Естественно, что такая директива была санкционирована председателем Реввоенсовета Республики Л. Д. Троцким, которому Вацетис был подотчетен напрямую. Командование Восточного фронта, во главе которого тогда уже стоял С. С. Каменев, опротестовало такие директивные указания. Сам Каменев в своих «Записках о гражданской войне и военном строительстве» рассказывал:
«Наступление на Восточном фронте развивалось вполне успешно. Белогвардейская армия Колчака откатывалась за Уфу, а в это время Главнокомандующий отдал приказ остановиться на реке Белой. Я отказался остановить наступление. Решение вопроса перешло Владимиру Ильичу».
Есть и еще одно авторитетное свидетельство. Командовавший в то время 5-й армией М. Н. Тухачевский после войны писал: «Эта установка Троцкого была встречена в штыки и Восточным фронтом и Центральным Комитетом партии».
Получилось так, что директива стратега Вацетиса напрямую увязывалась с именем Троцкого. Вышедший в свет при жизни И. В. Сталина краткий курс истории ВКП(б) ту ситуацию изложил так:
«В момент разгара наступательных действий Красной армии на восточном фронте Троцкий предложил подозрительный план: остановиться перед Уралом, прекратить преследование колчаковцев и перебросить войска с Восточного фронта на Южный фронт».
Более позднее издание, «Гражданская война в СССР» дает иную трактовку той ситуации, связанной с директивой, автором которой был Главнокомандующий Республики: «План освобождения Урала был реальным. Однако Троцкий и Вацетис преувеличивали трудности предстоящих операций и ставили дальнейшее наступление войск Восточного фронта в зависимость от того, какое количество его частей будет отправлено на другие фронты».
Вокруг директивного приказа Главнокомандующего завязалась нешуточная борьба. 9 июня члены Реввоенсовета Восточного фронта С. И. Гусев (Я. Д. Драбкин), М. М. Лашевич и К. К. Юренев (Кротовский) направили председателю Совнаркома докладную записку, в которой директива Вацетиса называлась ни много ни мало, как «крупнейшей фатальной ошибкой, которая вам может стоить революции». Авторы докладной записки настаивали на отмене директивы. Более того, они указывали, что Главнокомандующий решил остановить наступление войск Восточного фронта и «не двигаться дальше», хотя в директиве о том и не было речи. В Совнаркоме этот документ или не знали, или в него не вчитывались.
Вацетис, в «подтверждение того, что он хочет ослабить» перешедший в наступление Восточный фронт, 10 июня приказал его командующему С. С. Каменеву направить под Петроград 2-ю стрелковую дивизию и на Южный фронт – бригаду 5-й стрелковой дивизии. В довершение всего Главнокомандующий Республики писал, что план комфронта Каменева разгромить Колчака не позже середины осени не отвечает ни общей политической, ни стратегической обстановке.
«Точку» в этом споре в высшем командовании Красной армии поставил… главнокомандующий Вооруженными силами Юга России генерал-лейтенант А. И. Деникин. Он отдал так называемую «московскую директиву», и белые армии в наступлении взломали линию Южного фронта, который так и не получил усиления с Восточного фронта. Вот когда могла пригодиться одна-другая стрелковая дивизия, переброшенная с Урала, где армии Колчака безвозвратно терпели поражения.
Через четыре дня, 8 июля 1919 года, Главнокомандующий Республики бывший полковник И. И. Вацетис был арестован. Впоследствии он чистосердечно писал, что ему тогда причины ареста оставались неизвестны. Ему их просто не объявляли.
То, что его кто-то объявил «врагом трудового народа и советской власти», привело Иоакима Иокимовича в состояние поистине шоковое. Не знал он и другого. Незадолго перед тем черным днем в его биографии заместитель Особого отдела ВЧК И. Н. Павлуновский доложил высшему руководству Республики следующее:
«Следствием установлено, что белогвардейская группа Полевого штаба находилась в первоначальной стадии своей организации, т. е. она только что создавалась, намечала свои задачи и планы и приступила лишь к частичной их реализации, причем была еще настолько невлиятельной, что ее нахождение в Полевом штабе не отражалось на ходе операций на фронтах».
В тот день 8 июля выявленные «заговорщики, еще не успевшие создать свою организацию», были арестованы. Ими оказались работники Полевого штаба Н. Н. Доможиров и Е. И. Исаев, порученцы Главнокомандующего и доверенные его лица.