Мистер Брюнель говорил мне о корабле длиной 1000 футов во время строительства "Великобритании" и в то же время выразил свою неприязнь к старомодному способу обрамления кораблей. Он хотел бы расположить все каркасы в том направлении, в котором расположены диагональные ленточные линии в каркасе деревянного корабля, и этот план каркаса он осуществил на великом корабле, и он осуществил почти все, что предлагалось тогда, и я совершенно уверен, что все заслуги в создании всех механизмов на этом корабле принадлежат мистеру Брюнелю.....
На дознании Рассел отрицал свою ответственность за лопастные двигатели. Конечно, он не может сказать, что сдал эти двигатели в несовершенном состоянии. Он называет испытанием поворот колес три или четыре раза у причалов! У меня есть опыт пробных поездок с 1817 года, когда я впервые занялся пароходством. Двигатели всегда проверялись должным образом.
Тем временем "Грейт Истерн" проходил ремонт в Уэймуте, который включал в себя демонтаж нагревателей питательной воды. Директора одобрили этот шаг, поддавшись сильному общественному предубеждению против них, которое, хотя и было совершенно необоснованным, но заявление Рассела на дознании не вызвало неестественных эмоций. Это была печальная ошибка. Мало того, что тепловая эффективность сильно пострадала, но, как позже отметил Гуч в своем дневнике, когда корабль сильно набирал ход, жара в салонах становилась почти невыносимой. Закончив ремонт, "Грейт Истерн" отплыл в Холихед, но к тому времени считалось, что год уже слишком поздний, чтобы совершить первый рейс в Нью-Йорк, поэтому на зиму судно вернулось в Саутгемптон-Уотер. Здесь злосчастная судьба, которая, казалось, преследовала великий корабль, нанесла еще один удар. Капитан Харрисон утонул, когда его судно было опрокинуто внезапным шквалом, когда он сходил на берег со своего корабля. Его сменил капитан Вайн Холл.
Джон Скотт Рассел занял место Брюнеля на посту инженера Компании, но его пребывание на этом посту было недолгим; в том, что касается "Грейт Истерн", он успел сделать последний выстрел, поскольку взгляды, высказанные Уильямом Гаррисоном, были широко распространены. Спор между Расселом и компанией по поводу ответственности за лопастные двигатели затянулся и стал еще более ожесточенным из-за того, что стоимость оснащения намного превысила самые пессимистичные ожидания. Несмотря на эти расходы, состояние корабля оставалось неудовлетворительным: по возвращении из Холихеда несчастной компании был предъявлен грозный список требований Торгового совета. Слишком поздно директора Great Ship Company с горечью осознали, что во многом сами виноваты в случившемся, снова наняв Рассела и не прислушавшись к совету своего инженера, составившего абсолютно непроницаемый контракт. Влиятельная группа акционеров во главе с сэром Бенджамином Хоузом и директором Магнусом считала так же, и циркуляр, который Рассел разослал акционерам в порядке самозащиты, похоже, мало что изменил. На специальном собрании 7 января 1860 года сэр Бенджамин созвал комитет по расследованию дел компании и, в частности, обстоятельств, связанных с заключением контракта со Скоттом Расселом. Начались волнения, которые один из репортеров описал как: "жаркая дискуссия, изобилующая личностями". Однако после двух перерывов был назначен комитет, которому было поручено выяснить: "Были ли условия контракта с мистером Джоном Скоттом Расселом разумными, и, прежде всего, выяснить, каким образом 346 000 фунтов стерлингов были потрачены на корабль, который все еще не пригоден для плавания".
Вероятно, не по вине членов комитета его отчет оказался довольно скудным. Как и следовало ожидать, они сетовали на то, что свидетельства противоречивы и что у них не было возможности получить доказательства под санкцией судебного процесса. Тем не менее, они "придерживались мнения, что мистер Магнус, выступая против контрактов, заключенных с мистером Джоном Скоттом Расселом... руководствовался добросовестным желанием отстаивать интересы компании". Это было слабое заявление, но его публикация на сайте в феврале послужила сигналом к тому, что директора дружно ушли в отставку и был избран совершенно новый совет директоров, в который вошел Дэниел Гуч. Первым действием совета стало увольнение Скотта Рассела и назначение Гуча инженером. Еще 100 000 фунтов стерлингов были собраны в виде долговых обязательств, чтобы подготовить корабль к выходу в море, Гуч отправился в Саутгемптон, чтобы руководить работами, и 17 июня "Грейт Истерн" отплыл в Нью-Йорк с Гучем и его семьей на борту.