Тем не менее, несмотря на большой объем работы, в деятельности органов пропаганды были упущения. Многое к началу войны сделать не успели. 7-е отделы были образованы все-таки слишком поздно. На протяжении длительного периода политорганы не имели в своем составе аппарата, специально занимавшегося изучением вероятных противников и разработкой вопросов пропаганды среди его войск и населения. В политорганах Военно-морского флота и ВВС 7-е отделы перед войной так и не были созданы. Не было их и во внутренних военных округах. Между тем в большой и трудной войне с национал-социалистической Германией сил приграничных военных округов, разумеется, было недостаточно. Инструкторы по работе среди войск и населения противника были введены в штат политотделов только стрелковых соединений, что отрицательно сказалось на работе непосредственно на линии фронта.
После разгрома германских войск под Москвой условия для ведения спецпропаганды значительно улучшились. Поэтому ЦК ВКП (б) поставил перед военными советами фронтов и политорганами новую задачу по идеологическому воздействию на противника.
В решении этой проблемы большую роль сыграл созданный Центральным комитетом в июне 1942 года Совет военно-политической пропаганды (СВПП) при Главном политическом управлении Красной армии. В его состав вошли секретари ЦК ВКП(б) А. С. Щербаков, А. А. Жданов, члены ЦК Е. М. Ярославский, Д. З. Мануильский, Л. З. Мехлис, И. В. Рогов и другие. На Совет возлагалась задача обобщать опыт всей партийно-политической работы в войсках и разрабатывать рекомендации по ее совершенствованию.
Одним из важнейших направлений деятельности Совета было руководство политической работой среди войск и населения противника. Следовательно, вопросы идеологической борьбы с противником рассматривались в органическом единстве с проблемами всего комплекса деятельности Военных советов и политических органов Красной армии.
Создание Совета военно-политической пропаганды положило начало новому этапу в развитии и совершенствовании спецпропаганды.
Первое изменение в аппарате спецпропаганды произошло в октябре 1942 года, когда появилась необходимость усилить уровень профессионализма фронтовой и армейской оперативной пропаганды среди вражеских войск. Чтобы решить эту задачу, в состав 7-х отделов политуправлений фронтов были введены редакционно-издательские отделения (РИО), а в 7-е отделения политотделов армий — должности инструкторов-литераторов и приданы походные типографии. Политотделам дивизий разрешалось создавать в помощь инструктору по спецпропаганде актив из бойцов и командиров, знающих язык противника.
В связи с увеличением масштаба работы и для улучшения руководства и помощи политорганам фронтов в Главном политическом управлении Красной армии 7-й отдел был реорганизован в 7-е управление. Управление состояло из инспектуры, отдела по работе среди войск противника, отдела по работе среди населения освобожденных стран и отдела информации и обобщения опыта работы. Под руководством управления работали и редакции центральных военных газет, издававшиеся на иностранных языках.
В Главном политуправлении Военно-морского флота организация спецпропаганды несколько запоздала. Лишь в январе 1942 года в составе политуправлений флотов были созданы отделы, в политотделах флотилий — отделения по работе среди личного состава флотов противника, а в политических отделах крупных военно-морских баз введены старшие инструкторы по работе с войсками противоборствующей стороны.
В целях помощи кадрам аппарата спецпропаганды в повышении политической и деловой квалификации была налажена их учеба. Для этого широко использовался инструктаж молодых работников. Непосредственно на места в армии и дивизии командировались группы высококвалифицированных пропагандистов, регулярно проводилось рецензирование агитдокументов, обобщался и распространялся лучший опыт работы и проводились другие аналогичные мероприятия.