С тех пор связи в сфере безопасности между двумя странами постоянно расширяются. Соединенные Штаты начали размещать военные запасы в Израиле в 1989 году, а в 2006 году Конгресс проголосовал за увеличение этих запасов с примерно 100 миллионов долларов до 400 миллионов долларов к 2008 году.56 Эта политика оправдывалась как способ повысить способность Пентагона быстро реагировать на региональный кризис, но на самом деле размещение американских грузов в Израиле - неэффективный способ подготовки к чрезвычайным ситуациям, и Пентагон никогда не проявлял энтузиазма по поводу этой политики. По словам Шая Фельдмана, бывшего главы Института стратегических исследований Яффе при Тель-Авивском университете, "нынешние договоренности позволяют хранить только те материалы, которые в случае необходимости могут быть использованы израильскими войсками". По мнению специалистов Пентагона , это означает, что Соединенные Штаты не могут быть абсолютно уверены в том, что оружие и боеприпасы, хранящиеся в Израиле, будут доступны в кризисной ситуации. Более того, такое "двойное назначение" означает, что вместо хранения оружия и боеприпасов для заранее назначенных американских подразделений, оружие придется распределять из общих запасов в кризисных условиях, а затем интегрировать в различные боевые подразделения, создавая логистический кошмар".57 Настоящей целью программы создания запасов является увеличение запасов материальных средств Израиля, и неудивительно, что Ynetnews, новостная веб-служба, связанная с израильской газетой Yedioth Ahronoth, сообщила в декабре 2006 года, что "большая часть американского оборудования, хранящегося в Израиле... была использована для боевых действий во время войны в Ливане летом [2006 года]".58
Опираясь на другие рабочие группы, созданные в 1980-е годы, США и Израиль в 1996 году учредили Совместную рабочую группу по борьбе с терроризмом и организовали электронную "горячую линию" между Пентагоном и Министерством обороны Израиля. Еще больше укрепив связи между двумя государствами, Израиль в 1997 году получил доступ к американской спутниковой системе предупреждения о ракетном нападении. Затем, в 2001 году, два государства учредили ежегодный "межведомственный стратегический диалог" для обсуждения "долгосрочных вопросов". Работа последнего форума была временно приостановлена во время спора о продаже Израилем американских военных технологий Китаю, но в ноябре 2005 года он возобновился.59
Как и следовало ожидать, американо-израильское сотрудничество в области безопасности распространяется и на сферу разведки. Сотрудничество между американскими и израильскими спецслужбами началось еще в конце 1950-х годов, а к 1985 году две страны подписали около двух десятков соглашений об обмене разведывательной информацией. Израиль предоставил Соединенным Штатам доступ к захваченному советскому оружию и сообщениям эмигрантов из советского блока, а Соединенные Штаты предоставили Израилю спутниковые снимки во время Октябрьской войны 1973 года и перед освобождением заложников в Энтеббе в 1976 году, а также, по сообщениям, помогли профинансировать несколько операций израильской разведки в Африке.60 В начале 1980-х годов Соединенные Штаты даже предоставили Израилю доступ к некоторым видам разведывательной информации, в которой они отказывали своим ближайшим союзникам по НАТО. В частности, Израиль, по сообщениям, получил практически неограниченный доступ к разведданным со сложного разведывательного спутника KH-11 ("не только информацию, но и сами фотографии", по словам главы израильской военной разведки), в то время как доступ Великобритании к тому же источнику был гораздо более ограниченным.61 Доступ к этим данным был ограничен после израильского налета на иракский реактор в Осираке в 1981 году, но первый президент Буш, как считается, разрешил передачу спутниковой информации об иракских атаках "Скад" в режиме реального времени во время войны в Персидском заливе в 1991 году.62