В местах же, где имелись органы госвласти и гарнизоны ВС РА (Кандагар, Лашкаргах, Гардез, Газни, Асадабад, Джелалабад, Хост, Ургун), оппозиция предпринимала энергичные усилия по размыванию системы народной власти путем склонения ее представителей к сотрудничеству, активно используя племенные, родственные и религиозные каналы. Например в провинциях Кандагар и Гильменд командирам вооруженных отрядов оппозиции удалось в значительной степени преодолеть откровенную враждебность, существующую между формированиями различной ориентации, и договориться о прекращении столкновений.
Большую роль в этом сыграла группа представителей «Альянса-7», которая находилась в провинции Гильменд в конце июля-начале августа. В состав этой группы входили представители Саудовской Аравии. Основной задачей группы было примирить враждующие группировки и сплотить их для борьбы с госвластью. При этом саудовцы не скупились на обещания, выписывая и вручая чеки на сумму до 500 тыс. афгани (в пакистанских рупиях) даже командирам мелких бандгрупп.
Для решения спорных вопросов между различными группировками на территории, находящейся под контролем оппозиции, был создан так называемый исламский суд, в состав которого были избраны 7 человек представителей бывшей племенной знати.
В распоряжении «суда» было выделено 300 вооруженных человек от группировок различной ориентации, которые выполняли роль полицейских сил в районах, не контролируемых госвластью.
В это время большинство руководителей основных отрядов вооруженной оппозиции выехало в Пакистан для консультаций с лидерами оппозиционных группировок и получения оружия. Караваны с оружием прибывали в провинции Кандагар и Гильменд регулярно.
Среди жителей Лашкаргаха и военнослужащих гарнизона преобладающими стали настроения неуверенности в собственной судьбе.
Распространялись сведения о скором прибытии в провинцию Гильменд американских и японских специалистов. Президент гильмендской строительной компании заявлял, в частности, что американцы выделили им кредит в 3 млн. дол. для закупки сельскохозяйственной техники. Эта техника, по его словам, должна была поступить в провинцию после вывода советских войск из Афганистана. Характерно, что коттеджи, в которых жили советские специалисты, несмотря на острую нехватку жилплощади, остались незаселенными. Они предназначались для американских специалистов, которые должны были заменить советских.
В Нангархаре после вывода советских воинских подразделений из провинции и отхода правительственных сил из некоторых приграничных с Пакистаном районов под полный контроль вооруженной оппозиции сразу же перешли уезды Хугиани, Хисарак, волости Ширзад и Пачиро-Агам. Затем уже в ходе боевых действий в ноябре мятежники при поддержке пакистанских малишей захватили округ Шинвар, уезды Ачин, Назьян, Мухмандара, Рудат и волости Дорбаба, Лалпура, Батикот. Под частичным контролем государства находились лишь уезды Сорхруд, Кузкунар, Кама, Гошта, волость Дарайи-Нур и административный центр провинции г. Джелалабад. Эти районы подвергались практически ежедневному огневому воздействию противника.
Несмотря на проведенную вооруженными силами РА операцию, звались блокированными мятежниками основные транспортные магистрали Джелалабад — Кабул и Джелалабад — Торкхам, что создавало значительные дополнительные трудности в снабжении Джелалабада и Кабула продуктами питания и товарами первой необходимости.
Вооруженная оппозиция готовилась к более активным действиям в провинции, о чем свидетельствовали увеличивающиеся переброски из Пакистана вооружения, материально-технических средств на основные склады в районах Тура-Бура, Марульгад, Шпалькай, Шальман и Чеконур. На обстановку в Нангархаре негативное воздействие оказывал и тот факт, что в этой провинции действовали главным образом отряды «непримиримой» оппозиции из группировок ИПХ (Ю. Халеса) и ИПА (Г. Хекматияра).
В условиях, когда мятежники действовали активно и решительно, местное партийно-государственное руководство не предпринимало эффективных мер по борьбе с контрреволюцией и продолжало занимать выжидательную позицию. К тому же не было тесного взаимодействия между различными компонентами ВС в провинции (армия, МВД, МГБ), наблюдалось стремление переложить ответственность за неудачи друг на друга. Политическая работа с населением, в том числе с племенами практически не велась, резко сократился призыв в ВС (20 % плана).