1201 В марте папа Иннокентий III меняет свою нейтральную позицию в споре о германском троне в пользу Вельфа Оттона IV. Филиппа Швабского и его сторонников отлучают от церкви. Фридрих под опекой графа Джентиле Манупелло, брата епископа и сицилийского канцлера Вальтера Пальяры, находится в крепости Кастелламаре.
1202 Во внутреннем германском конфликте между Шгауфенами и Вельфами предпочтение оказывается Филиппу Швабскому. Закладка собора во Фрейбурге, возведение которого завершилось в 1536 году. В Италии Леонардо Пизано Фибоначчи вводит в употребление арабские цифры.
1204 Начало строительства кафедрального собора в Мольфетте (Апулия), которому присуще смешение византийского, сарацинского и романского стилей.
1205 Вольфрам фон Эшенбах создает эпос о Парцифале.
1206 Последний рыцарь-авантюрист, выходец из германских земель, Вильгельм Каппароне, изгнан из Сицилии.
1207 Состязание певцов в Вартбурге. В Венгрии родилась святая Елизавета Тюрингская.
1208 В июне пфальцграф Оттон фон Виттельсбах убивает в Бамберге короля Филиппа Швабского. В ноябре Оттон IV во второй раз избирается королем во Франкфурте. 28 декабря Фридрих становится совершеннолетним и получает возможность править самостоятельно.
1209 В августе по желанию папы пятнадцатилетний Фридрих женится на двадцатипятилетней Констанции Арагонской, вдове венгерского короля Эммериха. В октябре Оттон IV становится императором; коронация проходит в Риме. Нарушая все соглашения и договоры с папой, он отравляется на юг, стремясь завоевать Сицилию и изгнать Фридриха II.
1210 В ноябре папа Иннокентий III объявляет Оттона IV отлученным от церкви и при участии французского короля Филиппа Августейшего предлагает на германский трон Фридриха Гогеншгауфена. Готтфрид фон Страсбург пишет «Тристана».
1211 В сентябре в Нюрнберге германские князья выбирают Фридриха II королем (после, согласно Г. Митгайсу, он сразу становится императором) и объявляют Оттона IV смещенным, из-за чего последний вынужден вернуться в Германию. Родился первый сын Фридриха, Генрих.
1212 В январе посольство германских князей в Палермо предлагает Фридриху германскую корону. В марте (в Вербное воскресенье) начинается полное приключений путешествие Фридриха в Германию. Перед отъездом он коронует сына, Генриха, королем Сицилии, а жену, Констанцию, объявляет регентшей. В апреле, в пасхальное воскресенье, Фридрих в первый и единственный раз встречается с папой Иннокентием III. Он приносит папе, своему сюзерену, клятву верности как его сицилийский ленник, торжественно обещает разделить власть королевскую (regnum) и императорскую и уступить после успешной коронации Сицилию сыну, Генриху. По желанию папы Берард Ди Кастачча, архиепископ Бари, а впоследствии Палермо, становится советником и спутником Фридриха. В июле Оттон IV женится на пятнадцатилетней Беатрисе, дочери убитого короля Филиппа Швабского, для привлечения на свою сторону приверженцев Гогеншгауфенов. Беатриса умирает спустя несколько дней. В сентябре Фридрих II прибывает в Констанцу, незадолго до приезда Оттона IV, и оттуда направляется в Базель. В октябре Фридрих устраивает первый придворный совет в Хагенау в Эльзасе. Канцлер императора Оттона IV, епископ Конрад Шлагенбергский, переходит на сторону Фридриха. В ноябре в Ванкулере вблизи Тура происходит встреча Фридриха II с будущим французским королем Людовиком VIII. За обещание не заключать сепаратного мира с Оттоном IV или с его английским дядей Иоанном Безземельным Фридрих получает от Франции двадцать тысяч серебряных марок. 9 декабря состоялась коронация Фридриха в Майнце путем вручения дубликатов королевских инсигний. Их оригинал по-прежнему в руках Оттона IV. Начало строительства кафедрального собора в Реймсе.
1213 Оттон IV женится на Марии, дочери и наследнице герцога Генриха I Брабантского, намереваясь обрести сторонников среди нижнегерманских дворян.
12 июля, на Троицу, в Эгере Золотой буллой Фридрих II подтверждает права папы на Центральную Италию. Он, как и его предшественник Оттон IV, отказывается от права наследования имущества умерших священников и от вмешательства в выборы епископов.
Кроме того, как плату за выборы его королем он предоставляет германским князьям ряд привилегий. В Золотой булле Эгера усматривают исходный пункт образования территориальных государств в Германии.
1214 27 июля французский король Филипп II Август при Бувине (Лилль) побеждает войско императора Оттона IV и его английских союзников. В декабре Фридрих II заключает в Метце договор с датским королем Вальдемаром, по которому передает Дании германские земли по ту сторону Эльбы.
1215 25 июля Фридрих второй раз коронован в Аахене, традиционном месте проведения церемонии коронаций, на этот раз — с передачей истинных инсигний. В возрасте двадцати одного года он внезапно дает обещание отправиться в крестовый поход, сдержав его лишь спустя тринадцать лет. В ноябре папа Иннокентий III открывает четвертый собор. Принимается тезис о преображении плоти и крови Христовой при таинстве причастия. Признается справедливость притязаний Фридриха II на германскую корону. В Англии принимается «Великая хартия вольностей». Фридрих II жалует леном своего приверженца Вальтера фон дер Фогельвейде.
1216 Фридрих II вновь дает обещание папе, сразу после коронации императорской короной, передать сыну Генриху Королевство обеих Сицилии.
16 июля умирает папа Иннокентий III. Его преемником становится папа Гонорий III. Фридрих II приказывает жене Констанции прибыть вместе с сыном Генрихом в Германию. Фридрих II награждает пятилетнего сына титулом герцога Швабского. Немного позже, после того как вымерли Церингеры, он передает под его правление Бургундию. Генрих, коронованный король Сицилии, становится имперским князем.
1217—1218 Венгерский король Андраш II, отец святой Елизаветы, отправляется в крестовый поход.
1218 Оттон IV, в возрасте тридцати пяти лет, умирает в Гарцбурге.
1220 3 апреля восьмилетнего Генриха на придворном совете во Франкфурте «неожиданно» избирают королем. Три дня спустя, 26 апреля, в благодарность духовным князьям Фридрих предоставляет им значительные привилегии («Конфедерация на основе церковных законов»). В августе Фридрих отправляется в Рим, где 22 ноября папа Гонорий III коронует его как императора. В декабре, после восьмилетнего отсутствия, Фридрих возвращается в Королевство обеих Сицилии. Вслед за введением свода законов «Капуанские Ассизы» он возвращает короне большинство из розданных после 1189 года отчужденных ленов.
1221—1225 Завоевание и подавление Сицилии.
1222 В Вероли Фридрих II получает от папы Гонория III отсрочку от участия в крестовом походе до победы над островными сарацинами — 23 июня умирает императрица Констанция.
1223 14 июля умирает французский король Филипп Август. Его преемник — Людовик VIII. В Ферентино император дает обет папе начать крестовый поход до 1225 года. На той же встрече обсуждается план женитьбы Фридриха на Изабелле (Иоланте) де Бриенн, наследнице Иерусалимской короны. Строится дворец в Фоджии.
1224 Переселение сарацин на континент. Возникает поселение сарацин в Лючере. Фридрих основывает университет в Неаполе.
1225 Проходит назначенный срок выступления Фридриха в крестовый поход. Император вынужден подписать договор Сан-Германо: если он не выступит в крестовый поход до августа 1227 года, ему грозят большой денежный штраф и отлучение от церкви.
8 ноября Фридрих II женится на Изабелле (Иоланте) де Бриенн, наследнице Иерусалимского королевства.
29 ноября сын Фридриха, германский король Генрих (VII) женится на Маргарите Австрийской.
Начало строительства, собора Святого Стефана в Вене.
1226 В Золотой булле, принятой в Римини, Тевтонский орден получает право на создание собственной орденской территории в Пруссии.
Магистр Тевтонского ордена Герман фон Зальца находится в Германии в качестве посредника императора. Там он набирает людей для участия в намеченном крестовом походе.
5 сентября умирает Людовик VIII, его преемником на троне Франции становится Людовик IX Святой. 3 октября умирает Франциск Ассизский (Джованни Бернадоне).