Особенный интерес избирательной гонке придавала критика КПРФ и лично Зюганова со стороны союзников по левому флангу. Так, 5 октября 2003 года в программе «Вести недели» авторы сюжета, посвященного траурным акциям в честь десятилетия октябрьских событий 1993 года, не преминули напомнить лидеру Компартии РФ о призывах не выходить на защиту Дома Советов в пресловутом телеобращении 2 октября 1993 года. Упрек в его сторону прозвучал в сюжете из уст Анатолия Крючкова (в прошлом руководителя Российской партии коммунистов, объединившейся с РКРП) и журналиста Надежды Гарифуллиной. В следующем 2004 году, выйдет ее многостраничный труд «Анти-Зюгинг. Зюгановщина, как оборотная сторона горбачевщины».
Андрей Караулов летом 2003 года так же мобилизовал свою программу «Момент истины» на «троллинг» КПРФ, пригласив в один из выпусков таких ярких представителей несистемного коммунистического движения, как организатор РКСМ Игорь Маляров и первый секретарь РКП-КПСС Алексей Пригарин.
Из представителей РКРП-РПК депутатом Государственной думы удалось тогда стать лишь первому секретарю партии Виктору Тюлькину.
Необходимо также отметить, что подобная «свобода» в выборе политических союзников для КПРФ, равно как и для других парламентских партий, прекратилась главным образом после тех думских выборов. Впоследствии она сменилась «сурковским фильтром» – подачей списков кандидатов в Государственную думу на согласование в Администрацию президента для выбраковки всех «лишних» людей.
Именно в те годы Кремль, судя по всему, пришел к выводу, что держать под полным контролем и так управляемую парламентскую «оппозицию» возможно посредством введения системы государственного финансирования прошедших в Госдуму партий, что и было сделано в следующем 2004 году.
Захват заложников в североосетинском городе Беслан 1 сентября 2004 года и его трагическая развязка, стали очень подходящим поводом для ликвидации прямых выборов глав субъектов федерации. И опять же этот решительный шаг правящего режима в сторону абсолютной и бесконтрольной авторитарной власти нашел негласную поддержку со стороны значительной части «системных левых» из Госдумы, из числа любителей «сильного государства». Кстати, к этому времени поддержанные и избранные от КПРФ губернаторы и главы республик, уже успели скинуть красные одеяния, побросать красные лишь по цвету партбилеты, и переметнуться в партию власти – «Единую Россию».
Сразу после оформления в 2001 году партии правящей бюрократии «Единая Россия», начался приток в ее ряды вчерашних «красных губернаторов» и «красных депутатов», избранных или поддержанных КПРФ. Некоторые из них до сих пор составляют «цвет путинской России». Это и латифундист экс-губернатор Краснодарского края Александр Ткачев, и единорос-депутат Госдумы Игорь Игошин, и беспартийный Сергей Глазьев, бывший советник Путина по экономике.
В эти же годы набирает обороты молодежное ультралевое движение. Под влиянием несистемных «комсомолов», таких как РКСМ (б), АКМ и даже Национал-большевистской партии Эдуарда Лимонова (ныне запрещенной в РФ), радикализируется отчасти даже зюгановский СКМ, а также молодые партийцы КПРФ.
Ярким тому подтверждением, служат два беспрецендентных для сегодняшнего дня примера, как это бы сейчас назвали, «левого акционизма». Речь идет о двух удачных попытках водружения государственного флага СССР в самом центре Москвы над административными зданиями: 9 мая 2002 года над вестибюлем станции метро «Лубянка» (прямо напротив здания ФСБ) и 7 ноября 2003 года над Государственной думой РФ.
Оба этих эпизода связаны с именем Армена Бениаминова, члена КПРФ, помощника одного из депутатов Госдумы. И если первое водружение молодому коммунисту ровным счетом ничего не стоило, то акция 7 ноября 2003 года обернулась его избиением сотрудниками ФСО, и возбуждением уголовного дела по статье об оскорблении государственных символов РФ (при поднятии флага СССР, Бениаминовым был снят с флагштока здания ГД РФ «демократический» триколор).
Спустя несколько лет после упомянутых событий, дабы лишний раз напомнить всем «дорогим россиянам», кому принадлежит сегодня Россия, над парадным входом в Государственную думу был установлен позолоченный двуглавый орел. Прямо под возвышающимся над крышей здания барельефом герба СССР, который до сих пор мозолит глаза декоммунизаторам с Охотного ряда.
Выборы в Государственную думу 2003 года оказались для «народно-патриотических сил» откровенно провальными: по официальным данным, КПРФ получила всего 12,61 % голосов по партийным спискам, и провела всего 12 депутатов в одномандатных округах. В совокупности это дало коммунистам 52 места в нижней палате парламента.