Во второй половине дня японцы повторили налет, имея целью добить «Хорнет». С «Дзюнё» и «Дзуйкаку» вылетело 14 B5N2, несущих 800-кг бомбы, а также 2 D3A1 и 13 А6М2. Налет начался в 15:40. Только одна бомба попала в цель, но этого оказалось достаточно. Капитан авианосца, командор Мэнсон приказал команде покинуть корабль. Горящий авианосец еще долго держался на плаву и ушел под воду лишь поздней ночью. Бой закончился. Японцы потеряли 95 самолетов и имели два поврежденных авианосца: «Сёкаку» и «Дзуйхо». Американцы потеряли «Хорнет».
Битва при Санта-Крузе стала последней операцией, в которой участвовали D3A1. Вскоре в боевые части стала поступать новая модификация этого самолета D3A2 Model 22, однако в начале 1943 года этот самолет уже окончательно устарел. Большинство пикировщиков этого типа базировалось на сухопутных аэродромах, а роль палубного пикировщика стал исполнять D4Y «Judy». Лишь несколько D3A2 осталось в составе авиагрупп на малых авианосцах. B5N2 также уступили место новому самолету, которым стал Nakajima B6N «Tenzan». Оставшиеся B5N2 также перевели в части, базирующиеся на суше. Но на этом карьера обоих типов самолетов не закончилась.
В первых числах февраля 1943 года началась эвакуация японских войск с Гуадалканала. Прикрывали отступление самолеты с авианосцев 1-го дивизиона, действуя с наземного аэродрома. На Соломоновых островах американцы держали крупные силы авиации, в задачу которых входило прикрывать морские конвои. Лишь по возможности американские самолеты наносили удары по японцам. Но этими возможностями американцы пользовались по полной программе. Перегруженные пехотой японские транспорты то и дело получали прямое попадание бомбой или обстреливались из пулеметов. Японцы не оставались в долгу. Уже 1 февраля 1943 года 15 D3A2 из 582-го кокутая атаковали американские корабли в районе острова Саво. Японцам удалось отправить на дно эсминец «Де Хевен», потеряв при этом пять пикировщиков. Следующий налет японцы провели через три дня. В налете участвовали 10 D3A2 из той же части. На этот раз японцы потеряли шесть машин, а результат налета оказался минимальным. 8 февраля 1943 года эвакуация японских войск с Гуадалканала была закончена.
Оставив Гуадалканал, японцы не собирались переходить в глухую оборону. 1 апреля началась операция «Иго», которая охватила Соломоновы острова и Новую Гвинею. Поддержку с воздуха обеспечивали самолеты 21-го и 26-го кокусентаев, базировавшиеся в Рабауле, а также самолеты из авиагруппы 1 — го и 2-го дивизиона авианосцев (в том числе 65 D3A2 и 5 B5N2). 7 апреля группа из 67 D5A2 из 582-го кокутая, а также с авианосцев «Дзюнё» и «Дзуйкаку» совершила налет на аэродромы Рассел и Тулаги, а также перехватила конвой, шедший восточнее Гуадалканала. Самолеты действовали в трех группах, каждая группа имела свою цель. Истребительное прикрытие состояло из 157 А6М2. Несмотря на сильное сопротивление со стороны противника, группа, шедшая на Тулаги, достигла цели и нанесла удар по порту, в котором находилось под заправкой несколько транспортных судов и небольших кораблей. Удалось потопить эсминец, новозеландский корвет, а также серьезно повредить танкер «Канахава». Дым горящего топлива затянул всю акваторию порта и не дал остальным бомбардировщикам прицельно сбросить бомбы. В районе порта японцы потеряли девять D3A2 и 12 истребителей. Американцы потеряли семь самолетов. Вернувшись в Рабаул, японские летчики доложили об уничтожении по меньшей мере 26 кораблей противника (в том числе крейсера) и 41 самолета! Это была чистейшей воды фикция. Тем не менее, налет можно признать успешным. 11 апреля японцы совершили новый налет. В налете участвовал 21 D3A2 и 71 истребитель. Атаке подвергся конвой в заливе Оро на Новой Гвинее. Потеряв четыре пикировщика и два истребителя, японцы потопили два транспорта. Последней операцией с участием D3A2 в рамках плана «И-го» стал налет 14 апреля, когда 44 D3A2 и 75 G4M1 «Betty» в сопровождении 129 А6М2 совершили налет на залив Милна. Но в этот день в заливе почти не было кораблей, удалось потопить только один транспорт. К счастью, американских истребителей в том районе также не оказалось. На этом участие морской авиации в операции «И-го» завершилось. Но это не означало, что японцы отказались от налетов. 16 июня 24 D3A2 из 582-го кокутая, дислоцированного в Рабауле, совершили налет на Лунга-Пинт. Пикировщикам удалось потопить один транспорт, и серьезно повредить два других судна. Однако победа оказалась пирровой, японцы потеряли 13 D3A2 и 15 истребителей.
Учебный самолет Nakajima B5N1-K Model 11 «Kate», вероятно из 12-го хикотая, 1941 год.
30 июня самолеты из Рабаула совершили еще несколько налетов на плацдармы, захваченные американцами в Новой Джорджии и Рендове. После полудня отряд из 8 D3A2 и 24 G4M1 попытались нанести удар по кораблям, прикрывавшим десант, однако не смогли обнаружить противника. На обратном пути японцев перехватили американские истребители, сбив 1 D3A2 и несколько G4M1.
15 августа американская морская пехота высадилась на острове Велла-Лавелла. Японцы немедленно обрушили на плацдарм почти всю ударную мощь 21-го кокусентая. Американцы прикрывали десант с воздуха самолетами, базирующимися в Гуадалканале. Уже в 8:00 плацдарм атаковало несколько D3A2 из 582-го кокутая, однако налет не принес ожидаемых результатов. Затем атаковали B5N2, далее последовала новая волна D3A2, а также истребители А6М2. Несмотря на все усилия японской стороны сбросить десант в море не удалось. Выгрузка живой силы и техники продолжалась непрерывно. В налетах японцы потеряли восемь D3A2, два B5N2 и не менее восьми А6М2 в результате действий американской истребительной авиации и зенитной артиллерии. Вечером американцы провели налет на аэродром Бунин, где на земле уничтожили два D3A2 и 8 А6М2.
Снятые с авианосцев D3A2 и B5N2 поступили в части, дислоцированные в Рабауле. В период с 28 сентября по 1 октября туда прибыло еще 157 самолетов, снятых с авианосцев 1-го дивизиона. Среди них было 45 D3A2 и 40 B5N2. Это пополнение предполагалось использовать в операции «Ро-Го». Операция «Ро-Го», разработанная штабом адмиралтейства, должна была стать удачным повторением «Иго». Началась операция 15 октября 1943 года налетом 15 D3A2 и 39 А6М2 на союзнический конвой в заливе Оро. Однако союзники перехватили японцев и буквально перестреляли все самолеты. На базу вернулся только один D3A2. 17 октября японцы провели новый налет, на этот раз на Финшхафен. На этот раз потери были меньше, но результат по-прежнему нулевой.
1 ноября американцы высадили десант на западном побережье Бугенвилля. Японцы немедленно приступили к бомбардировке плацдарма. К налетам привлекли 16 D3A2, 9 B5N2 и 27 А6М2. Налет не причинил американцам большого ущерба, а на базу не вернулось 27 истребителей и 8 бомбардировщиков. Союзники все приближались к японской базе. Теперь она находилась в радиусе действия тяжелых бомбардировщиков В-24, не говоря уже о палубной авиации авианосцев «Саратога» и «Принстон». 5 ноября американцы провели первый массированный налет на Рабаул. В первом эшелоне летели самолеты с упомянутых выше кораблей. На следующий день налет повторили силами 5-го воздушного флота. Вечером 5 ноября 18 B5N2, вооруженных торпедами, вылетели в направлении американской эскадры. Те немногие экипажи, что сумели вернуться в Рабаул, доложили о потоплении «Саратоги» и повреждении «Принстона». Но это было неправдой, американские авианосцы не получили ни одного повреждения. Обеспокоенные американцы решили повторить налет на Рабаул. К операции привлекли самолеты со сразу пяти авианосцев: «Саратога», «Принстон», «Банкер Хилл», «Эссекс» и «Индепенденс». В первых налетах инициативу в своих руках удержали японцы, которые воспользовались принципом «лучшая оборона — это нападение». В сторону американской эскадры вылетели 27 D3A2 и D4Y1, 14 B5N2 и дюжина G4M. Истребительное прикрытие обеспечивало около 70 «Зеро». Все самолеты, вылетевшие из Рабаула, были из состава 1-го дивизиона авианосцев и 25-го кокусентая. Однако американцы рассеяли японский отряд еще на подлете к цели. Отдельные прорвавшиеся машины не смогли нанести противнику заметного ущерба. В Рабаул не вернулись все B5N2, 17 D3A2, два D4Y1 и несколько G4M. Японцы потеряли за месяц около 70 % самолетов, дислоцированных в Рабауле.