Еще одной проблемой Саддама — были коммунисты.
Иракская коммунистическая партия была на тот момент болеем многочисленна, чем БААС и лучше организована. У иракских коммунистов была не в пример лучше разработанная идеологическая доктрина, они опирались на авторитет сверхдержавы — СССР. У них было немало сторонников среди городской бедноты, а так же среди рядового и младшего офицерского состава армии. Были у них и боевые группы — а вот того негативного шлейфа межпартийных разборок, какой тянулся за БААС — у них не было. Репрессии против коммунистов — были встречены налетами на первички БААС, а в один из дней 1969 года — ночью был обстрелян дом Саддама, где жила его семья. Заместитель председателя СРК ответил огнем и мечом: 23 марта 1970 года видного коммунистического лидера Мухаммеда Ахмеда аль-Хадри нашли мертвым на улице в Багдаде, что возвестило новую волну арестов, пыток и казней коммунистов. Они продолжались весь год и вышли далеко за пределы Багдада
Одновременно с этим, связка Бакр-Саддам (они в тот момент всегда действовали вместе) — решила предложить коммунистам пряник. Пока Саддам действовал как злой следователь — Бакр пригласил коммунистов к себе, разрешил публикацию их журнала и даже назначил коммуниста Азиза Шерифа министром юстиции. Однако, гонения на коммунистов никогда не прекращались и коммунисты уходили во все более глубокое подполье. Проблему коммунистов — Саддаму не удастся решить никогда, а после сближения с СССР — она станет еще острее.
Одновременно с этим, Бакр и Саддам начали борьбу за единоличную власть в партии БААС. Теперь — их не устраивала военная группировка в партии, даже баассистская. Дело было в том, что у военных, принадлежащих к партии БААС — был изначально и военный и политический ресурс, у Саддама и Бакра — только политический. Их это не устраивало.
Двумя ключевыми фигурами в военной группировке БААС были Хардан аль-Тикрити и Салих Махли Аммаш, у них обоих были выдающиеся заслуги перед партией и много сторонников как внутри партии, так и среди военных. Хардан занимал пост командующего ВВС Ирака во время короткого правления Баас в 1963 году, став начальником штаба, министром обороны и заместителем премьера в 1968, когда партия вернулась во власть. Высокомерный, безжалостный человек, огромного роста и с безграничным честолюбием, он внушал Саддаму антипатию и страх. Саддам знал, что их общее происхождение из Тикрита не спасет его, если Хардан станет чересчур могущественным. Со своей стороны, Аммаш, хоть и не такой жестокий, как Хардан, был столь же честолюбив, и Саддам боялся его как одного из старейших членов партии. Вступив в Баас в начале 1950-х годов, он приблизился к Бакру, и они вместе возглавили центристскую фракцию Баас. Вслед за «Июльскими революциями» 1968 года Аммаш занял влиятельный пост министра внутренних дел и заместителя премьера вместе с Харданом, и, кроме того, он был членом Регионального и Национального управлений партии, а также СРК.
Саддам развернул игру сразу в нескольких направлениях. Во-первых — он начал говорить Бакру о том, что Аль-Тикрити претендует на пост президента. Во вторых — он попытался столкнуть Аммаша и аль-Тикрити лбами меж собой. В третьих — он пообещал двум другим членам военной группировки — Шихабу и Гайдану — посты Аммаша и аль-Тикрити, если они выступят против них.
Игра против Аммаша и аль-Тикрити — велась в несколько этапов. Сначала — упразднили посты заместителей премьера и теперь они не могли присутствовать на заседаниях правительства. Затем — обоих сделали вице-президентами, но при этом оторвали от прежних постов, дававших реальные возможности. Шихаб заменил Хардана в качестве министра обороны, а Гайдан стал министром внутренних дел вместо Аммаша.
Окончательное падение было лишь вопросом времени. Час Хардана пробил в октябре 1970 года. Его убрали за «Черный сентябрь» — не имеющее к нему совершенно никакого отношения массовое убийство палестинцев в Иордании, когда король после очередного заговора палестинцев приказал черкесской гвардии перебить всех палестинцев, а лагеря беженцев сравнять с землей. Хардана обвинили в том, что он никак не помог палестинцам — хотя как он мог им помочь, было совершенно непонятно. Хардан узнал об этой новости в Мадриде. Саддам — приготовил ему утешительный приз — назначение послом — но он отказался и вернулся в Ирак, чтобы разобраться. В Багдаде — с ним даже никто и не встретился, его пересадили на другой самолет и отправили в Алжир. Через год — его убьют.