Основной причиной такого положения является резкое снижение ассигнований на ВМФ: с 1990 года объем государственного заказа сократился более чем в 20 раз. Доля ВМФ в общем объеме бюджетного финансирования Министерства обороны снизилась с 23 % в 1993 году до 9,2 % в 1998 году. При этом около 70 % выделенных средств расходуется на содержание ВМФ, а доля финансирования закупок и развития вооружения ВМФ на 1999 год составляет лишь 11 % и 12 % соответственно (реально же выделено 5 % и 6 % от назначенных объемов). Следствием такого финансирования стало резкое ухудшение количественных и качественных показателей сил флота, уход из важных стратегических зон Мирового океана и прекращение несения боевой службы эскадрами и соединениями боевых кораблей (ликвидированы Средиземноморская, Индийская и Тихоокеанская эскадры). Морская авиация прекратила полеты в океанах, лишившись аэродромной сети на Кубе, Ближнем Востоке, в Африке и других районах. Все это привело к утрате влияния России в оперативно важных морских районах и присутствия в горячих точках для оказания поддержки дружественным государствам; нанесен ущерб престижу России как великой морской державе.
Анализ состояния ВМФ показывает, что с 1990 года общее количество кораблей уменьшилось в 1,6 раза (с 428 до 273), количество кораблей на боевой службе сократилось в 7,5 раза (с 210 до 28). Численность личного состава ВМФ сократилась в 2,5 раза (с 424 до 169 тыс. человек). Особенно тяжелое положение сложилось с вводом новых кораблей в боевой состав ВМФ. Уровень ежегодного финансирования строящихся кораблей составляет не более 3–5% их стоимости (необходимо не менее 25 %). Как следствие — недопустимо низкие темпы и удорожание строительства кораблей.
Нарастает процесс старения флота. Доля кораблей со сроком службы пятнадцать и более лет составляет около 55 %. Увеличивается количество ограниченно боеспособных кораблей и судов с просроченными межремонтными сроками. Так, сейчас этот показатель для боевых кораблей составляет более 50 %, а для вспомогательных судов — 70 %. Морская авиация имеет 60 % самолетов с просроченными сроками ремонта. Остро стоит вопрос о незавершенном строительстве кораблей и судов, исключенных из государственного оборонного заказа. На стапелях находятся 51 надводный корабль и 9 подводных лодок, строительство которых приостановлено по причине отсутствия финансирования.
Прогноз показывает, что при сохранении существующего финансирования к 2015 году в составе ВМФ России сохранится не более 60 кораблей (22 атомные и 9 дизельных подводных лодок, 29 надводных кораблей).
Это повлечет за собой полную утрату ВМФ способности решать поставленные задачи на морских направлениях. Утрата флотом возможности защищать жизненно важные интересы России в Мировом океане будет иметь катастрофические последствия для национальной безопасности России.
С позиции современной геополитики основные противоречия в области национальных интересов различных стран в
XXI веке во многом будут определяться глобальными для человечества проблемами, и прежде всего перенаселением Земли, что обострит проблемы энергетики, экологии, продовольствия, минеральных, топливно-энергетических и биологических ресурсов, пресной воды и др.
Растущие потребности человеческого общества приводят к быстрому истощению ресурсов на континентах и естественному продвижению стран мира к освоению богатейших ресурсов Мирового океана. В настоящее время более 20 % разведанных мировых запасов нефти и газа находятся на акваториях морей.
Поэтому существующие реальные угрозы национальным интересам России в Мировом океане (во внутренних водах, территориальных морях, исключительной экономической зоне на континентальном шельфе) являются очень опасными и при определенных условиях могут привести к локальным войнам и вооруженным конфликтам, способным нанести существенный ущерб экономическому и военному потенциалу Российской Федерации.
События последнего десятилетия резко изменили геополитическую расстановку сил в области мировой морской деятельности, создав реальную угрозу национальной безопасности России:
Ё ограничение выхода ее к ресурсам и пространствам Мирового океана, магистральным морским международным коммуникациям, особенно в Балтийском и Черном морях;