Как правило, в показания командующих приграничными военными округами следователи вписывали положения об участии совместно с партийно-советским активом в различного рода националистических организациях.
Командующий Харьковским военным округом Дубовой «признался» в том, что входил в состав националистической организации и что его деятельность была составной частью военно-фашистского заговора на Украине (см. также Док. №№ 12, 21, 31). Конечной целью участников «националистического заговора» являлось отделение Украины от СССР.
Командованию Красной Армии различных уровней в «контрреволюционных правотроцкистских» организациях отводилась роль силовой составляющей в процессе «подготовки» государственного переворота. Во «Временном центральном Сибирском правительстве», которое якобы хотели создать в Восточно-Сибирском крае Разумов и арестованная вместе с ним значительная часть партийно-советской номенклатуры, на роль военного министра намечали бывшего командующего ЗабВО И.К. Грязнова (ЦА ФСБ России. АСД Р-23498. Т. 1. Л. 38).
Для того чтобы скомпрометировать высший командный состав, использовались всевозможные факты контактов с иностранцами.
В 1936 г. командующий ЛВО командарм II ранга П.Е. Дыбенко в разговоре с военным атташе из США покритиковал американские порядки (см. Док. №№ 35, 37). Он заявил, что его сестра нищенствует в Америке. Ее муж получил увечье на работе, и она с детьми не получает никаких денег. Военный атташе пообещал узнать суть дела. Вскоре сестра Дыбенко стала получать пособие (АП РФ. Ф. 3. Оп. 24. Д. 311). А 25 января 1938 г. было принято постановление Политбюро ЦК ВКП(б), в котором отмечалось, что Дыбенко имел «подозрительные связи с некоторыми американцами, которые оказались разведчиками, и недопустимо для честного советского человека использовал эти связи для получения пособия живущей в Америке своей сестре» (Там же. Д. 330. Л. 113). Сталин использовал и опубликованное в эмигрантской прессе сообщение о том, что Дыбенко являлся немецким агентом.
Среди различных заговоров, которые «раскрывались» органами государственной безопасности в период массовых репрессий, важное значение придавалось ликвидации последствий «вредительства» в собственном ведомстве, то есть в НКВД. В органах государственной безопасности было несколько волн репрессий.
После намеченного на февральско-мартовском 1937 г. Пленуме ЦК ВКП(б) курса на поиски «вредителей» Ежову необходимо было показать, что он решительно борется в наркомате внутренних дел с «наследием» Г.Г. Ягоды. Резолюция Пленума по НКВД обсуждалась только в оперативных отделах Главного управления государственной безопасности. На Пленуме и в резолюции были приведены примеры об участии сотрудников НКВД в троцкистских организациях. Как правило, их аресты были тесно связаны с репрессиями в отношении партийно-советских работников. В конце 1936 г. в протоколах допросов арестованных секретарей райкомов Азово-Черноморского края С.Х Варданяна и Л.Д. Гогоберидзе были названы фамилии начальников Новочеркасского и Таганрогского горотделов Шаповалова и Баланюка.
Аресты начальников управлений НКВД были связаны, прежде всего, с их предшествующей деятельностью и связями с арестованными партийными руководителями краев и областей. В представленных Сталину сводках к этой группе сотрудников относился начальник 4-го (секретно-политического) отдела УГБ НКВД УССР 0.0. Абугов, ордер на арест которого Фриновский подписал 15 октября 1937 г. (см. Док. №.33). Первоначально отмечались его связи с арестованными сотрудниками НКВД Украины, являвшимися якобы троцкистскими заговорщиками. Показания на Абугова сотрудники НКВД начали давать уже с июля
1937 г. На его судьбу безусловно повлиял тот факт, что в процессе службы он работал в тесном контакте с двумя руководящими работниками НКВД, которые покончили жизнь самоубийством весной и летом 1937 г. после ареста Ягоды и бывшего наркома внутренних дел Украины Балицкого. Первым был начальник УНКВД по Горьковской области М.С. Погребинский, вторым — начальник УНКВД по Харьковской области С.С. Мазо.