Добиться присяги от членов теруэльского муниципалитета не удалось, и 2 октября 1484 года инквизиторы отдали приказ, которым все находящиеся на службе в Теруэле лица были признаны негодными к занятию государственных должностей; им была прекращена выдача жалованья. Одновременно инквизиторы обратились к Фердинанду с просьбой предоставить в их распоряжение светскую власть в городе. 5 февраля 1485 года король издал указ, согласно которому все чиновные лица Арагона, равно как все дворянство, вместе с находящимися в их распоряжении солдатами поступали в распоряжение инквизиции, дабы та могла арестовать виновных жителей Теруэля и конфисковать их имущество. Одновременно Фердинанд распорядился, чтобы войска из Куэнки и других кастильских городов вступили в пределы Арагона и начали там войну против врагов инквизиции. Мы не знаем, отправилось ли крестоносное войско из Кастилии в Арагон; известно лишь, что теруэльцы после этого наконец сдались. 15 апреля 1485 года Фердинанд назначил губернатором покорившегося города Хуана Гарсеса де Марсилью, предоставив ему диктаторские полномочия. Фактически город всецело оказался в руках инквизиторов, так как Марсилья слепо исполнял все их приказания.
Инквизиционная касса обогатилась громадными суммами: по малейшему подозрению налагались большие денежные штрафы на тех, кто в период бунта сочувствовал противникам инквизиции; немало людей вовсе лишились имущества только потому, что они считались неблагонадежными. Во время беспорядков в Теруэле близлежащие местности, в частности Селья, давали теруэльским инквизиторам взаймы значительные суммы, которые те обязались выплатить из конфискованных у бунтовщиков средств; этим объясняется, почему жители теруэльского округа были на стороне инквизиции.
Жестокое подавление теруэльских беспорядков вызвало крайнее недовольство в Сарагосе. У сарагосских новообращенных — в наивной надежде запугать инквизицию — возник план убить какого-нибудь важного инквизитора. Выбор пал на Педро Арбуэса, который пользовался в Сарагосе ужасной репутацией. За короткий срок он выстроил в городе систему доносительства, сделал тем самым господами положения наиболее испорченных людей. Среди заговорщиков было немало высокопоставленных людей, в том числе, между прочим, королевский казначей Габриэль Санчес. Весной 1485 года состоялось первое покушение на Арбуэса; оно оказалось неудачным и побудило инквизитора принять меры предосторожности: он стал носить панцирь под платьем и железную каску под шапкой. Но это ему не помогло: в ночь на 15 сентября Арбуэс был зарезан в церкви во время молитвы. Как позже выяснилось, трое убийц были наняты кожевником Хуаном де Эсперандеу, чей отец томился в тюрьме.
Результат убийства Арбуэса оказался противоположен тому, на какой рассчитывали враги инквизиции: инквизиторы не только не испугались, но умело использовали его в интересах своего дела. В народе был пущен слух, что евреи, мусульмане и мараны решили убивать христиан и что церкви угрожает страшная опасность. Фанатичная толпа легко в это поверила и завопила о мести. Эти настроения быстро передались высшим классам. Город пообещал 500 дукатов тому, кто укажет бежавших убийц, а Фердинанд заявил, что не остановится ни перед какими расходами ради их отыскания. Была опубликована особая прокламация, которая отлучала от церкви всех, кто знал что-либо о заговоре против Арбуэса и не сообщил об этом инквизиционному трибуналу. А папа Иннокентий VIII опубликовал 3 апреля 1487 года бреве, в силу которого все правители, государи и судьи христианского мира должны были по указанию испанской инквизиции выдавать ей скрывавшихся в их странах беглецов и в течение тридцати дней, под страхом отлучения и обвинения в содействии ереси, доставлять их в Испанию. Инквизиция, таким образом, становилась международной. Правда, бреве это осталось лишь на бумаге, поскольку иностранные государства отказывались подчиняться требованиям испанских инквизиторов. Так, когда в 1501 году в Португалию сбежали два еретика из Кордовы, король Мануэл отказался их выдать до тех пор, пока ему не будут предоставлены доказательства виновности обоих беглецов. Им был даже учрежден особый комитет, на рассмотрение которого должны были поступать все просьбы испанской инквизиции.