Что делал Скорцени в период с начала марта 1945 года до конца войны не совсем ясно. Сначала он находился в Вене, потом в так называемом «Баварском опорном районе» на границе Германии и Австрии. Возможно, он готовил последнюю акцию — пытался создать «Альпийскую крепость» в горах Тироля в Австрии. Там гитлеровцы рассчитывали окопаться и продолжать борьбу «до последнего человека». Помимо людей и оружия, Скорцени получил «на расходы» несколько сотен тысяч фальшивых фунтов стерлингов. Но все потуги организовать сопротивление оказались бесполезными. А быть может, «Альпийская крепость» — лишь предлог оказаться в тех местах, возможно, Скорцени было поручено спрятать сокровища Третьего рейха? Это остается загадкой.
Пoсле войны: на службе у врага?
15 мая 1945 года Отто Скорцени сдался американцам. Он попал под опеку руководителя американской разведки генерал-майора Уильяма Джозефа Донована. Несмотря на многочисленные факты преступных действий Скорцени, американский военный трибунал в Дахау вынес ему оправдательный приговор. После оглашения вердикта суда в западногерманском журнале «Квик» появился материал, в котором говорилось: «Мелюзгу вешают, крупным дают сбежать».
Но был ли Скорцени действительно диверсантом номер один и крупным нацистским преступником? Если бы это было так, то в устранении или суде над Скорцени была бы заинтересована советская сторона. Его бы вытребовали в Нюрнберг, но этого никто не сделал. Итак, военный трибунал оправдал Скорцени в 1947 году, и тот очутился на свободе, никем не преследуемый. Есть также сведения, что в 1948 году он, под прозвищем Эйбл, стал работать в американской разведке: в специальном лагере в штате Джорджия Скорцени обучал американских коллег методам забрасывания и эвакуации агентов-парашютистов.
В 1949 году Скорцени под именем Роберта Штейнбахера создал подпольную организацию «Die Spinne» («Паук»), которая помогла более чем 500 бывшим членам СС бежать за границу. В 1950-м он побывал во Франции и Германии, где в нескольких издательствах готовилась к печати книга его мемуаров. После этого он оказался в Италии. По некоторым данным, встретившись там со своими единомышленниками, Скорцени учредил синдикат «Организация лиц, принадлежащих к СС» (ODESSA), задачей которого было спасение от суда нацистов.
Покинув Италию, Скорцени переехал в Испанию, где в это время под крылом диктатора Франко укрывалась нацистская колония из шестнадцати тысяч человек, в числе которых было пять тысяч высокопоставленных гитлеровцев. Там Скорцени не нужно было скрывать свое прошлое. Он даже появился в картинной галерее Мадрида с Рыцарским крестом на шее! Испания надолго стала пристанищем для Скорцени. Он основал там две базы для нацистов: одну близ Севильи, а вторую — в уединенной вилле неподалеку от Константины.
В январе 1951 года фамилия Скорцени была вычеркнута из списков лиц, разыскиваемых полицией ФРГ. Теперь он мог свободно курсировать между Испанией и Германией то под собственным, то под вымышленным именем, с тем чтобы укрыть в Испании как можно больше нацистов.
Одной из непроверенных легенд о Скорцени является рассказ о шантаже Уинстона Черчилля. Дескать, после освобождения Муссолини у Скорцени оказались его секретные документы, в числе которых были письма Черчилля. В 1951 году через своего агента Скорцени возвратил Черчиллю эти письма, за что последнему пришлось дать гарантию, что в случае победы на выборах он освободит военных преступников. Так и произошло. После победы консерваторов Черчилль сформировал новое правительство и распорядился освободить ряд видных нацистских преступников. Вскоре они покинули тюрьмы. Но было ли это освобождение результатом шантажа со стороны Скорцени или его участие в этом деле сильно преувеличено? Это так и остается загадкой.
Вся дальнейшая жизнь Скорцени, а умер он в Мадриде 5 июля 1975 года, была посвящена заботе о нацистских военных преступниках, участию в различных мероприятиях «холодной войны» и подготовке к «горячей». Однажды в Нюрнберге Скорцени заявил: «Дайте мне тысячу человек и свободу действий, и любой противник потерпит поражение в новой войне».