Покинув место сражения, цинская эскадра под фактическим командованием Е Цзугуя взяла курс на Люйшунькоу, куда и прибыла утром 18 сентября. Ее появлению предшествовало бегство бронепалубного крейсера "Цзиюань", командир которого Фан Боцянь принес на базу известие о тяжелых потерях Бэйянского флота. Появление сильно поредевшей эскадры оказало тяжелое впечатление на гарнизон базы. После сражения значительная часть личного состава сильно пала духом, хотя многие офицеры и матросы, увидев, на что способны, горели желанием отомстить за гибель своих товарищей. Корабли встали на ремонт в доке Люйшунькоу, стремясь как можно скорее исправить полученные в ходе боя повреждения.
Корабли Бэйянского флота в Люйшунькоу после боя при Ялу. В центре - ремонтирующийся "Чжэньюань", справа - броненосный крейсер "Лайюань", слева виден нос крейсера "Цзинъюань", в доке - труба и мачта броненосца "Динъюань"; на переднем плане - два миноносца германской постройки. Рисунок сделан офицером британского крейсера "Линдер", посетившего Порт-Артур 23-24 сентября 1894 г.
Демонтаж носовой 150-мм установки "Чжэньюаня" во время ремонта в Люйшунькоу (рисунок)
Дин Жучан планировал дать еще одно сражение японцам в пределах досягаемости орудий береговых батарей Люшунькоу. Однако командовать этим боем пришлось бы Лю Бучаню - приказом от 21 сентября 1894 г. он был назначен временным командующим Бэйянским флотом. По его приказу экипажи кораблей с 4 октября вышли на работы для того, чтобы помочь ремонтникам как можно быстрее устранить неисправности. 18 октября они в основном были завершены, и Лю Бучань вышел во главе эскадры по направлению к Вэйхайвэю.
Остов броненосца "Динъюань" после взрыва
Уцелевшие корабли Бэйянского флота в гавани Вэйхайвэя, февраль 1895 г.
25 октября два японских корабля приблизились к северному выходу из бухты Вэйхайвэя, и Лю Бучань вывел броненосцы обстрелять противника. Японцы бежали, не приняв боя.
29 октября броненосцы вышли в море и некоторое время провели в Люйшунькоу и Вэйхайвэе. 6 ноября ими был получен приказ прервать линии сообщения японцев. Утром 8 ноября корабли вернулись в Вэйхайвэй, чтобы пополнить запасы. Бесплодное маневрирование в Желтом море продолжалось до 10 ноября, когда броненосцы прибыли на рейд Дагу, после чего поспешили обратно в Вэйхайвэй. Обращает на себя внимание странность в действиях Лю Бучаня - вместо того, чтобы помешать японской 2-й армии высадиться на Ляодунском полуострове, он во главе мощнейших кораблей флота ходил в треугольнике Люйшунькоу-Дагу-Вэйхайвэй, не предпринимая активных действий, несмотря на полученный приказ прервать линии сообщения японских войск.
12 ноября броненосцы вновь вышли по направлению к Люйшунькоу, к которому приближались японские войска, но опять не оказали своей главной ремонтной базе никакой поддержки, а ретировались в гавань Вэйхайвэя. В Китае ходили слухи, что на этот раз моряки хотели дать решительный бой японцам, но Ли Хунчжан, беспокоясь за сохранность своих кораблей, категорически запретил Лю Бучаню вступать в бой. Эта версия нашла отражение в ряде работ цинских историков - Яо Сигуана, Цай Эркана и других, но насколько она обоснована, мы не можем уверенно судить в настоящий момент.
Этот выход в море оказался последним -14 ноября при входе в Вэйхайвэй "Чжэньюань" задел днищем скалу и получил пробоину. Заделать не месте ее не смогли и броненосец потерял боеспособность - с временным пластырем и постоянно работающими водоотливными насосами он мог исполнять роль плавучей батареи в акватории Вэйхайвэя, но не более того. Тем временем случилась катастрофа - 21 ноября японцы взяли Люйшунькоу открытым штурмом. После падения этой базы, вследствие отсутствия у китайцев необходимых ремонтных мощностей в Вэйхайвэе, флот потерял боеспособность до конца войны.
Дин Жучан, вновь принявший командование над Бэйянским флотом, рассчитывал получить у правительства одобрение своего плана - взорвать укрепления Вэйхайвэя, увести оставшиеся корабли в Шанхай, отремонтировать там "Чжэньюань" и, соединившись с кораблями южных флотилий, дать бой японцам. Однако этому воспротивились и министры, и Ли Хунчжан, уже неоднократно с начала войны обвиненный в трусости и неумении руководить военными действиями. Дин Жучан был разжалован, его дело было направлено в суд, но в военных условиях его оставили исполнять обязанности командующего флотом до конца войны - по результату военных действий суд должен был или обвинить, или оправдать его. В самом Вэйхайвэе действовала правительственная комиссия, проверявшая соответствие флотских офицеров занимаемой должности. Это также не вносило успокоения среди личного состава. Командир броненосца "Чжэньюань" Линь Тайцэн, тяжело переживая повреждения своего корабля и осознавая, что корабль стал небоеспособным по его вине, застрелился (по версии Чжао Эрсюня - утопился), командование над броненосцем принял его первый помощник Ян Юнлинь.