Для того чтобы получить право стать оператором, добровольцы проходят 11 — месячный курс отбора и подготовки. Первый месяц — тренировки. Самым тяжелым испытанием в этот период считается недельный переход ПС джунглям. Дикие животные, ядовитые змеи, насекомые и нечеловеческая усталость — неполный перечень того, что приходится переносить кандидатам. Неудивительно, что отсев на этом этапе достигает порой 85 %.
Затем начинается 9-месячный курс обучения в школе боевых пловцов. На занятиях кандидаты учатся обращаться с различными видами вооружения, отрабатывают способы ведения разведки, а также варианты доставки диверсантов в тыл противника. Некоторые элементы тактики отрабатываются совместно с подразделениями сухопутного спецназа. Вопросам взаимодействия в ходе подготовки вообще уделяется особое внимание, в конце курса проводятся совместные учения флотского и армейского спецназа. На этом этапе отсеивание продолжается, но оно составляет уже не более 10 % и основном происходит во время осваивания легководолазной подготовки.
Выпускники получают назначение в одну из оперативных команд, им вручается шеврон и золотая кокарда, свидетельствующая о принадлежности к MCF.
С приходом в боевые подразделения учеба не заканчивается. В течение еще 12 месяцев молодых бойцов обучают спецразведке и тактике проведения диверсий, формированию повстанческого отряда и борьбе с партизанами. Диверсионные взводы проходят подготовку по ведению боевых действий в горной и пустынной местности.
Личный состав, направляемый в секцию быстрого реагирования, проходит дополнительную подготовку по антитеррору. Спецназовцев учат не только освобождать заложников, но и осуществлять захват как морских судов, так и наземных объектов. Продолжается обучение по сложной программе воздушно-десантной подготовки, которая предусматривает десантирование из летательных аппаратов на сверхмалых высотах с принудительным раскрытием парашюта. Бойцы изучают десантирование в водолазном снаряжении, а также передвижение под водой.
Тот, кто успешно завершил обучение в боевом подразделении, получает квалификацию по одной из специальностей: разведчик, подрывник, медик и др.
MARCOS делится на три оперативные группы, каждая из которых осуществляет свою деятельность в интересах флота, в состав которого входит. Эти группы насчитывают около 2000 человек и разделены на десять рот по 200 человек. Непосредственно специальными операциями в каждой роте занимаются только 120 человек, а остальные входят в группу поддержки и обеспечения.
В состав каждой оперативной группы включено также антитеррористическое подразделение, имеющее структуру взвода увеличенного состава. Это подразделение называется секцией быстрого реагирования.
Помимо выполнения основных задач подразделение занимается осуществлением поисковых и спасательных операций на море, а также выполняет разведывательные задачи в интересах разведслужб.
Водолазное снаряжение включает в себя дыхательные аппараты, гидрокостюмы мокрого типа, ласты, компасы. В Германии закупаются новейшие аппараты замкнутого цикла. Подводные средства передвижения включают в себя двух- и четырехместные буксировщики. Они способны доставить боевых пловцов с вооружением и грузом на дальность до двадцати пяти морских миль. Носитель оснащен контейнером для транспортировки стрелкового и инженерного вооружения, а также средств связи, приборов наблюдения и навигации. Из надводных плавсредств имеются легкие надувные лодки, каяки и моторные лодки. Для масштабных действий по морскому выводу групп в тыл противника в составе ВМС Индии есть специальное подразделение малых судов, в которое входят патрульные и десантные катера. В распоряжении MCF имеются также шесть вертолетов Sea King и легкие вертолеты Chetak.
Морские коммандос Индии имеют разнообразное стрелковое вооружение. Это автоматические винтовки FN FAL индийского производства, американские винтовки М16 и автоматы Калашникова АК-47 советского производства, которыми в основном вооружены секции быстрого реагирования. Снайперы пользуются винтовками MSG и PSG-1. Из пистолетов-пулеметов — 9-мм Sterling индийского производства, израильские Mikro-Uzi, а также различные модификации немецкого НК МР-5. Пистолеты — в основном фирмы Glock. Кроме этого, используются гранатометы РПГ-7 и пулеметы РПК советского производства. В качестве бесшумного оружия часто применяются арбалеты.