15.01.1942 г. он пришел на о. Т рук и 18.01.1942 г. вышел в море для обеспечения высадки в Кавиенг и Рабаул. 30.01.1942 г. КР пришел в Рабаул. С 2-го по 4.02.1942 г. корабль перешел в Малоелап, а 6.02.1942 г. бросил якорь на атолле Кваджелейн. 10.02.1942 г. Аоба возвратился на атолл Трук, где до марта 1942 г. провели текущий ремонт корпуса и механизмов. С 2-го по 5.03.1942 г. он во главе 6-й ДКР совершил переход в Рабаул, откуда обеспечивал высадку в Лаэ и Саламауа (о. Новая Гвинея), на о-ва Бука (10.03.1942 г.), Бугенвиль, Шортленд (29.03.1942 г., Соломоновы о-ва) и на Манус (8.04.1942 г., о-ва Адмиралтейства).
10.04.1942 г. корабль возвратился на Трук, где возглавил Соединение поддержки Сил вторжения в Порт-Морсби (Группу прикрытия) контр-адмирала Гото. 1.05.1942 г. соединение Гото (6-я ДКР и 2 ЭМ) вышло в море с АВ Сехо, который в районе между о- вами Вудларк и Рассел должен был отвлечь на себя возможные удары американской авиации и осуществить поиск противника. 7.05.1942 г. Сехо был потоплен, и 6-я ДКР перешла в район о. Бугенвиль, где продолжила крейсерство. После навигационной аварии Како у о. Бука, Аоба находился в его охранении. 16.05.1942 г. он вернулся на Трук. С 17-го по 22.05.1942 г. КР перешел в Куре, где на верфи флота провели текущий ремонт корпуса и механизмов (в доке с 25-го по 29.05.1942 г.). 16.06.1942 г. корабль вышел в море и 23.06.1942 г. прибыл на атолл Трук. С 30.06 по 5.07.1942 г. Аоба перешел в Киета, а 6.07.1942 г. направился к о. Сан-Изабель, где простоял с 7-го по 15.07.1942 г., затем перешел в Кавиенг, с заходом в Рабаул (22.07.1942 г.). В Кавиенге он находился с 26.07 по 7.08.1942 г. В июле 1942 г. 6-ю ДКР передали в распоряжение командующего Восьмым флотом. В начале августа 1942 г. ГСМ тип 94 заменили на ГСМ тип 0 мод. 11 (Е13А1). 9.08.1942 г. КР принимал участие в бою у о. Саво, в ходе которого его бортовые ГСМ сбрасывали над противником осветительные бомбы и корректировали огонь кораблей своего соединения. Совместно с Како, Кинугаса и Чокай, он потопил австралийский ТКР Canberra, американские ТКР Astoria и Quncy. Кроме того, был поврежден американский ТКР Chicago. В ТА левого борта Аоба попал тяжелый снаряд, взрыв которого вызвал пожар, с которым экипаж через час справился. В ходе сражения корабль выпустил 182 203.2- мм снаряда и 13 торпед. 11.08.1942 г. 6-я ДКР возвратилась в Кавиенг и 20.08.1942 г. перешла к о. Шортленд. 23.08.1942 г. она вышла в море в составе Соединения Огневой поддержки (Группы прикрытия) вице-адмирала Микава для обеспечения перехода к Гуадалканалу крупного КОН. 25.08.1942 г. оба бортовых ГСМ Аоба принимали участие в налете на аэродром Хендерсон. 26.08.1942 г. КР пришел в Рабаул, принял топливо, пополнил запасы и затем перешел к о. Шортленд. 11.10.1942 г. он во главе соединения контр-адмирала Гото вышел в море для обеспечения перехода к о. Гуадалканал крупного КОН и обстрела аэродрома Хендерсон. На подходе к острову отряд японских кораблей был обнаружен американским ОС 64.2 (2 ТКР, 2 ЛКР и 5 ЭМ). В ходе последовавшего боя, известного как бой у мыса Эсперанс, Аоба получил около 24 попаданий 152- и 203-мм снарядов. В результате были разрушены две башни 203.2- мм орудий (№ 3 полностью выгорела), носовое 120-мм орудие левого борта, один из прожекторов, катапульта, четыре котла и фок-мачта, упавшая на носовое 120-мм орудие правого борта. Кроме того, большие повреждения получила носовая надстройка, погибло 79 чел., в т.ч. контр-адмирал Гото. Артиллерийским огнем Аоба потопил американский ЭМ Duncan, тяжело повредил КР Boise и добился нескольких попаданий в КР Salt Lake City. 12.10.1942 г. КР своим ходом возвратился на о. Шортленд, где заделали пробоину, и 13.10.1942 г. он направился к атоллу Трук, где с 15-го по 18.10.1942 г. выгрузили боезапас и пополнили запасы топлива. 18.10.1942 г. корабль посетил командующий Объединенным флотом адмирал Ямамото. 22.10.1942 г. Аоба пришел в Куре. С 24.10.1942 г. по 15.02.1943 г. на верфи флота демонтировали кормовую башню 203,2-мм орудий, ее барбет сверху зашили 25-мм броневой плитой, на которую установили три (1 х 3) 25-мм зенитных автомата; на платформе носовой надстройки 13,2-мм пулеметы заменили на три (1 х 3) 25-мм зенитных автомата; установили новую фок-мачту и усовершенствовали систему управления зенитным огнем, соответствующим образом переделав надстройки. После окончания ремонта Аоба вновь передали в распоряжение командующего Восьмым флотом, и 20.02.1943 г. он пришел на атолл Трук. 28.02.1943 г. КР направился в Кавиенг с заходом в Рабаул (2.03.1943 г.). 3.03.1943 г. в Кавиенге корабль атаковали американские бомбардировщики базовой авиации, впервые применившие метод топ-мачтового бомбометания. 227-кг бомба попала в правый борт КР, в районе ТА. Ее взрыв вызвал детонацию торпед. В результате МО правого борта и бортовой буль заполнились водой, возник пожар. Благодаря помощи ЭМ Хацуцуки, поврежденный Аоба удалось отбуксировать к отмели, что позволило удержать его на плаву, несмотря на заполнившуюся водой корму. Пожар вскоре удалось потушить. С 4-го по 20.04.1943 г. из КР откачали воду и восстановили положительную плавучесть. С 21-го по 25.04.1943 г. на буксире Сендай корабль перешел на атолл Трук, где до 25.07.1943 г. провели работы по герметизации корпуса и восстановили работоспособность главных механизмов. Затем Аоба направился в Куре, где с 1.08 по 24.11.1943 г. на верфи флота провели восстановительный ремонт корпуса и механизмов; установили кормовую башню 203,2-мм орудий и РЛС тип 21 мод. 2; до 15 (1 х 3; 6 х 2) увеличили число 25-мм зенитных автоматов; вместо двух бортовых 110-см прожекторов установили один в ДП (на месте кормового прицельного визира тип 94) и заварили большинство иллюминаторов. 25.11.1943 г. Аоба передали в распоряжение командующему Южным Экспедиционным флотом (или Флотом Юго-Западного района). 15.12.1943 г. он вышел из Куре и направился в Сингапур с заходом в Манилу (20 - 21.12.1943 г.). В Сингапуре корабль простоял с 24.12.1943 г. по 27.02.1944 г., не считая перевозки армейских частей в Пенанг в период с 3-го по 9.01.1944 г. В конце февраля 1944 г. он вошел в состав 16-й ДКР. В марте 1944 г. Аоба доставил армейские части на Яву и Филиппины, с 2-го по 14.04.1944 г. перевозил различные грузы в Баликпапан (4.04.1944 г.) и Таракан (9.04.1944 г.). 20.04.1944 г. с грузом продовольствия он направился в Давао и 23.04.1944 г. подобрал из воды остатки экипажа погибшего на минах ЭМ Амагири. 27.04.1944 г. КР прибыл в Давао и 28.04.1944 г. направился к о. Таракан, где простоял с 29.04 по 13.05.1944 г. Затем, базируясь на о. Таракан, он совершил транспортные рейсы в Давао (14 -19.05.1944 г.) и Соронг (20 - 24.05.1944 г.). 30.05.1944 г. на Аоба поднял флаг контр-адмирал Саконджу, руководивший операцией по доставке подкреплений на о. Биак (у Новой Гвинеи). Она проводилась в период с 31.05 по 9 (по другим данным 10).06.1944 г. и закончилась неудачей из-за противодействия американских КР и ЭМ.