В январе 1918 г. на Владивостокский рейд без приглашения прибыли иностранные корабли. Среди них были японские: броненосец «Ивами» (бывший российский «Орёл», сдавшийся в Цусиме) прибыл 12 января, броненосец «Асахи» прибыл 13 января. А 14 января прибыл английский броненосный крейсер «Суффолк». Мотивация интервентов – защита британских и японских подданных.
Руководство Советов Владивостока и Сибирской флотилии выразило протест, но не имело сил для отпора интервентам.
Водой и топливом японские броненосцы снабжал транспорт «Сейто-Мару», совершавший по два рейса в месяц между Владивостоком и Японией. На рейд Владивостока прибыл транспорт-ледокол «Камикава-Мару» для ледокольной проводки японских судов на Владивостокский рейд.
1 марта во Владивосток прибыл американский крейсер «Бруклин».
В марте 1918 г. состоялись перевыборы Владивостокского Совета, после чего в нём усилилось влияние большевиков. 18 марта был избран новый состав исполкома, в него вошли 16 большевиков, 4 левых эсера, 2 правых эсера и 3 меньшевика. Председателем исполкома стал К.А. Суханов, его заместителем – П.М. Никифоров.
21 января 1918 г. в гостинице «Версаль» налётчики ограбили нескольких иностранцев. Собственно, тогда это была обычная история. Однако консулы иностранных государств обратились к своим правительствам с требованием о принятии мер для наведения порядка в городе. В результате по Владивостоку стали разгуливать японские и английские матросские патрули. На запрос городских властей командиры кораблей ответили, что это не десант, а охрана, высланная по просьбе консульств.
4 апреля 1918 г. были убиты трое подданных Японии. Служащий конторы Иси-до X. Кикучи, «вышедший уже из терпения в отношении безопасности жизни и имущества японских подданных», обратился к командующему японской эскадрой с целью «принятия экстренных мер, которые он сочтет необходимыми для ограждения жизни и имущества японских подданных». Ответ контр-адмирала X. Като последовал немедленно. На следующий день, 5 апреля, он выпустил обращение к гражданам Владивостока, в котором заявлял, что хотя он «до настоящего времени абсолютно избегал совершать такие действия, как вмешательство во внутреннюю политику России или оказание той или иной политической партии поддержки», «произошедшее среди бела дня убийство и ранение трёх японцев… заставило принять на себя ответственность за защиту жизни и имущества подданных Японской империи», то есть «высадить десант с вверенной эскадры и принять меры, какие считаю соответствующими».
14 апреля 1918 г. в Хабаровске состоялся IV краевой съезд Советов Дальнего Востока. В нём приняло участие 107 делегатов с правом решающего голоса и 62 – совещательного, большинство их составляли рабочие, крестьяне и казаки, были представлены все области. Съезд отказался от сотрудничества с земствами и городскими самоуправлениями и принял решение их упразднить. Таким образом, двоевластие Советов и земств закончилось. Последней 5 июня была разогнана Владивостокская городская дума.
В конце мая – начале июня 1918 г. части Чехословацкого 60‐тысячного корпуса, растянувшиеся вдоль железнодорожной магистрали от Пензы и Самары до Владивостока, начали устраивать мятежи. К концу июня докатился такой мятеж и до Владивостока, когда там скопилось около 15 тысяч солдат и офицеров, которых возглавлял начальник штаба Чехословацкого корпуса русский генерал Михаил Константинович Дитерихс. Всё началось с пьяных погромов. В протоколах заседаний военной комиссии Владивостокского Совета говорилось: «Во время гулянья, устроенного чехословаками 24 июня 1918 года, в саду бывшего Адмиралтейского дома были учинены различные повреждения, частью исправленные, частью – нет».
В ночь на 29 июня чехи арестовали почти весь состав исполкома Владивостокского Совета и осуществили контрреволюционный переворот, сопровождаемый террором. Три полка Чехословацкого корпуса (3, 4 и 11‐й) отказались выступать против Советов. Их разоружили и отправили на остров Русский.
6 июля чехословаки объявили Владивосток под протекторатом союзников. Охрану порядка в городе обеспечивали чехословацкие, японские, английские, китайские, а позднее и американские войска.
Начальником иностранной полиции во Владивостоке был назначен американский офицер Джонсон. Все советские организации во Владивостоке были ликвидированы, в том числе и ЦК Сибирской флотилии.