Как и на аналогичных объектах, связанных с реализацией атомного проекта, в гарнизоне осуществлялся строгий отбор кадров, были ограждены служебная и жилая зоны с введением особого пропускного режима. В первые годы действовали ограничения по переписке, проживанию членов семей как в гарнизоне, так и близлежащих поселках и г. Керчи.
Структура полигона
Основные подразделения полигона: штаб; летно-испытательная часть в составе трех авиационных полков и непосредственно связанная с ней инженерно-авиационная служба; научно-испытательная часть с ее лабораториями и испытательными отделами; службы тылового обеспечения.
В летно-испытательную часть входили три авиационных полка: 35-й бомбардировочный, 513-й истребительный и 647-й смешанный авиационный специального обеспечения.
Летную работу полигона возглавлял полковник Сутягин Н.Г. (впоследствии генерал-майор); после его увольнения из Вооруженных Сил — генерал-майор Шапошников А.И. и полковник Воскресенский М.Г. Штурманская подготовка экипажей самолетов возлагалась на полковника Пульченко В.И., полковника Горчинского П.П. Этими службами планировалась и обеспечивалась подготовка летных экипажей мастерству пилотирования самолетов и бомбометанию в особых условиях, отработке точности воздушных стрельб, а также по освоению работы со специальным и испытательным оборудованием самолетов.
В состав 35-го бомбардировочного авиационного полка (БАП) входило несколько типов самолетов. Вначале полк формировался на базе самолетов Ту-4, а затем в него поступали самолеты Ту-16, Ту-95, ЗМ, Ил-28, Бе-12, Су-7Б. Поступавшие в полк самолеты, как правило, отличались от штатных дополнительным специальным и испытательным оборудованием. Такие самолеты подвергались соответствующим испытаниям и по результатам аттестования в последующем использовались для обеспечения ядерных испытаний в качестве самолетов-носителей и самолетов-лабораторий. Самолеты Ту-4, Ту-16, Ил-28 и Су-7Б на различных этапах применялись в качестве самолетов-носителей при воздушных ядерных испытаниях на Семипалатинском полигоне, а Ту-16, Ту-95 и ЗМ — при испытаниях на полигоне о-ва Новая Земля. Самолет Бе-12 отрабатывался и проходил испытания как носитель противолодочного ядерного оружия без привлечения к натурным ядерным испытаниям.
Командирами 35-го БАП были подполковник Муравьев Г.Н., подполковник Жданов Я.И., подполковник Подбегалин Г.П., подполковник Куннов И.Д., полковник Перышков Н.Г. Из руководства полигона и 35-го БАП генерал-майор авиации Шапошников А.И., полковник Воскресенский М.Г., подполковник Дударев А.Г., полковник Попов А.В., подполковник Подбегалин Г.П., подполковник Куннов И.Д. и полковник Перышков Н.Г. непосредственно выполняли полеты на самолетах-носителях с бомбами при воздушных ядерных испытаниях.
На вооружении 513-го истребительного авиационного полка (ИАП) были самолеты-истребители Ла-9, МиГ-15, а затем МиГ-17 для выполнения задач по сопровождению и охране самолетов-носителей при полетах с изделиями на базе 71-го полигона ВВС, а также на полигоне УП-2 МО при полетах самолетов-носителей с испытываемыми образцами ядерного оружия. Задачи для истребителей были регламентированы очень строго. При выполнении полетов самолеты-истребители снаряжались полным боекомплектом стрелково-пушечного вооружения. Им предписывалось применять это оружие вплоть до поражения для предотвращения умышленных уходов самолетов-носителей за пределы оговоренных заданием зон. Командовал 513-м ИАП полковник Кравцов В.В., а затем полковник Кукуня И.И.