Большое значение имели походы в южном и юго-западном направлениях — в район оз. Титикака, где находилась легендарная «прародина» инков. Пачакутек достиг южного побережья озера. В результате этого завоевания инки завладели огромными стадами лам и альпак, что позволило решить проблему с транспортными средствами, одеждой и продовольствием для армии. Кроме того, Пачакутек объявил стада лам собственностью верховного инки, заложив таким образом основу имперского сектора экономики, ресурсами которого распоряжалась царская власть.
Пачакутек предпринял ряд шагов, направленных на создание эффективной системы управления империей. Он раздавал власть преданным вождям и уничтожал непокорных. Пачакутек объявил язык инков — кечуа — официальным языком империи, но обитателям «провинций» не запрещалось пользоваться своим, родным языком. Пришедший к власти в 1463 г. Тупак Юпанки, сын Пачакутека, продолжил политику завоеваний, подчинив северные районы Эквадора и некоторые другие. Южные походы не были столь удачны — инкам не удалось подчинить чилийских индейцев — арауканов.
При Тупаке Юпанки была проведена первая перепись населения империи. Он же ввел десятичную административную систему, с помощью которой можно было собирать налоги и иметь точную статистику населения. Для реализации этого плана все наследственные вожди были заменены кураками.
В правление Уайна Капака (1493 — ок. 1525) империя инков достигла максимальных размеров и пика величия. Однако управлять такими большими территориями становилось все сложней без развития быстрых средств коммуникации — знаменитая инкская система гонцов исчерпала свои возможности. Уайна Капаку пришлось подавлять мятежи в удаленных провинциях Эквадора.
После смерти Уайна Капака страна оказалась расколотой. На престол претендовали его сыновья: Уаскар, законный наследник в Куско, и находивший в Кито и не имевший права наследования Атауальпа, любимец Уайна Капака. Началась гражданская война, в результате которой к власти пришел Атауальпа. Это случилось в 1532 г., когда конкистадоры уже достигли пределов инкской империи. В 1533 г. испанцы под командованием Франсиско Писарро захватили Атауальпу и казнили. После этого престол занимали поочередно еще четыре сапа-инки, пока в 1572 г. не был казнен последний из них — Тупак Амару.
Государственное устройство. Социальная система. Империя инков называлась Тауантинсуйу, что можно перевести как «четыре стороны света», или «страна из четырех четвертей». Название отражало деление страны на четыре части: Чинчасуйу (северо-запад), Кольясуйу (юг), Кунтисуйу (запад) и Антисуйу (восток). Части Тауантинсуйу были поделены на провинции различных размеров, каждая из которых имела свою столицу. Провинции в свою очередь также делились на более мелкие районы. Во главе каждой четверти, или суйу, стоял губернатор, которым был представитель высшей инкской знати, должность которого не являлась наследственной. Районы делились в зависимости от количества домохозяйств (10, 100, 1000, 10 000). В основе такого деления лежала десятичная административно-иерархическая система.
Верховным правителем был полубожественный Инка, а его тулом был сапа-инка — «единственный» инка. Власть была наследственной. Наследниками могли быть сыновья инки от его родной сестры. Ближайшие родственники формировали верхушку нобилитета Тауантинсуйу, они были «инки по крови» и являлись серьезной политической силой, достаточно независимой от сапа-инки.
Общинники в Тауантинсуйу были объединены в родовые группы айлью, считавшиеся основной социальной группой, на которой базировалась политическая система империи. После женитьбы каждый член айлью получал от инки земельный надел — «топу» и становился главой семьи, которая уплачивала налоги и ее члены должны были обрабатывать, помимо своего надела, земли государства и храмовые.
В империи существовало несколько категорий населения, исключенных из общинного сектора, — акльякона, йянакона, митмак и камайок. Акльякона были девушки-мастерицы, изготавливавшие ткани для государственных нужд. Йянакона были слугами в храмах и во дворцах, обслуживали представителей столичной и провинциальной элиты. Группу камайок составляли ремесленники: медники, кожевники, гончары, жрецы-толкователи узелкового письма кипу. Самой многочисленной категорией работников, исключенных из общинной системы, были многочисленные переселенцы-колонисты.