Самым важным в отношении ВМФ к Гитлеру было то, что флот оставался политически нейтральным, как того хотели оба. Но недостатки такого положения вскрывались слишком медленно. Флот обнаружил, что проигрывает в спорах с остальными видами вооруженных сил — особенно Люфтваффе, которыми руководил Герман Геринг.
Первым результатом деятельности при новом режиме стала новая пятилетняя кораблестроительная программа, основанная на Версальском договоре. Личный состав был увеличен, и к 1935 году в 3 раза превысил разрешенные договором рамки. В первый раз было запланировано нарушение положений договора.
Первым министром обороны в правительстве Гитлера стал генерал Вернер фон Бломберг, он же являлся главнокомандующим германскими вооруженными силами. Его штаб — Верховное командование вооруженных сил, OKW — было предназначено для объединения стратегических планов всех видов вооруженных сил и координации действий сначала 2, а потом и 3 служб. Позднее в OKW был создан штаб объединенных операций. В первый раз Германия получила единое военное руководство.
Однако система командования быстро начала разрастаться после создания министерства авиации под руководством Германа Геринга. Это новое учреждение теоретически имело одинаковый статус с министерством обороны, но на практике стояло выше его из-за положения Геринга в нацистской иерархии. Геринг немедленно начал в тайне создавать ВВС и попытался с самого начала захватить контроль над авиацией армии и флота.
Планы Геринга вызвали яростные споры по вопросам стратегии воздушной войны. ВМФ заявил, что ему требуется совершенно независимая авиация, специально обученная действиям над морем и имеющая специальные самолеты. Геринг оказался защитником единой авиации — возможно он просто не понимал все недостатки такой системы. Он считал, что должен руководить всей авиацией за исключением корабельных гидросамолетов. Даже те самолеты, которые должен был получать флот, должны были создаваться силами ВВС. Его целями в войне были господство в воздухе и стратегические атаки, поэтому он придавал мало значения сотрудничества с другими видами вооруженных сил. В его однобокости были исключения, например блицкриг 1939 — 41, однако они были гораздо более редки, чем казалось союзникам. То, что другим службам требуются свое оружие, свое обучение личного состава, свои коды и системы связи, Геринг просто отвергал. Вражда разгоралась.
Отчасти надеясь на изменение Версальских ограничений Редер в 1934 начал планировать строительство более крупных кораблей. Настало время строить еще 2 карманных линкора. 3 уже были построены и считались удачными кораблями, но Редер хотел получить более крупные и сильно вооруженные корабли. Гитлер не хотел тревожить иностранные державы поступками, явно противоречащими Версальскому договору. Поэтому он приказал Редеру начать проектирование более защищенного корабля. Но потом эти планы были изменены, и появились третья 11" башня. В этом случае водоизмещение доходило до 25000 тонн.
В этот период ВМФ по прежнему считал необходимым иметь рейдеры. Поэтому были сделаны секретные приготовления к переоборудованию 4 быстроходных торговых судов во вспомогательные крейсера. Необходимые орудия можно было получить у армии, однако проект был заброшен после ряда неприятных стычек. Но планирование продолжалось.
Строительство подводных лодок становилось все более и более реальным. Голландское конструкторское бюро спроектировало лодки для Турции и Финляндии. Они послужили основой для германских проектов. Финская лодка была частично спроектирована в Германии, и немцы испытывали ее, прежде чем передать финнам. Она стала прототипом первой серии германских малых прибрежных лодок — от U-1 до U-24 (250 тонн). Части для сборки этих лодок были тайно заказаны германским заводам. Редер предложил собрать 6 лодок к ноябрю 1934, чтобы иметь возможность использовать их в случае необходимости и начать воссоздание подводных сил. Гитлер отверг это предложение, но к началу 1935 все материалы были приготовлены. Именно тогда произошло резкое изменение перспектив германских вооруженных сил, что стало результатом агрессивной политики Гитлера.