Консерваторию Глиэр окончил в 1900 г. с Золотой медалью. После окончания учёбы композитор несколько месяцев провёл в Санкт-Петербурге, где принимал участие в собраниях знаменитого Беляевского кружка, возглавляемого Н.А. Римским-Корсаковым. Постоянными посетителями «беляевских пятниц» являлись Кюи, Глазунов, Лядов, Стасов, а также братья Ф. и С. Блуменфельды, оба выдающиеся пианисты и композиторы. В 1902–1903 годах Глиэр по рекомендации Танеева стал замечательным наставником для юного Сергея Прокофьева. С мальчиком он занимался в имении его родителей Сонцовка, и на всю жизнь стал для Прокофьева одним из самых дорогих и уважаемых людей. В это же время сёстры Гнесины пригласили Глиэра преподавателем теоретических дисциплин в их частную музыкальную школу. Так началось не только длительное сотрудничество, но и крепкая дружба между композитором и основательницами Музыкально — педагогического института, а ныне Российской Академии музыки. Здесь же Рейнгольд нашёл свою судьбу: он познакомился с очаровательной девушкой, своей ученицей Марией Ренквист. В 1904 году она стала женой Глиэра, а спустя год подарила композитору двух милых близняшек — Нину и Лию, а затем ещё троих детей: Романа, Леонида и Валентину. Глиэру в личной жизни очень повезло: он встретил женщину, с которой прожил в любви и согласии более 50 лет. Композитор был идеальным супругом, он обожал свою жену, каждое утро целовал её руку и ласково называл Манечкой.
В 1905 году композитор вместе со своей семьёй переехал в Германию, где прожил несколько лет. Там он продолжал активно работать, сочиняя различные произведения, в том числе фортепианные пьесы для детей по просьбе Е.Ф. Гнесиной (пять тетрадей), которые сразу отправлял в Москву. Помимо этого в Россию постоянно приходили вести об успешном исполнении произведений Глиэра, причём не только в Германии, но и в Америке. В Германии созданы такие значительные сочинения композитора, как Вторая симфония, Второй квартет, симфоническая поэма «Сирены» (за которую Глиэр был удостоен второй глинкинской премии) и начата работа над Третьей симфонией «Илья Муромец». Кроме интенсивного занятия композиторским творчеством Рейнгольд в Берлине в течение двух лет учился дирижированию у выдающегося дирижера Оскара Фрида. Живя в Германии, композитор с 1908 года стал увлекаться антропософией — оккультным учением, основоположником которого был доктор философии Р. Штейнер. Глиэр прослушал в Германии курс лекций и впоследствии более шести лет вместе с женой являлся членом различных антропософских групп и кружков, в состав которых входили люди искусства.
Триумфальное премьерное исполнение Третьей симфонии «Илья Муромец» состоялось в 1912 году, когда Глиэр уже вернулся на родину, в Киев. В следующем году композитор с удовольствием откликнулся на предложение занять должность профессора теоретических дисциплин и композиции в только что образованной консерватории в Киеве, а по истечении еще одного года стал ее ректором. Студентами композитора в Киевской консерватории были видные композиторы Л. Ревуцкий и Б. Лятошинский. В Киеве Глиэр дебютировал как дирижер. Его романсы вошли в репертуар именитых певцов, камерные сочинения исполнялись в концертных залах и на престижных собраниях музыкальной общественности. Известное музыкальное издательство «Юргенсон» печатало все произведения композитора, выходящие из-под его пера.
В Киеве же Рейнгольд Морицевич, пережив неоднократные смены власти и несколько раз только чудом спасшись от расстрела, встретил революцию. И непосредственно, органично влился в советскую музыкальную жизнь. Как младший представитель русской композиторской школы, ученик Танеева, Аренского, Ипполитова-Иванова. Как наследник традиций Глинки, Бородина, Глазунова, с которыми его роднит сходство в восприятии мира, предстающего у Глиэра светлым, гармоничным, цельным. «Передавать свои мрачные настроения в музыке считаю преступлением», — говорил композитор. Своей разносторонней деятельностью он осуществлял живую связь советской музыки с богатейшими традициями и художественным опытом прошлого.
Глиэр вернулся в Москву в 1920 году и сразу активно приступил к преподавательской деятельности. Он выполнял обязанности профессора по классу композиции в Московской консерватории и Гнесинском училище. В Москве развернулась многосторонняя просветительская деятельность Глиэра. Он возглавил организацию общедоступных концертов, взял шефство над детской колонией, где учил воспитанников хоровому пению, устраивал с ними спектакли или просто рассказывал сказки, импровизируя на рояле. Одновременно в течение ряда лет Глиэр руководил студенческими хоровыми кружками в Коммунистическом университете трудящихся Востока, что принесло ему как композитору немало ярких впечатлений. Педагогом он был замечательным — его обожали такие разные ученики, как А. Давиденко, А. Новиков, Н.Раков, Л. Книппер, Л. Половинкин, А. Хачатурян, Б. Александров, Н. Иванов — Радкевич, З. Компанеец, Г. Литинский, А. Мосолов. «Как-то так выходит», — писал Прокофьев, — «что кого из композиторов ни спросишь, он оказывается учеником Глиэра — или прямым, или внучатым».