Кутузов лично участвовал во многих боях, был трижды ранен, но неизменно возвращался в строй. В бою близ Алушты (в Крыму) Кутузов со знаменем в руках бросился вперёд, увлекая на штурм своих воинов. В этом сражении он был тяжело ранен и лишился глаза.
Кутузов ненавидел бессмысленную муштру и палочную дисциплину. Подобно Суворову, он презирал угодничество, лесть и продажность, которые господствовали при царском дворе. Кутузова при дворе не любили. Терпеть не мог его и сам император Александр I. Но солдаты уважали и ценили своего командира. Уступая требованиям армии и дворянства, Александр I назначил Кутузова главнокомандующим.
17 августа 1812 года Кутузов приехал в армию, отступившую к Царёву Займищу. Солдаты встретили полководца с ликованием. «Приехал Кутузов бить французов», — говорили они друг другу.
Продолжая отступление, Кутузов начал энергичную подготовку к сражению.
Позиция для боя с французами была выбрана у села Бородино. Местность здесь была холмистая, пересечённая оврагами. В центре расположения русской армии находилась деревня Бородино, а на левом фланге — деревня Семёновское. Широкая равнина перед деревней была удобна для передвижения войск. Здесь были спешно построены три земляных укрепления с мелкими рвами и невысокими валами.
Кутузов взял на себя общее командование, правый фланг он поручил Барклаю-де-Толли, а левый — Багратиону. Центр защищала батарея под командованием генерала Раевского.
Утром 26 августа русская и французская армии встретились на Бородинском поле. Наполеон подошёл к Бородину с армией в 135 тысяч человек и с артиллерией в 587 орудий. Русских регулярных войск под Бородином было 120 тысяч человек.
Основной удар Наполеон готовился нанести левому флангу русских. Атаки французов следовали одна за другой. Но русские войска, воодушевляемые Багратионом, отбивали их с необыкновенной стойкостью. Наполеон вынужден был сосредоточить на этом участке до четырёхсот орудий. Больше шести часов длилось сражение. Осколками ядра был смертельно ранен Багратион. Ценой огромных усилий французам удалось потеснить левое крыло русских армий. После этого Наполеон приказал атаковать батарею Раевского. В ожесточённом сражении погибли почти все её защитники.
Но французам не удалось сломить сопротивление русской армии. В решающий момент Кутузов направил в тыл врага казаков Платова, которые сорвали замыслы Наполеона.
Бородинская битва была необычайно ожесточённой. Потери с обеих сторон были очень велики. У Наполеона оставалась в резерве только его знаменитая гвардия. Но он наотрез отказался пустить её в бой. Вечером Наполеон отдал приказ отвести войска с поля боя.
Бородинское сражение показало героизм и силу русской армии.
Сам Наполеон перед смертью признал: «Из всех моих сражений самое ужасное — то, которое я дал под Москвой. Французы в нём показали себя достойными одержать победу, а русские стяжали право быть непобедимыми».
После Бородинской битвы русская армия всё же не имела ещё перевеса сил и медленно отступала по Московской дороге. Никто не верил в возможность сдачи Москвы без боя. Но позиции под Москвой были неудобны для нового сражения. Надо было сохранить и подготовить армию к предстоящим боям. Кутузов решил оставить Москву. На военном совете в деревне Фили Кутузов говорил своим генералам: «Доколе будет существовать армия и находиться в состоянии противиться неприятелю, до тех пор сохраним надежду благополучно довершить войну, но когда уничтожится армия — погибнут Москва и Россия».
Ранним утром 2 сентября 1812 года отступавшие русские войска непрерывным потоком проходили через Москву. Вместе с армией уходили и московские жители.
Когда французская армия вступила в тихую и безлюдную Москву, в разных её частях вспыхнули пожары. Они продолжались шесть дней. Из окон кремлёвского дворца Наполеон видел море огня. Гордый завоеватель содрогнулся. «Что это за народ! — воскликнул он. — Они сами всё сжигают. Это предвещает нам много несчастий».
Никто не боролся с пожарами. Москвичи, покидая горящий город, говорили: «Пропадай всё, но не доставайся врагу!».
Наполеоновская армия в горящей Москве грабила всё, что уцелело от огня. Среди французских солдат началось повальное пьянство. «Великая армия» разлагалась. На все предложения мира, с какими Наполеон обращался к Александру I, ответа не было. Оставаться зимовать в Москве было бессмысленно. Наполеон решил покинуть Москву.
В 7 часов утра 6 октября Наполеон начал отступление. Он двинулся к Калуге, где находились склады продовольствия для русской армии. Но ещё раньше Кутузов, отступивший из Москвы по Рязанской дороге, сделал обходный манёвр и вышел на Калужскую дорогу. Здесь, у Малоярославца, русская армия преградила Наполеону путь. Завязался упорный бой. Восемь раз за одни сутки Малоярославец переходил из рук в руки. Не решившись на новое генеральное сражение с войсками Кутузова, Наполеон приказал повернуть на Смоленскую дорогу. Этот путь пролегал по разорённой местности, и отступление по нему было связано с большими трудностями. Кутузов неотступно преследовал неприятеля, идя параллельным маршем и нанося ему серьёзные фланговые удары. В тылу и на путях отступавшей наполеоновской армии действовали русские партизаны.