9 июля 1998 года Президент утвердил своим Указом Положение о Федеральной службе безопасности Российской Федерации. С 1 января 1999 г. определена штатная численность военнослужащих центрального аппарата ФСБ в количестве 4000 человек.
15 июля 1998 года В.В. Путин возглавил комиссию при Президенте РФ по подготовке договоров о разграничении предметов ведения и полномочий между федеральными органами государственной власти и органами власти субъектов Российской Федерации.
17 июля 1998 года в Петербурге состоялось захоронение останков императора Николая II, членов его семьи и близких (некоторые сомневаются в точности идентификации останков). На церемонии выступил Б. Ельцин. Он сказал: «Долгие годы мы замалчивали это чудовищное преступление. Но надо сказать правду: расправа в Екатеринбурге стала одной из самых постыдных страниц в нашей истории… Виновны те, кто совершил это злодеяние, и те, кто его десятилетиями оправдывал… Нельзя лгать себе, объясняя бессмысленную жестокость политическими целями. С именем Романовых связаны многие славные страницы истории Отечества, но с этим именем связан и один из её самых горьких уроков: любые попытки изменить жизнь путём насилия обречены. Мы обязаны завершить век, который стал для России веком крови и беззакония, покаянием и примирением».
23 июля 1998 года Президент России Борис Ельцин назначил председателя комитета Госдумы по экономической политике коммуниста Юрия Маслюкова министром промышленности и торговли. В СССР Маслюков занимал руководящие посты в КПСС, возглавлял государственный плановый комитет.
24 июля 1998 года Ю. Лужков создал свой предвыборный блок. Его условное название «Единство». Объединились в эту коалицию движение «Держава» Александра Руцкого, «Конгресс русских общин» Дмитрия Рогозина, «Демократическая партий России» Сергея Глазьева, «Российский общенародный союз» Сергея Бабурина, «Союз народовластия и труда» генерала Николаева, «Социалистическая народная партия» Мартина Шаккума, «Союз реалистов» Юрия Петрова. Теперь КПРФ и аграриям придётся конкурировать с новым блоком.
26 июля 1998 года Президент России Б. Ельцин подписал указ об освобождении от должности директора ФСБ Н. Ковалёва в связи с переходом на другую работу. Другим указом директором ФСБ с освобождением от ранее занимаемой должности первого заместителя главы администрации президента РФ назначен В. Путин.
27 июля 1998 года в Госдуме состоялись открытые слушания депутатской комиссии по отрешению Б. Ельцина от должности. В роли обвинителей выступили председатели думских Комитетов по безопасности и законодательству Виктор Илюхин и Анатолий Лукьянов. Они сошлись в том, что подписание Беловежских соглашений президентом РСФСР Б. Ельциным «незаконно». Вместе с тем после четырехчасового обсуждения участия Б. Ельцина в подписании Беловежских соглашений депутаты не пришли к окончательному решению.
2 августа 1998 года Борис Ельцин подписал документ «Основы (Концепция) государственной политики по военному строительству на период до 2005 года». Это означает, что российское государство на седьмой год существования наконец решило, что оно хочет от своих военных. Именно этот документ станет основой дальнейших преобразований всей военной организации страны.
14 августа 1998 года Президиум Народно-патриотического союза России высказался за активизацию деятельности спецкомиссии Думы по оценке соблюдения процедурных правил и фактической обоснованности обвинения, выдвинутого против президента.
14 августа 1998 года Борис Ельцин считал противоречащим Конституции положение нового законопроекта о том, что вопросы досрочного прекращения или продления срока полномочий главы государства, проведения досрочных выборов президента или их отсрочки могут быть вынесены на референдум. Такое мнение содержится в заключении, направленном президентом спикеру Госдумы Геннадию Селезнев у на проект федерального закона о внесении изменений в закон «О референдуме РФ». Ельцин подчеркнул, что Конституция однозначно определяет срок полномочий президента.
23 августа 1998 года Президент РФ своим указом отправил правительство России в отставку. Временное исполнение обязанностей до утверждения его кандидатуры Госдумой возложено на В. Черномырдина.
25 августа 1998 года Государственная дума приняла специальное постановление, которым рекомендовало Б. Ельцину добровольно уйти в отставку досрочно. За постановление проголосовало 245 депутатов, т.е. больше половины, «против» — всего 32.
26 августа 1998 года Президиум оппозиционного Народно-патриотического союза (НПСР) подтвердил основные требования объединённого блока народно-патриотических сил: отставка президента РФ, смена проводимого курса и формирование дееспособного правительства. Об этом заявили по окончании заседания президиума лидер КПРФ Геннадий Зюганов, лидер депутатской группы «Народовластие» Николай Рыжков, лидеры российских аграриев Николай Харитонов и Михаил Лапшин, а также депутат Госдумы Алексей Подберезкин. Они сообщили, что президиум НПСР рассмотрит документы, разрабатываемые сейчас в Госдуме — концепцию экономического развития и политическое соглашение исполнительной и законодательной ветвей власти. Лидеры оппозиции высказались за устранение существующего сейчас, по их мнению, «двоевластия и параллелизма в принятии решений президентом и правительством». В предварительном порядке были рассмотрены заявления свыше 10 партий и движений, которые намерены войти в состав НПСР. В их числе: движение «Союз народовластия и труда», возглавляемое депутатом Госдумы Андреем Николаевым, Союз реалистов, Земский собор и другие.
26 августа 1998 года Борис Ельцин подписал указ о новых кадровых назначениях в Федеральной службе безопасности России. Первым заместителем директора назначен начальник управления ФСБ по Санкт-Петербургу и Ленинградской области генерал-лейтенант Виктор Черкесов, начальником департамента по борьбе с терроризмом — генерал-лейтенант Владимир Проничев, начальником департамента экономической безопасности — генерал-лейтенант Александр Григорьев, начальником департамента анализа, прогноза и стратегического планирования — генерал-майор Сергей Иванов. Свои посты сохранили первый заместитель директора ФСБ генерал-полковник Валентин Соболев и начальник департамента контрразведки генерал-полковник Валерий Печёнкин. Эксперты однозначно расценивали указанные перестановки на Лубянке как укрепление позиций руководителя ФСБ Владимира Путина.
1-2 сентября 1998 года в Москву приехал президент США Билл Клинтон. Президент США устроил приём в резиденции американского посла в Москве, на который были приглашены влиятельные государственные и политические деятели.
11 сентября 1998 года Государственная Дума одобрила предложенную президентом кандидатуру Евгения Примакова на пост премьер-министра. За него проголосовало 315 депутатов, против — 63, воздержалось — 15.
14 сентября 1998 года Президент РФ подписал Указ о назначении Николая Бордюжи секретарём Совета безопасности РФ. До этого назначения Н. Бордюжа занимал должность директора Федеральной пограничной службы.
14 сентября 1998 года Генеральная прокуратура России возбудила уголовное дело в отношении бывшего мэра Санкт-Петербурга А. Собчака». Дело было связано с махинациями строительной фирмы «Ренессанс», которой покровительствовал.