Правда, тут она вступала в конфликт со светской властью, которая считала преследование двоеженства своей прерогативой. Порой за то, кто будет наказывать выявленного грешника, разворачивалась настоящая борьба. Но если инквизиции удавалось одержать в ней верх, преступник редко мог рассчитывать на снисхождение. Так, на севильском аутодафе 13 мая 1565 года были наказаны четырнадцать двоеженцев: все получили по двести ударов плетьми, а пятеро, кроме того, были сосланы на каторжные работы. На аутодафе в Кордове 3 июня 1655 года Габриэль де Ольмо, 55 лет от роду, предстал со знаками двоеженца на одежде (да, были и такие!); его приговорили к «легкому отречению», 200 ударам плетьми и к десятилетнему изгнанию из Кордовы и Мадрида. В отчетах толедского трибунала за 1575—1610 годы говорится о 54 делах, связанных с двоеженством (то есть чуть более одного дела в год), но затем число таких дел в трибуналах становится все меньше и меньше. Объясняется это, вероятно, тем, что их рассматривали светские суды. А в 1767 году, в правление Карла III, королевский совет постановил окончательно изъять дела о двоеженстве из ведения инквизиции.
В 1529 году толедский трибунал приговорил сарагосского священника, вступившего в брак, к следующему наказанию: в течение трех дней он со связанными руками и с кандалами на ногах стоял в нижнем белье у главных ворот церкви, а затем его лишили духовного звания и выслали за пределы провинции. Своеобразный характер наказания говорит о том, что это был первый случай осуждения инквизицией женатого аббата.
Обычным наказанием для вступившего в брак духовного лица были лишение сана, ссылка на каторжные работы сроком на три-пять лет и запрещение жить в определенных местах. Впрочем, статистика свидетельствует, что преступление это не было распространено. В отчетах толедского трибунала за 1575—1610 годы говорится о двух случаях наказания лиц духовного звания за нарушение безбрачия, а за период 1648—1794 годов в том же Толедо отмечено только десять случаев.
В 1596 году прелат Хуан де Овандо известил толедский трибунал, что францисканец Хуан Корильо не просто живет с женщиной, а сочетался с ней браком. Если первое было для священников и монахов не такой уж большой редкостью и строго наказывалось, как мы уже говорили, далеко не всегда, то второе, безусловно, было событием из ряда вон выходящим, ибо в нем — с тех пор, как протестантские священники стали жениться, — можно было углядеть лютеранскую ересь. Следствие доказало, однако, что это обыкновенное сожительство, и инквизиция передала дело на рассмотрение прелатам францисканского ордена.
С какого-то момента инквизиция вообще стала смотреть на конкубинат как на преступление, которое ее не касается. Когда служитель инквизиции Хаиме Бокка был наказан 12 дукатами штрафа за то, что имел связь с незамужней женщиной, Супрема сделала выговор трибуналу, что он вмешивается не в свое дело. А после того, как в 1506 году севильский трибунал сжег двенадцать человек за «противоестественные преступления» (речь шла о гомосексуальных отношениях. — Прим. ред.), Супрема обвинила его в уклонении от прямых обязанностей, состоявших в искоренении иудейской ереси, и специальным письмом запретила кастильским трибуналам рассматривать дела, которые к ним не относятся.
В Арагонии, однако, трибуналы продолжали расследовать такого рода преступления, а португальская инквизиция считала, что за них следует наказывать смертью или каторгой. Когда инквизитор Эредиа ревизовал в 1597 году трибуналы Барселоны, Вича и Урхеля, он нашел, что из 68 дел 15 касаются обвинения в «противоестественных преступлениях»; впоследствии все эти дела были прекращены. В Валенсии на разных аутодафе в 1598—1602 годах за противоестественные половые сношения осудили 37 человек, из них семь монахов.
На аутодафе в Лиссабоне в 1723 году за «противоестественный грех» был вынесен приговор — десять лет каторжных работ и удары плетьми.
Как бы там ни было, очевидно, что в целом прелюбодеяние, двоеженство, склонение к соитию во время исповеди, мужеложство наказывались гораздо менее сурово, чем неосторожно сказанное слово, которое можно было истолковать как ересь.