«Существует версия, что наше подразделение хотели спровоцировать на штурм со всеми вытекающими последствиями, но офицеры "Альфы" не сорвались, не пошли на поводу у эмоций. Я глубоко убежден, что выстрел был произведен не из Дома Советов».
В это время — в 1140 танки залпами начали обстреливать 13-й этаж, на котором располагались штабы генералов Ачалова и Макашова. На этом этаже и выше начался сильный пожар. «Дело в том, что огонь начавшегося на 15-м этаже в районе маршевых лестниц пожара практически сразу отрезал все пути спасения и обрек людей на долгую и мучительную смерть. Эти пять этажей выгорели дотла со всеми своими обитателями 4 и 5 октября лежавшие навиду обуглившиеся трупы и части разорванных тел были снесены «чистильщиками» в туалеты цокольного этажа 20-го и 8-го подъездов, окна которых выходят во внутренние дворики Дома Советов (западный и восточный), и к которым вплотную и подгонялись крытые труповозки — КАМАЗы и ЗИЛ, — рассказывал защитник ВС И. Иванов. — Однако расчет на то, что постоянно сновавшие, например, в восточный внутренний дворик через неприметный 19-й подъезд труповозки вывезли все трупы, себя не оправдал. Даже спустя неделю после расстрела парламента при разборе завалов на 15-19-м этажах, образовавшихся в результате танкового обстрела и пожара, находили обуглившиеся останки человеческих тел и обгоревшие трупы. На тех этажах, где не было пожара, оба лестничных пролета и служебная лестница были непроходимы из-за прицельного заградительного огня и пуль снайперов. Ночью спуститься на 6-й этаж с верхних этажей «стакана» никто не мог. В темноте защитники парламента под инфракрасными прицелами ночного видения «чистильщиков» были практически беззащитны.
4 октября в 1434 со стороны мэрии около 24-го подъезда Дома Советов скапливаются штурмующие и толпа погромщиков. Видно, что они совершенно не опасаются выстрелов со стороны защитников парламента и прячутся только от «своих» стрелков, отстреливающих живые мишени с противоположной стороны реки».
«Альфовцы» увидели эту кошмарную бойню, верно оценили весь трагизм ситуации, и сыграли большую положительную роль в истории России — они решили проникнуть в Белый дом, чтобы убедить руководство ВС сдаться и вывести защитников, особенно женщин и раненых. «Стрельба была прекращена на 2 часа, когда боевые подразделения «Альфа» и «Вымпел» выводили депутатов, журналистов, женщин», — отметил О. Платонов.
«Офицер "Вымпела" подошел к Руцкому и отдал честь: "Товарищ генерал, полковник Проценко явился с заданием вывести вас из Дома Советов!" — "Какие гарантии, что мы останемся живы?" — спросил Руцкой. — "Слово офицера-афганца. Я буду с вами!". Минут пятнадцать шли переговоры, где складировать оружие охраны. Решили здесь, у кабинета. Только Владимир Тараненко, начальник охраны Руцкого сказал: "Я донесу оружие до самого выхода и там сдам". Полковник разрешил и сказал Руцкому: "Я Вас уважаю, ценю, поэтому к Вам и пришел"», — рассказывал И. Иванов. — Перед тем, как под конвоем выйти из "Белого дома", Руцкой обратился к окружающим со следующими словами: «Они могут пойти на всё. Скажите, что вы видели нас, что мы не застрелились, чтобы наши трупы потом выдали родственникам. — Обращаясь к полковнику Проценко он добавил: — Полковник! Вы можете увезти нас в турецкое посольство?»
Прибывший А. Коржаков нашел А. Руцкого и его жестко подколол —что он третий раз сдался в плен (два раза в Афганистане). «Альфовец» П. Евдокимов: «16 часов 53 минуты. Бойцы группы «А» присели на ступеньках. Никого из официальных лиц не видно. Из 14-го подъезда Белого дома стали выходить люди. Они проходят через живой коридор, созданный нашими сотрудниками. Никого не били, не унижали. Зверствовали сотрудники ОМОНа, рассредоточившись по окрестным улицам и подворотням. Пьяные, с отборным матом, они без разбора избивали попавших в их руки людей. Тому есть многочисленные свидетельства».
Вышедших из здания ВС арестовали и повезли в автобусах в Лефортово. О. Платонов: «Сразу после этого (вывод людей альфовцами) бойня возобновилась. Солдаты и спецназовцы, многие пьяные, шли по коридорам Дома, убивали всех живых, добивая раненых. Приказы о поголовном уничтожении открыто передавали по рациям.
Тела расстрелянных тайно вывезены и уничтожены. Всего войсками заговорщиков было убито в Белом доме и возле него не менее полутора тысяч безоружных людей». И. Иванов: «А. Коржаков уже после вывода пленных на лестницу «Белого дома» публично требовал расстрела защитников парламента: "У меня приказ — ликвидировать всех, кто в форме!" После выхода депутатов с «Альфой» этот приказ был в точности выполнен. Были уничтожены все оставшиеся защитники парламента за исключением арестованных днем 5 октября в подвале — четырех милиционеров ОСН Департамента охраны и нескольких местных рабочих, а также шестнадцати защитников из заслона 14-го подъезда (арестованных в 3 часа 5 октября на 6-м этаже «Белого дома»). Тела расстрелянных были тайно вывезены и уничтожены.