2006 (апрель). Организация испытаний экспериментального полярного буера (тримаран на лыжах под парусом) «Современная гуманитарная академия» на восточном побережье Гренландии.
2007 (май). Пересечение Гренландии на собачьих упряжках от восточного побережья (поселок Исорток) через ледовый купол до западного побережья (поселок Иллули-сат), вдоль Полярного круга. Установлен рекорд пересечения Гренландии на этом маршруте — 15 суток и 22 часа.
2007—2008. Участие в австралийской гонке вокруг Антарктиды — Antarctica Cup по маршруту Олбани (Западная Австралия) — мыс Горн — мыс Доброй Надежды — мыс Луин — Олбани (Западная Австралия), в категории «яхтсмен одиночка», нон-стоп. Макси-яхта «Торговая сеть „Алые паруса"» — 102 суток.
2009 (весна). 13 мая 2009 в столице Монголии Улан-Баторе стартовал II этап международной экспедиции «По следам Великого Шелкового пути — 2009» по маршруту Монголия — Калмыкия (Элиста).
2011 (весна). Экспедиция «Девять высочайших вершин Эфиопии».
19 мая 2012 в составе российской команды «Семь вершин» Федор Конюхов совершил восхождение на вершину Эвереста по Северному хребту (со стороны Тибета). Федор Конюхов стал первым священником Русской православной церкви, совершившим восхождение на Эверест.
2013 (апрель — май). Совместно с Виктором Симоновым (Республика Карелия, Петрозаводск) пересек Северный Ледовитый океан на собачьей упряжке по маршруту: Северный полюс — Канада (остров Уорд-Хант). Старт 6 апреля, финиш 20 мая 2013 года.
2013—2014 (декабрь — май). Совершил Тихоокеанский переход на весельной лодке от континента до континента, без заходов в порты, без посторонней помощи за рекордное время — 160 дней по маршруту Чили (Кон-кон) — Австралия (Мулулуба), преодолел 9400 морских миль (17 408 километров).
2015 (март). Установление российского рекорда по продолжительности полета на тепловом аэростате «Бинбанк» класса АХ-9 объемом 3950 кубических метров — 19 часов 10 минут.
2016 (январь) Установление мирового рекорда продолжительности полета на тепловом аэростате «Бинбанк» объемом 3950 м3 — 32 часа 20 минут.
2016 (февраль). Совместная экспедиция с Виктором Симоновым на собачьих упряжках «Онежское Поморье — 2016». Пройдено 800 км по маршруту г. Петрозаводск, Республика Карелия (национальный парк «Водло-зерский») — г. Северодвинск, Архангельская область (национальный парк «Онежское Поморье»).
2016 (июль). Совершил одиночный кругосветный полет на воздушном шаре «МОРТОН». Даты полета: 12—23 июля. Самый быстрый кругосветный полет для аэростатов любого типа: 11 дней 4 часа и 20 минут или 268 часов и 20 минут. Абсолютный мировой рекорд (утвержден FAI 18.11.2016). Пройдено расстояние 35 168 км.
2017 (февраль). Установление абсолютного мирового рекорда продолжительности полета на тепловом аэростате «Бинбанк Премиум» — 55 часов 10 минут.
Федор Конюхов отвечает на вопросы
— Как вы переживаете одиночество во время путешествий?
— Я путешествую уже 50 лет — большую часть времени в одиночестве. Когда я отправлялся в свои первые экспедиции, я был молод — и одиночество убивало меня, буквально разрывало изнутри. А сейчас я уже в таком возрасте, когда одиночество не убивает, а только помогает. Я не боюсь его, ведь я верю в Бога. Я знаю, что человек на нашей планете не бывает одинок. Людям надо объяснять, что придет время — и они тоже поймут, что нет одиночества. Всегда кто-то есть рядом — рыбы, птицы, животные, ветер, океан, горы. Это все живое. Если сказать, что люди одни во всей вселенной, — это же с ума можно сойти!
Сложно описать словами, что я чувствовал в те моменты, когда 160 дней плыл один в лодке. Этого не объяснишь. Это как любовь — все чувствуют, но никто не может найти определения. Человек должен сам пройти через все — и через страх одиночества тоже. Но я точно знаю, что в эти моменты рядом со мной всегда кто-то присутствовал. Тот, кого я знаю, люблю, прошу, — те святые, которым я молюсь.
Вот недавно мы совершили путешествие вокруг Земли на воздушном шаре «Мортон». Рано утром мы накачали воздух, и я первый раз увидел это шар, он был огромный и такой красивый. И когда я залез в гондолу, то посмотрел сверху на жену, детей и внуков, которые приехали провожать меня. Народу собралось много, все на меня смотрели. А я залез внутрь — и тут же почувствовал, что здесь Николай Чудотворец, Иисус Христос, Матерь Божья и мой дед Николай Конюхов, который был священномучеником. И тут же страх меня отпустил — при них просто неудобно вылезти с кабины! И тогда я свесился по пояс из гондолы и закричал: «Обрезай! Обрезай!». А все думали, что я буду махать на прощание, волноваться... Но я-то знаю, что возле меня Николай Чудотворец — и мне уже никто больше не нужен в этом полете. Но только в полете, а так я людей люблю.