Скорцени до конца жизни оставался верным Третьему рейху и хранил при себе фотографию Гитлера в серебряной рамке с надписью: «Моему штурмбаннфюреру Отто Скорцени в благодарность и на память о 12 сентября 1943 года. Адольф Гитлер».
Также он утверждал уже после войны: «По моему мнению, Гитлер был крупной личностью и обладал исключительно светлым умом». А в выступлении 31 августа 1960 года в Ирландии во всеуслышание произнес: «Гитлер действительно мертв! Я заявляю: лучшим доказательством того, что он мертв, служит тот факт, что я нахожусь здесь. Будь Гитлер жив, я был бы рядом с ним!»
О послевоенных годах жизни Скорцени известно и много, и мало. Он побывал во Франции, Западной Германии, Италии, Аргентине (газета «Эпоха» опубликовала снимок, сделанный на вилле в пригороде Буэнос-Айреса, под таким заголовком: «Президент Перон принял двух представителей фирмы Круппа», и в одном из собеседников Перона можно без труда узнать Отто Скорцени), а также в Англии и Ирландии.
Российские разведорганы, собиравшие досье на Скорцени, утверждают, что в начале 1963 года Скорцени начал работу с израильской разведкой. Кстати, 3 июля 2006 года израильский журналист и историк Михаил Хейфец опубликовал статью «Отто Скорцени работал на «Моссад». В ней говорилось: «Речь идет о работе самого знаменитого из эсэсовцев, главы “спецназа” СС, оберштурмбаннфюрера Отто Скорцени на координатора израильских разведслужб Меира Амита в 1960-х годах прошлого века».
После войны многие немецкие специалисты в области ракетостроения нашли убежище в Египте. Президент Насер решил привлечь их для разработки новейших типов ракет для египетской армии. Их безопасностью ведал бывший офицер СС под псевдонимом Валентин. Узнав об этом, премьер министр Израиля Бен-Гурион изыскивал возможности предотвращения угрозы для своей страны. Израильская разведка установила, что некий еврей, промышленник из Германии, связан деловыми контактами с фирмой, которая принадлежала испанской жене Скорцени. Это обстоятельство, к удивлению Амита, способствовало тому, что Скорцени весьма охотно откликнулся на предложение «немного помочь» «Моссаду» в Египте.
По рекомендации Скорцени, агенты «Моссада» вступили в прямой контакт с Валентином — давним коллегой Скорцени. Получив конкретные данные о характере работы германских специалистов в Египте, Амит представил соответствующую информацию министру обороны ФРГ Ф. И. Штраусу. В соответствии с действующим в ФРГ законом, запрещающим сотрудничество этого государства в военно-промышленной сфере с другими странами, все военные специалисты, являющиеся гражданами ФРГ, были отозваны из Египта. Цель израильской разведки была достигнута. Военная программа египетского президента была подорвана.
Естественен вопрос: зачем Скорцени это сделал, на какие ответные услуги израильской разведки рассчитывал? По утверждению Амита, Скорцени работал на него бесплатно и единственным его условием было издание книги мемуаров в Израиле на иврите. «Мы, правда, не особо старались в этом направлении, — утверждал бывший шеф «Моссада», — но написали к ней предисловие». Амит же прокомментировал факт сотрудничества израильской разведки с бывшим нацистом следующим образом: «Конечно, он был по ту сторону баррикад, без сомнения, но мы точно знали, что происходит у него в голове. У нас была цель, то, что мы хотели получить. Мы считали это “кошерным делом”.
Однако эта версия вызывает очень большие сомнения. Так генерал вермахта Отто-Эрнст Ремер заявил, что «у Скорцени не было никаких причин помогать тем, кого он считал узурпаторами и захватчиками. Кто может поверить, что на «Моссад» работал тот, чьими последними словами были: “Я горжусь тем, что верно служил своей стране и фюреру…” Скорцени никогда не врал, и неужели он мог опуститься до лжи перед уходом в лучший мир».
Несмотря на то, что Отто Скорцени прожил долгую жизнь и написал книгу воспоминаний, успешность и значение проведенных и подготовленных им диверсионных операций вызывает все новые споры, что приводит к появлению все новых и новых легенд. Этому, конечно, способствовала фашистская пропаганда, а после войны — сам Скорцени и, как ни странно, средства массовой информации советского блока. Во многом это произошло благодаря известному интервью, которое взял мэтр шпионского детектива Юлиан Семенов. В книге Ю. Семенова «Лицом к лицу» так описывается встреча со Скорцени, которая произошла в Мадриде в 1957 году: «В огромном пустом зале на последнем этаже нового мадридского дома сидели четыре человека: “гаранты” встречи — испанский миллионер дон Антонио Гарричес, его сын Хуан, Скорцени и женщина. Я шел через зал, буравил его лицо взглядом, который, казалось мне, должен быть гипнотическим, и видел глаза, зелено-голубые, чуть навыкате (не очень-то загипнотизируешь!), и шрам на лице, и громадные руки, лежавшие на коленях, и за мгновение перед тем, как человек начал подниматься, я почувствовал это».