Как мы упоминали в предыдущем разделе, в конце первого десятилетия XVI в. Тюменское ханство исчезает со страниц истории, и его место занимает новое государственное образование — Искерское княжество Тайбугидов, которое в русских источниках именовалось чаще всего «Сибирским царством».
Тайбугидское княжество представляло собой относительно слабое государственное образование, фактически — непрочный конгломерат сибирско-татарских улусов и угорских племенных княжеств, возглавленный беком из рода Тайбугидов.
Род Тайбугидов был, несомненно, местного, сибирско-татарского происхождения. Родословные предания сибирских татар, сохранившиеся в сибирских летописях или зафиксированные Г.Ф. Миллером, называют основателем этого рода некоего Она (Онсома), жившего на Ишиме в первой половине XIII в. (летописи называют его современником Чингис-хана). По мнению Г.Л. Файзрахманова, ранние Тайбугиды — Онсом и Тайбуга — были правителями процветавшего в XIII в. в Западной Сибири Ишимского ханства, однако данное мнение не находит никакого подтверждения в сохранившихся источниках и остается умозрительной конструкцией. Реальных сведений не только об истории, но и о самом факте существования Ишимского ханства в источниках нет.
Сын Она Тайбуга считался основателем Тайбугидского княжества; по предположениям ряда исследователей, вероятнее всего, «тайбуга» — не имя, а титул правителя этого сибирско-татарского улуса. По преданиям, сын Тайбуги Ходжа (Ходша) имел владения с центром в городке Кызыл-Туре у слияния Ишима и Иртыша; после Ходжи владения Тайбугидов унаследовал Мар, который был убит неким «казанским ханом Упаком», сыновья Мара Адер и Абалак погибли в казанском плену, но власть в улусе Тайбугидов перешла к сыну Адера Мухаммаду, основавшему Искер и отомстившему за смерть отца (по летописи, Мухаммад убил Упака).
Шеджере (родословие) Тайбугидов, зафиксированное в различных вариантах в Есиповской, Строгановской и других сибирских летописях, а также в «Истории Сибири» Г.Ф. Миллера, имеет единственный хронологический ориентир: предок Тайбугидов. Он жил в первой половине XIII в. Легко определяется и вторая опорная точка в хронологии Тайбугидов: единственным кандидатом на роль «казанского царя Упака» выступает правитель государства Сибирских Шейбанидов Саййид Ибрахим(Ибак)-хан — именно его убил Мухаммад-бек Тайбугид в конце 1494 — начале 1495 г. Таким образом, получается, что за период приблизительно в 275 лет (1220–1495) сменилось шесть поколений Тайбугидов. Многочисленные исследования по генеалогии, в том числе и тюркских народов, показывают, что в среднем происходит смена пяти поколений в столетие. Наиболее вероятным решением проблемы тайбугидской родословной является предположение, что в источниках были утрачены средние звенья родословной, тем более, что к моменту записи шеджере род Тайбугидов прекратил существование, а народные предания сохранили лишь имена предков-основателей рода (Она и Тайбуги) и имена князей Искерского княжества конца XV — первой половины XVI в. Возможно и иное толкование текста шеджере: родословная Тайбугидов искусственно растянута с целью привязки ее к столь значимому событию, как монгольские завоевания начала XIII в. К настоящему времени вопрос остается открытым. Достоверно можно предполагать только, что уже в первой половине XV в. Тайбугидское княжество с центром в Кызыл-Туре существовало и было подчинено Саййид Ибрахим-ханом, сохранившись в качестве зависимого владения. При этом хочется отметить, что, вероятно, в XIV в., правители Тайбугидского княжества приняли ислам: свидетельством являются имена его правителей — Мар (Умар), Ходша (Ходжа), Адер (Хайдар), Мухаммад. В конце XV в. этим княжеством правил Мухаммад-бек, который перенес центр владения из Кызыл-Туры в Искер (Сибирь, Кашлык).
К сожалению, история Тайбугидского государства вплоть до середины XVI в. остается практически неизвестной. Единственными «летописными» актами Мухаммад-бека были основание Искера и убийство Саййид Ибрахим-хана.
Искер, по данным археологии, существовал и до правления Мухаммад-бека, — по крайней мере, с начала XV в.; вероятнее всего, Мухаммад просто перенес резиденцию тайбугидского князя в данный укрепленный пункт. Точное название тайбугидской столицы также неизвестно. Различные источники называют этот город «Кашлык», «Искер», «Сибирь» или «Старая Сибирь». Наиболее вероятно, что название этого городка было «Кашлык»: под словом «Сибир» или «Ибир» в истории известны центральные районы Сибирского юрта, т. е. земли Среднего и севера Южного Урала и части Западной Сибири, прежде всего древняя Чимги-Тура (близ современной Тюмени) и прилегающие к ней территории. «Искер» (тюрк. Iski, Eski) может быть переведено как «Старый [город]» («Старая [крепость]») и вряд ли может считаться исконным названием столицы Тайбугидов. Скорее всего, название «Искер» в XVI в. стало разговорным наименованием города-крепости Кашлыка (так же как и тюркское разговорное «Istanbul» [от греч. eistinpolin — «в город»] заменило официальное турецкое название Константинополя — «Куастантинийа»), в то же время название «Сибирь» для города было обычным наименованием столицы по названию страны.