Вернувшись в Америку после войны, Паттон продолжал командовать бронетанковым соединением, теперь получившим наименование 314-й танковой бригады. В течение следующих двух десятилетий Паттон продолжал пропагандировать бронетанковые войска. Однако в условиях Великой депрессии 30-х гг. трудно было вести исследования в этой области и производить танки.
Только после начала Второй мировой войны в Европе и успеха танкового «блицкрига» немцев американцы всерьез занялись созданием бронетанковых войск. В июле 1940 г. Паттон принял командование 1-й бронетанковой бригадой, которая к апрелю следующего года превратилась в 1-ю бронетанковую дивизию. С марта по июль 1942 г. Паттон, уже генерал-майор, руководил Центром военной подготовки на границе Калифорнии и Аризоны, где он организовал обучение танкистов и развивал американскую доктрину бронетанковой войны.
Паттон принимал участие в планировании высадки американских войск в Северной Африке, а также командовал Западными бронетанковыми силами. В марте 1943 г., после тяжелого поражения американцев в Кассерине, Паттон принял командование 11-м американским корпусом. Сменив ряд командиров и укрепив дисциплину, Паттон превратил деморализованное воинское соединение в боеспособную силу и сумел возобновить наступление, которое в конечном счете привело к поражению держав Оси в Северной Африке.
В июле 1943 г., во время вторжения союзников на Сицилию, Паттон командовал 7-й армией. Во время продвижения к Мессине, которую каждый из союзников стремился взять первым, напористый Паттон обошел более осторожных англичан, которыми командовал Монтгомери (№ 63), чем заработал популярность на родине, хотя и вызвал недовольство союзников. После победы на Сицилии Паттон начал посещать госпитали, оказывая внимание своим раненым солдатам. Большую известность получил инцидент, когда Паттон нанес побои двоим солдатам, которые не были ранены и лежали в госпитале с нервным переутомлением. При этом он обозвал их трусами за то, что те прибегли к медицинской помощи. В результате Паттон не получил высоких постов в оккупационных войсках на Сицилии и не сыграл никакой роли во вторжении на основную территорию Италии.
В январе 1944 г. Паттон был переведен в Англию и принял участие в подготовке высадки союзников в Нормандии. Так как Паттон был наказан за инцидент с рукоприкладством, он командовал в этот период только ложным соединением, которое было создано для того, чтобы немцы решили, что основной удар будет нанесен в Па-де-Кале, а не в Нормандии. Только через месяц после успешной высадки союзников в Нормандии Паттон стал командовать боевым соединением, а именно 3-й армией.
В это время Паттон снова показал себя одним из лучших военачальников. Начав наступление 1 августа, Паттон через две недели окружил немецкую группировку численностью около ста тысяч человек в Фале-Аржентан. К концу месяца он достиг Саара. Тактика Паттона строилась на мобильности и факторе внезапности. Его части атаковали немцев прежде, чем те успевали укрепить свою оборону и подготовиться, танки Паттона нередко продвигались быстрее, чем снабжалась его армия. Когда он считал необходимым, то требовал, а то и изымал боеприпасы у других частей. Случалось и так, что Паттон игнорировал приказы вышестоящих командиров, начиная атаку без поддержки резервных сил. В декабре он со своей 3-й армией начал наступление на Мец. Когда немцы внезапно предприняли контрнаступление в Арденнах, угрожая зайти союзникам в тыл, Паттон дал приказ своим войскам повернуть на девяносто градусов, чтобы освободить Бастон и остановить немецкое наступление. Это удалось Паттону, после чего он начал вторжение в Германию и 22 марта 1945 г. форсировал Рейн. Быстро продвигаясь вперед, 3-я армия беспощадно разрушала города и укрепления, которые отказывались сдаваться. В Руре Паттон окружил и разгромил крупную группировку немецких военных сил, после чего повернул в Баварию. К концу войны его армия достигла Чехословакии.
После победы Паттон, как всегда откровенный в своих высказываниях, заявил, что американцам следует немедленно начать военные действия против коммунистов, потому что рано или поздно этим все равно придется заняться. Это обстоятельство, а также терпимость Паттона по отношению к бывшим нацистам, которых он предлагал использовать для строительства новой Германии, вновь привели к потере Паттоном командных высот. Последней его должностью был сравнительно незначительный пост губернатора Баварии. 9 декабря 1945 г. шестидесятилетний Паттон попал в автомобильную катастрофу в районе Маннгейма и получил тяжелую травму. 21 декабря 1945 г. он умер от осложнений после травмы и был похоронен на американском кладбище в Люксембурге вместе с военными, погибшими в Европе во время Второй мировой войны.