В Хогвартсе Ремус показал себя талантливым учителем: он отлично знал свой предмет и отличался глубоким пониманием своих учеников. Как обычно, он уделял особое внимание аутсайдерам, а потому как Невилл Лонгботтом, так и Гарри Поттер сильно выиграли от его мудрости и доброты.
Однако здесь опять проявился старый недостаток Ремуса. Он испытывал серьезные подозрения по поводу одного из своих старых друзей, сбежавшего из тюрьмы, но ни с кем не поделился этими подозрениями в Хогвартсе. Его отчаянное желание быть своим, быть любимым означало, что он не проявил достаточно храбрости и честности, которые был обязан проявить.
По неудачному стечению обстоятельств Ремус претерпел полное вервольфово превращение на территории школы. Неприязнь к нему Северуса Снейпа, так и не исчезнувшая, несмотря на уважительную вежливость Ремуса, была причиной того, что натура учителя по защите от темных сил стала известна широкому кругу людей. Ремус счел своим долгом подать в отставку и вновь покинул Хогвартс.
Женитьба
Пока Лорд Волдеморт вновь набирал силу, ранее состоявшие в сопротивлении к нему вновь объединились, и Ремус еще раз оказался членом Ордена Феникса.
В этот раз в его составе была женщина-аврор, которая была слишком молода, чтобы быть членом Ордена в прошлый раз. Умная, храбрая и веселая, розововолосая Нимфадора Тонкс была протеже Аластора "Шизоглаза" Муди, самого стойкого и опытного аврора из всех.
Ремус, так часто бывавший меланхоличным и одиноким, вначале веселился, потом изумлялся, а потом был захвачен обаянием молодой ведьмы. Он никогда раньше ни в кого не влюблялся. Если бы это случилось в мирное время, Ремус просто переехал бы в другое место и нашел себе другую работу, чтобы ему не пришлось стать свидетелем того, как Тонкс влюбится в красивого молодого колдуна в отделе авроров: именно этого он и ожидал. Однако шла война; они оба были нужны Ордену Феникса, и никто не знал, что случится завтра. Ремус чувствовал обязанность оставаться там, где он находится, скрывая свои чувства, но в тайне он радовался каждый раз, когда ему и Тонкс выпадало работать вместе на каком-нибудь ночном задании.
Ремусу ни разу не приходило в голову, что Тонкс может испытывать к нему такие же чувства: он слишком привык считать себя нечистым и недостойным. Однажды ночью, примерно через год после того, как началась их дружба, когда они были в засаде снаружи дома одного известного смертееда, Тонкс сделала ничего не значащее замечание по поводу одного из их товарищей по Ордену Феникса ("Он все еще очень красив, даже после Азкабана"). Перед тем, как он смог остановиться, Ремус с горечью заметил, что она, похоже, влюбилась в его старого друга ("Все женщины всегда достаются ему"). Услышав это, Тонкс внезапно рассердилась. "Ты прекрасно знаешь, в кого я влюбилась: если бы ты не был так занят тем, что жалел себя".
Немедленной реакцией Ремуса было счастье, которого он никогда в своей жизни не испытывал, однако оно почти сразу же потухло, будучи задавлено чувством долга. Он всегда знал, что не сможет жениться и подвергать риску передать свое ужасное и постыдное состояние потомству. Поэтому он притворился, что не понял Тонкс, но это ее не обмануло. Будучи мудрее Ремуса, она была уверена, что он любит ее, но считала, что он отказывается признать это из ошибочного чувства благородства. Однако он постарался избежать совместных заданий с ней, редко разговаривал с ней и стал вызываться добровольцем на самые опасные задания. Тонкс стала безнадежно несчастной, убежденной не только в том, что человек, которого она любит, никогда по доброй воле не будет проводить с ней время, но и что он скорее умрет, чем признается в своих чувствах.
Ремус и Тонкс приняли участие в столкновении с Лордом Волдемортом и его смертеедами в Департаменте тайн, в результате которого возвращение Волдеморта стало известно общественности. Гибель во время этой битвы своего последнего школьного друга никак не смягчила саморазрушительного настроя Ремуса. Тонкс оставалось только в отчаянии наблюдать за тем, как он добровольно вызывается шпионить ради Ордена, живет среди своих соплеменников-вервольфов, пытаясь убедить их перейти на сторону Дамблдора. Делая это, он подвергал себя риску навлечь на себя месть вервольфа, который навсегда изменил его жизнь: Фенрира Грейбэка.