Несмотря на глубокую разницу в характерах, долг сына перед отцом был не менее велик. Он, несомненно, унаследовал некоторые черты Марка: его художественное чувство и дар черчения, отказ признать поражение при столкновении с какой-либо технической проблемой и, самое главное, его скрупулезное внимание к деталям. Помимо всего прочего, в начале своей карьеры он, несомненно, получил огромную пользу от блеска, который его отец уже придал имени Брунеля, а также от помощи, примера и опыта выдающихся друзей, которых отец приобрел в обществе и в инженерной профессии. Мы можем лучше оценить это в свете истории жизни Марка и того обучения, которое он смог дать своему сыну.
Марк Изамбард Брюнель родился 25 апреля 1769 года в маленькой деревушке Акевиль на богатой равнине Вексин в Нормандии. Здесь его семья владела "Фермой Брюнеля" в качестве арендаторов с непрерывным наследованием по мужской линии в течение трехсот тридцати лет. Они имели статус, эквивалентный статусу достаточно преуспевающих фермеров в Англии, и, как показывают вместительные конюшни и каретные домики их фермы, они обладали наследственной привилегией контролировать почтовые перевозки в округе. Как это часто бывало в Англии, в то время как старшие сыновья становились преемниками отцов, младших, если они проявляли достаточный ум, готовили к священству - и именно это призвание было уготовано Марку. С этой целью его отправили сначала в соседний колледж в Жизоре, а затем в семинарию святого Никеза в Руане, где он не по своей воле надел черную сутану. Юного Марка совсем не тянуло к церкви. Проявляя недюжинные способности к рисованию и математике, он терпеть не мог латынь и греческий, а во время каникул охотился в деревенской столярной мастерской. Совершенно очевидно, что у него были сильные творческие наклонности, которые в Англии даже в это время могли бы горячо поощряться. Но влияние промышленной революции еще не коснулось сельской Нормандии, и его отец, Жан Шарль, не видел для такого таланта иного будущего, кроме какого-нибудь занятия, настолько рутинного, что это было бы ниже достоинства семьи. Поэтому он всеми доступными ему способами, включая жестокие наказания, пытался заставить мальчика принять традиционное призвание. Именно директор Сен-Никеза поощрял дарования Марка и в конце концов убедил Жана, что его сын не предназначен для священства. Покинув Сен-Никез, он отправился жить к другу и родственнику Брюнелей, Франсуа Карпантье, американскому консулу в Руане и отставному морскому капитану, который взялся подготовить его к службе на флоте с помощью месье Дюланя, авторитета в области гидрографии.
Кроме архитектуры, которую он с удовольствием рисовал, в Руане было мало интересного, чтобы подпитать энтузиазм Марка. Но однажды, когда он осматривал набережную, его воображение разыгралось при виде двух огромных чугунных цилиндров, которые только что были высажены на причал. На его взволнованные вопросы он получил ответ, что это часть новой "пожарной" машины для откачки воды и что они прибыли из Англии. "Ах!" - воскликнул он. "Когда я стану великим, я посмотрю эту страну". Тогда он еще не знал, какие превратности и приключения ожидают его на пути к исполнению этого желания.
Получив заказ от морского министра с помощью месье Дюланя, Марк Брюнель поступил на корвет Le Maréchal de Castries и в 1786 году отправился в Вест-Индию в качестве "почетного волонтера". Как подмастерья по окончании обучения должны были создать "шедевр", так и Марк в доказательство своих способностей сделал для себя небольшой квадрант из черного дерева, которым пользовался на протяжении шести лет службы в море.
Грозовые тучи Революции нависли над Францией, когда Марк, расплатившись с кораблем, оказался в Париже в январе 1792 года. Он был и до конца жизни оставался ярым роялистом, и в результате смелого, но неосторожного замечания в кафе был вынужден бежать из города, найдя временное убежище у своего старого покровителя, капитана Франсуа Карпантье, в Руане, где роялистские симпатии были еще сильны и где он стал членом лоялистской гвардии. Именно здесь он впервые встретил свою будущую жену Софию. Дочь Уильяма Кингдома, военно-морского подрядчика из Плимута, она была сиротой, младшей из шестнадцати детей, и старший брат и опекун отправил ее учить французский язык с Карпантье. София была очень привлекательной и образованной девушкой, и ее милости сразу же пленили восприимчивого Марка. Сначала его ухаживания пресекала ревностная сопровождающая Софии, мадам Карпантье, но молодой роялист, живущий в непосредственной опасности и участвующий, как член гвардии, в частых стычках с республиканской толпой, создавал романтическую фигуру, перед которой было нелегко устоять. Любовь процветает в такой атмосфере риска и напряжения, и однажды ночью, после особенно серьезного столкновения на улицах Руана, Марк и София признались друг другу в любви.