5 ноября 2005 года компания In-N-Out Burger привлекла крупную налоговую фирму Grant Thornton для проведения судебно-бухгалтерской экспертизы Бойда; в частности, фирме было поручено проверить обвинения в неправомерных сделках. Фирме был предоставлен доступ к офисам и файлам отдела Бойда. Они опросили сотрудников Бойда, а также ряд подрядчиков и субподрядчиков, включая Майкла Мадрида, владельца компании Michael Anthony Companies. Было изучено и скопировано содержимое стола Бойда и сотрудников его отдела. Кроме того, они изучили информацию, хранящуюся в его компьютере, и извлекли ноутбуки сотрудников Бойда. Бухгалтерская фирма также провела поиск в открытых источниках информации о Бойде, его жене, сыне, дочери и сестре. Пять дней спустя компания In-N-Out уведомила Бойда о том, что 13 декабря состоится слушание, на котором будет решаться вопрос о его увольнении в связи с "неправомерным поведением".
Месяц спустя Лоуренс А. Росипайла, директор Grant Thornton, передал In-N-Out толстый семидесятивосьмистраничный отчет с копиями счетов-фактур и фотографиями второго дома Бойда в Аризоне от 5 декабря 2005 года. В отчете утверждалось, что Бойд использовал своего любимого подрядчика, компанию Michael Anthony Companies, для выполнения строительных работ в своей личной резиденции, а стоимость работ отнес на счет In-N-Out. В ходе расследования также были обнаружены доказательства того, что Бойд якобы присвоил средства компании , чтобы построить стену стоимостью более 5000 долларов на своем участке в Аризоне, а также патио и кабану в своем доме в Калифорнии. Чтобы замести следы, в отчете утверждалось, что Бойд уничтожил документы. Адвокат Бойда Филип Хеллер назвал расследование шарадой, равносильной уничтожению личности. По его словам, это была "не более чем охота на ведьм"; и вскоре команда Бойда представила контррасследование Discovery Economics, опровергающее выводы Grant Thornton.
По мере того как осень сменялась зимой, а 2005 год переходил в 2006-й, ситуация между Бойдом и In-N-Out Burger становилась все более неприятной. В январе совет директоров созвал специальное собрание, целью которого было обсудить увольнение Бойда. На тот момент в совет директоров In-N-Out входили Бойд, Тейлор и Эстер. (Бойд и Тейлор были введены в состав совета директоров после смерти Гая.) Ситуация была, мягко говоря, странной. Бойд возразил, что он должен присутствовать, а Эстер - нет, и попытался провести конфабль 27 января, но позже ему не удалось получить временный судебный запрет на проведение собрания совета директоров, назначенного компанией In-N-Out на 30 января 2006 года в доме Эстер. Бойд утверждал, что в дом его не пустили охранники. Ему не позволили поговорить с Эстер и сказали, что она не желает его видеть.
Битва переместилась в зал Высшего суда в центре Лос-Анджелеса. В марте жалобы Бойда пополнились иском о клевете против бухгалтерской фирмы Grant Thornton, якобы за то, что она сделала "запугивающие и вводящие в заблуждение заявления для сотрудников In-N-Out". В ходе расследования, проведенного Торнтоном в отношении Бойда, фирма (по обвинению его адвокатов) назвала Бойда "вором" и "неэтичным" во время интервью с сотрудниками In-N-Out. Кроме того, директор "Торнтона" Росипайла "запугивала и терроризировала сотрудников, угрожая им уголовным преследованием, гражданскими штрафами и неблагоприятными мерами при трудоустройстве, если они откажутся заявить, что Бойд совершал преступные действия". Поведение, описанное в судебных документах, было трудно совместить с безупречной репутацией In-N-Out.
In-N-Out расширила свой иск, включив в него Майкла Энтони Мадрида, подрядчика, обвиненного в получении льготных предложений и выполнении работ на личном имуществе Бойда (работы, которые, как утверждали адвокаты сети, были выставлены In-N-Out). В пространном заявлении, подписанном и датированном 31 октября 2005 года, Мадрид объяснил, что он работал над более чем сотней строительных проектов для сети с момента подачи первого предложения о строительстве магазина Thousand Palms около двадцати лет назад. In-N-Out, по его словам, составляла примерно 25-30 процентов от всего бизнеса его фирмы. "In-N-Out - очень важный клиент", - заявил он. "Я бы не стал ничего делать, чтобы поставить под угрозу эти отношения".
Согласно декларации, в конце 2003 года Бойд сказал Мадриду, что хочет построить стену на своем участке в Аризоне, который находился в двадцати минутах езды от Лафлина, штат Невада, где компания In-N-Out строила магазин. Бойд, по словам Мадрида, спросил, можно ли, чтобы бригада Мадрида работала над стеной, пока он работает над соседним магазином. По словам Мадрида, его фирма не создала номер задания для стены, потому что это был такой маленький проект. Кроме того, по его словам, он никогда не высылал Бойду счет за работу и не просил его оплатить ее.