономическую и политическую зависимость к гитлеровцам. Немецкие монополии захватили ключевые позиции в экономике Словакии, вывозили из страны по дешевым ценам сельскохозяйственные продукты и промышленное сырье.
Уже в первые годы оккупации произошел ряд стихийных выступлений против оккупантов.
В ответ на запрещение празднования Первого мая в 1939 г. жители Праги провели массовую демонстрацию 6 и 7 мая по случаю перевоза останков национального поэта К. Махи из Литомержиц в Прагу. К пантеону, где был выставлен гроб с останками поэта, пришло более 50 тыс. человек и около 250 тыс. приняло участие в проводах гроба по улицам Праги.
Летом 1939 г. состоялись выступления против оккупантов в форме демонстраций в связи с чешскими национальными праздниками (день памяти Гуса, праздник матери и др.)* В сентябре 1939 г. по всей стране прокатилась волна демонстраций и стачек протеста против начала войны в Европе. Гитлеровцы арестовали многих участников демонстраций. В ответ на это на военных заводах вспыхнули забастовки. С начала оккупации до конца 1939 г. в чешских землях произошло 24 забастовки.
28 октября 1939 г., в день 21-й годовщины республики, в Праге, Остраве, Кладка, Пльзене и других городах состоялись массовые демонстрации. В Праге демонстрация закончилась столкновением с оккупантами, в рядах антифашистов были жертвы. Похороны студента Оплетала, умершего от ран, полученных во время столкновения с фашистами 28 октября 1939 г., превратились в новое массовое выступление пражан против нацистов. Фашистские захватчики в ноябре 1939 г. учинили варварский разгром общежитий студентов в Праге, закрыли все высшие учебные заведения, арестовали и угнали в концентрационные лагеря большое количество студентов-антифашистов.
Массовые выступления в октябре и ноябре 1939 г. были жестоко подавлены. В сложившейся обстановке было необходимо временно ориентировать население не на открытые массовые выступления, а на скрытые формы борьбы. Было решено шире применять в борьбе саботаж, диверсии, развернуть движение за понижение про-изводительности труда и ухудшение качества выпускаемой продукции. Именно в это время были выдвинуты лозунги: «Работай не спеша!», «Наша продукция должна быть самой худшей в мире!»
18 июля 1941 г. правительство Советского Союза подписало с эмигрантским правительством Чехословакии соглашение о взаимной помощи и поддержке в войне против Германии.
Советско-чехословацкое соглашение способствовало дальнейшему росту движения Сопротивления, несмотря на усиление террора оккупантов. Только за первую половину июля 1941 г. в Чехословакии произошло 11 железнодорожных катастроф. Широкое распространение на транспорте получили такие формы саботажа, как посыпание подшипников песком, повреждение вагонной сцепки, отвинчивание гаек на рельсах, поджог горючего, взрывы складов с материалами и оружием.
С осени 1941. г. в стране начали возникать подпольные национальные комитеты, руководившие борьбой против оккупантов, появились первые партизанские отряды.