Лумумба обратился в Организацию Объединенных Наций с просьбой о помощи в изгнании бельгийцев и воссоединении страны. В ответ ООН провела крупнейшую с момента своего создания наземную операцию по стабилизации обстановки в стране, но эти силы не были уполномочены изгонять бельгийские войска. Вместо этого Лумумба обратился за помощью к Советскому Союзу. Возможность того, что Конго, и особенно Катанга, может попасть под советское влияние, заставила Соединенные Штаты, Организацию Объединенных Наций и Бельгию приложить максимум усилий для отправки Лумумбы. 18 августа 1960 года президент Дуайт Эйзенхауэр встретился со своим советом национальной безопасности, чтобы обсудить ситуацию в Конго, и заявил, что США должны "избавиться от этого парня". 5 ЦРУ вынашивало план убийства Лумумбы с помощью зубной пасты, отравленной ядом кобры; вместо этого они остановились на плане вербовки друга Лумумбы и главы армии Джозефа Мобуту для его свержения.
14 сентября 1960 года Джозеф Мобуту объявил, что захватил контроль над правительством. За Мобуту стояла армия, а также материально-техническая и финансовая поддержка США, ООН и Бельгии. Мобуту изгнал все советские войска и посадил Лумумбу под домашний арест. 27 ноября 1960 года Лумумбе удалось бежать. США, ООН и Бельгия предоставили свои разведывательные службы для помощи в его поимке. Около полуночи 1 декабря 1960 года Лумумба был пойман и заключен в тюрьму силами Мобуту. Его сторонники организовали контрнаступление и вскоре заняли половину страны. Прибывшая администрация Кеннеди опасалась, что Лумумба может вернуться к власти, и убедила Бельгию отправить Лумумбу на казнь в их опорный пункт в Элизабетвиле.
16 января 1961 года Патрис Лумумба был доставлен самолетом в Элизабетвиль, отвезен в изолированный особняк и подвергнут пыткам шестью бельгийцами и шестью катангцами, включая Мойзе Тшомбе и его второго командира, Годфруа Мунонго. По иронии судьбы, Мунонго был внуком короля Мсири. В 1891 году бельгийские наемники, посланные Леопольдом, убили Мсири, чтобы захватить контроль над Катангой, а ровно семьдесят лет спустя внук Мсири объединился с бельгийцами, чтобы убить Лумумбу и вернуть Катангу бельгийцам. Промучив Лумумбу несколько часов, Тшомбе и бельгийцы застрелили его. Они разрубили тело на части и бросили их в бочки с серной кислотой. Череп, кости и зубы Лумумбы были измельчены в пыль и разбросаны по дороге обратно, кроме одного зуба, который забрал в качестве сувенира бельгийский комиссар катангской полиции.
АД НА ЗЕМЛЕ: ФЕВРАЛЬ 1961-2022
Когда националистическая угроза была нейтрализована, Организация Объединенных Наций направила войска, чтобы заставить Катангу воссоединиться с Республикой Конго, чего Лумумба никогда не хотел. Каса-Вубу, Тшомбе и другие конголезские лидеры встретились в марте 1961 года, чтобы обсудить будущее страны. Они договорились о создании конфедерации суверенных государств вместо Республики Конго. ООН и США требовали создания единого Конго, и генеральный секретарь ООН Даг Хаммаршельд впоследствии заключил с Каса-Вубу отдельную сделку об отказе от соглашения в обмен на финансовую помощь. Тшомбе почувствовал себя преданным и напал на силы ООН в Катанге. На улицах Элизабетвиля вспыхнула тотальная война. Хаммаршельд прилетел в Элизабетвиль, чтобы выступить посредником в заключении мирного соглашения с Тшомбе, но 18 сентября 1961 года его самолет был сбит во время посадки в аэропорту. Ходят слухи, что Тшомбе приказал совершить нападение.
UMHK продолжала поддерживать независимую Катангу, выплачивая налоги на добычу полезных ископаемых напрямую правительству Тшомбе. Силы Тшомбе сражались с ООН в Катанге еще два года, пока президент Кеннеди не направил американские истребители для поддержки решающего наступления ООН. Тшомбе признал свое поражение 14 января 1963 года. После трех с половиной лет насилия Конго было окончательно объединено, и в мае 1965 года состоялись новые выборы, на которых президентом стал Каса-Вубу. Президентство Каса-Вубу было недолгим - 24 ноября 1965 года Джозеф Мобуту совершил свой второй переворот и полностью взял власть в свои руки.
Мобуту управлял Конго в течение тридцати двух лет так же, как и Леопольд, - с помощью машины личного обогащения. 31 декабря 1966 года он национализировал UMHK и Gécamines и получил в прямое владение несколько горных концессий. Он перекачал миллиарды долларов от экспорта полезных ископаемых на личные банковские счета, став в 1980-х годах одним из десяти богатейших людей мира. 27 октября 1971 года Мобуту переименовал страну в Республику Заир, основываясь на том, что, по его мнению, было первоначальным названием реки Конго во времена королевства Конго, хотя на самом деле это было неправильное написание слова nzere португальским картографом.