Трудно сейчас объяснить, почему Бобро ошибся, но он нажал кнопку флюгирования винта левого двигателя и остановил его. Машина перешла в режим планирования. В наступившей тишине поверхность свинцового моря быстро приближалась. Почувствовав состояние Бобро, штурман Антонов предложил: «Командир, давай садиться без двигателей, опыт у нас уже есть». «Нет, попробуем еще!»- ответил тот и стал пытаться запустить левый АИ-20. Винт вышел на авторотацию, что резко увеличило сопротивление. Скорость упала. Панькин изо всех сил давил на левую педаль, парируя разворот, а штурвал полностью выбрал на себя, чтобы нос машины не врезался в воду. Но самолет как бы провалился, с большой силой ударился о воду, раскололся надвое и затонул. После нескольких попыток Панькину удалось открыть люк и всплыть. Перебайлов плавал рядом. Держась за торчащие из воды части самолета (глубина моря в этом месте небольшая), они дождались рыбацкого сейнера. Подобрав их и покружив у места гибели самолета еще минут тридцать, рыбаки не нашли других членов экипажа и ушли в Жданов.
Летчика-испытателя Бобро, штурмана Антонова и ведущего инженера Петроченкова хоронили всем заводом со всеми воинскими почестями.
Второй опытный Бе-12 (заводское обозначение «2Е»), несмотря на все усилия, построили только в сентябре 1962 г. На нем устранили выявленные при испытаниях первой машины недостатки. Помимо переноса на крыло двигателей, установили новые, более широкие брызгоотражатели, по согласованию с заказчиком отказались от палубной пушечной установки, расширили и обновили состав радиоэлектронного оборудования, придали крылу большую жесткость, что позволило убрать противофлаттерные грузы.
В состав нового заводского летного экипажа вошли: командир - ведущий летчик-испытатель Г.И.Бурьянов, второй пилот - И.И.Сапачев, штурман - В.М.Богач, радист - В.П.Перебайлов. В испытаниях на разных этапах участвовали заводские летчики Ю.М.Куприянов, М.И.Михайлов, Е.А.Лахмостов, Н.И.Андриевский, В.П.Демьяновский и др. Бригаду испытателей возглавил ведущий конструктор по испытаниям И.Г.Козельский.
В процессе доводок второй машины были повышены надежность и удобство эксплуатации самолета. В частности, по инициативе Куприянова хвостовое колесо сделали управляемым от педалей летчиков. Для компенсации реактивного момента винтов килевые шайбы развернули на 2°. Однако решены были не все проблемы. Так, мероприятия по снижению уровня шума в кабинах летчиков и штурмана, расположенных вблизи зоны вращения воздушных винтов, к сожалению, существенных результатов так и не дали.
Государственные испытания Бе-12 проходили без происшествий и завершились 20 апреля 1965 г. Ими руководил ведущий летчик Г.Г.Евтушенко. Привлекались и военные испытатели летчики и штурманы: полковники А.С.Сушко и Е.М.Никитин, подполковники А.Т.Захаров и В.В.Давыдов. При полетном весе 35 т противолодочный самолет-амфибия Бе-12 показал максимальную скорость 550 км/ч, практический потолок 12100 м, дальность полета 4000 км и мореходность до трех баллов.
Первый экземпляр Бе-12П
Бе-12П (RA-00073) во время тушения лесных пожаров в Иркутской области. На машине демонтирован магнитометр
Летающая лаборатория Бе-12П-200
Бе-12НХ на заводской стоянке в Таганроге
Бе-12 серийно производился на Таганрогском авиационном заводе №86 им. Г.М.Димитрова (ныне АО «Таганрогская авиация»). Первый серийный самолет был изготовлен 12 декабря 1963 г., а последний - примерно в июне 1973 г. Всего, кроме двух опытных самолетов, было построено 140 машин. В процессе серийного строительства в самолет вносились улучшения, расширяющие его возможности. Для предотвращения разрушения покрышек колес были установлены антиюзовые устройства. Уже на первых серийных машинах, помимо системы централизованной заправки на земле, устанавливалась система заправки на плаву. Эта система, специально разработанная для Бе-12, предварительно была испытана на Бе-6. Заправочный узел расположили в правой передней части фюзеляжа. С помощью троса, передаваемого с самолета на специально оборудованный надводный или подводный танкер, к амфибии бортовой лебедкой подтягивался шланг-буксир, который герметично стыковался с приемным устройством. После перекачки топлива он отсоединялся от троса и выходил из приемного устройства. Весь процесс, начиная с подтяга шланга-буксира, был полностью механизирован.