К утру стало очевидным, что все находившиеся внутри лодки: заведующий Отрядом подводного плавания в Черном море капитан 2-го ранга Николай Михайлович Белкин 1-й, помощник командира корабля мичман Дмитрий Александрович Тучков, минный кондуктор Фрол Иванович Сальников и 17 человек нижних чинов — погибли. Судя по всему, их смерть была очень быстрой, так как «Камбала» не имела герметичных отсеков, а потому ворвавшаяся в пробоину вода в несколько мгновений заполнила все внутренние помещения подводной лодки.
Из воспоминаний капитана 1-го ранга В. Меркушева: «На следующий день, не приняв необходимых для такой большой глубины предосторожностей, спустили охотников из водолазов, причем один из лучших, Бочкаренко, на другой день скончался от вскипания крови. Дальнейшие спуски пришлось прекратить».
По возвращении эскадры в Севастополь сразу же было назначено расследование всех обстоятельств произошедшей трагедии. К делу о гибели «Камбалы» были привлечены в качестве подозреваемых командир линейного корабля «Ростислав» капитан 1-го ранга Сапсай и бывший уже командир подводной лодки лейтенант Аквилонов.
Пока шло следствие, Аквилонов подал рапорт о своем уходе с флота. Моральное состояние лейтенанта оказалось очень тяжелым, ибо флотская общественность еще до окончания официального результата расследования обвинила его в гибели своих подчиненных. Помимо всего прочего, поползли даже слухи, что Аквилонов чуть ли не специально подставил свою «Камбалу» под форштевень «Ростислава».
Дело в том, что родственники погибшего мичмана Тучкова нашли на его квартире расписку Аквилонова о том, что тот занял у Тучкова весьма значительную сумму денег. Срок займа истекал как раз в конце мая, а денег для возвращения долга у Аквилонова не имелось. Недоброжелатели вспомнили и спасательный жилет Аквилонова, который он якобы надел именно для того, чтобы спастись после того, как подставит под смертельный удар свою субмарину. Разумеется, подобное утверждение следователями было сразу же отвергнуто за своей нелепостью, но отношение к лейтенанту среди флотских офицеров стало нетерпимым. В этой ситуации у Аквилонова оставалось два выхода: пустить себе пулю в лоб или подать прошение об отставке. Он избрал второе. Прошению сразу же дали ход, и еще до окончания следствия Аквилонов был уволен в отставку.
Много ходило тогда разговоров и о предчувствиях мичмана Тучкова. Мистически настроенный юноша якобы в своих разговорах не раз говорил о своей скорой смерти и даже как будто к ней готовился…
Газеты того времени писали о трагедии «Камбалы» всякое. В первое время газетчики писали еще о неких трех членах экипажа, спасшихся с лодки, помимо Аквилонова, которых по какой-то неизвестной причине скрывают от глаз общественности. Однако потом признались, что сами стали жертвой непроверенных слухов.
Чтобы до конца понять ситуацию в момент катастрофы, надо воочию увидеть рубку «Камбалы». Это сегодняшние рубки субмарин столь велики, что на ходовом мостике могут одновременно находится до десятка человек. Рубка же «Камбалы» настолько мала, а верхний люк столь узок, что находиться наверху мог только один человек, да и то в весьма неудобном положении. Никакого верхнего ходового мостика, в классическом его понимании, на «Камбале» просто не существовало. Поднявшийся наверх должен был стоять в срезе узкого люка, причем кормовые сектора обзора были для него практически закрыты верхней частью рубки. Из самой рубки наблюдать было тоже почти невозможно. Обзорные щели в ней столь узки и малы, что в них и в солнечную погоду ничего не разглядишь, не говоря уже о ночном. Глядя сегодня на рубку «Камбалы», не надо иметь особо богатого воображения, чтобы понять: Аквилонов, находясь высунувшимся наполовину из люка и имея неполный обзор в условиях темноты, скорее всего, не успел до конца правильно оценить обстановку не только из-за своей растерянности, но и в силу явных серьезных конструктивных недостатков «Камбалы».
…Наконец следствие по делу гибели подводной лодки «Камбала» было завершено. Главным виновником трагедии подводной лодки был определен лейтенант Аквилонов. Из текста итогового документа следствия по делу о гибели «Камбалы» — доклада по Главному Военно-морскому судебному управлению: «Суд признал, что причиною настоящего несчастного случая была неосторожность лейтенанта Аквилонова, выразившаяся в том, что он прошел с вверенной ему лодкой в слишком близком расстоянии от головного корабля отряда».
Выброшенный в море с ходового мостика во время столкновения, благодаря чему он и остался жив, исполняющий обязанности командира подводной лодки лейтенант Михаил Аквилонов «за неосторожное управление подводною лодкою „Камбала“, имевшее последствием гибель этой лодки и находившихся в ней офицеров и команды», был осужден приговором Военно-морского суда Севастополя. В официальном документе говорится следующее: «№ 946. Ливадия, 27 ноября 1909 года. По Высочайше утвержденному приговору Военно-морского суда Севастопольского порта по делу о гибели подводной лодки „Камбала“ определено: командовавшего названною лодкой, ныне отставного лейтенанта Михаила Аквилонова подвергнуть заключению в крепости на шесть месяцев, без ограничения прав и преимуществ, и предать церковному покаянию по распоряжению духовного начальства.