Юный Изамбард начал проявлять талант к рисованию, когда ему было всего четыре года, а к шести годам освоил Евклида Столь раннее проявление наследственного таланта явно восхитило Марка, и он решил развивать его по мере своих возможностей. Сначала он отправил его в школу-интернат доктора Морелла в Хоуве, где мальчик в свободное время развлекался тем, что делал обзор города и зарисовывал его здания, как это делал его отец в юности в Руане. Марк всегда настаивал на том, что эта привычка рисовать так же важна для инженера, как и знание алфавита, и, несомненно, именно благодаря этому у отца и сына развилась такая необычайно острая наблюдательность. Их дар мгновенно обнаруживать ошибки в дизайне или исполнении был столь необычен, что непосвященным иногда казалось, что они обладают вторым зрением. "Я думаю, вы не рискнете зайти на этот мост, если не хотите нырнуть", - так прокомментировал Марк, взглянув на чертеж первого висячего моста М. Навье через Сену в Париже, а через несколько дней он узнал, что мост рухнул. В другой раз, когда он вместе с Ричардом Бимишем проходил мимо недавно построенного склада в Дептфорде, он вдруг ускорил шаг, воскликнув в некотором волнении: "Идем, идем; разве ты не видишь, разве ты не видишь?" - и в ответ на недоуменный вопрос своего друга указал на здание: 'There! Разве ты не видишь? Оно упадет! На следующее утро здание лежало в руинах. Точно таким же образом юный Брюнель поразил остальных мальчиков, успешно предсказав падение части нового здания, которое возводилось напротив его школы в Хоуве.
Отдых в Lindsey Row до "Несчастья", должно быть, был действительно приятным. Дом № 10 напоминал о былом великолепии набережной деревни Челси, ведь он являлся частью старого Линдси-Хауса, построенного сэром Теодором Майерном, врачом Якова I, и перестроенного лордом Линдси, лордом-камергером Карла II. В той части, которую занимали Брунели, сохранилась оригинальная парадная лестница, а просторные комнаты с широкими каминами из мрамора и порфира стали идеальным местом для рождественских вечеринок или вечеринок в честь Двенадцатой ночи, когда молодые люди танцевали, а старшие играли в вист. Две мисс Брунели к тому времени только что окончили школу, и их описывают как "образцы всего, чем должны быть молодые леди", но их младший брат был куда менее сдержан. Всякий раз, когда намечалась вечеринка или какая-нибудь игра или шарада, он был вожаком; он любил прогуливаться по верху садовой стены, чтобы пошутить и посплетничать с мисс Маннингс, жившей по соседству. Летом он купался в реке со ступенек под домом, а увлекательные экскурсии в город, тогда еще далекий от сельской тишины Челси, почти всегда совершались на лодке.
Когда сыну исполнилось четырнадцать лет, Марк Брюнель отправил его сначала в колледж Кан в Нормандии, а затем в парижский лицей Анри-Кватер, который в то время славился своими преподавателями математики. Наконец, его континентальное образование было завершено периодом ученичества у Луи Бреге, изготовителя хронометров, часов и научных приборов. Этот последний шаг отражает правильность суждений Марка. Он не смог бы найти более тонкого или более критического воспитателя для механических талантов своего сына. Как Генри Модслей был для станкостроения, так Авраам Луи Бреге был для часового дела, и большинство часовых мастеров считают его высшим мастером в этой области. Более того, как и Модслей, он стал отцом целой школы мастеров, которые впоследствии с гордостью называли себя "Élève de Breguet".
Возможно, мальчик уже приобрел некоторый интерес к часам от Софии, ведь ее мать была невесткой Томаса Маджа, изобретателя рычажного спуска и одного из величайших часовых мастеров своего времени. Когда миссис Кингдом с большой семьей овдовела в Плимуте, Мадж работал там над своим морским хронометром, так что, вполне возможно, он ей помог. Одним из сокровищ Софии Кингдом, которое ее сын унаследовал и передал своим потомкам, были одни из двух часов на кронштейне с рычажным спуском, которые Мадж когда-либо делал. Он бы еще больше ценил это наследие, поскольку служил такому великому мастеру, как Бреге.
Ему повезло, что он был знаком с таким мастером, ведь Бреге был почти на исходе жизни. Он родился в Невшателе в 1747 году и умер в 1823 году, оставив свое дело сыну, Луи Антуану. Строгие стандарты качества, на которых Брюнель настаивал всю свою жизнь и которые проявляются в превосходном качестве его часов и инженерных инструментов, многие из которых он сделал или отремонтировал сам, несомненно, были сформированы в это время. О том, что старый часовщик высоко ценил своего ученика, свидетельствует письмо, которое он написал Марку о нем 1 ноября 1821 года. "Я чувствую, - пишет он, - что важно культивировать в нем все те изобретательские склонности, которые он имеет от природы или от образования, но которые будет очень жаль потерять". Живя в стесненных обстоятельствах и помня о своем недавнем пребывании в тюрьме Королевской скамьи, София Брюнель не без основания противилась мысли о том, что ее единственный сын будет заниматься опасной профессией своего отца, но такая дань уважения и такой совет от столь выдающегося мастера, как Бреге, заставили ее замолчать, а ее муж, надо ли говорить, был в восторге.