Вместо этого армия Конфедерации осталась на месте и упустила возможность закончить войну в 1861 году. С наступлением ночи президент Дэвис телеграфировал единственному человеку, который, если бы присутствовал на поле боя, мог бы увидеть здравый смысл в обещании Стоунволла Джексона. "Мы одержали славную, хотя и дорогой ценой победу", - таково было послание Дэвиса Ли. "Ночь застала врага в полном бегстве, и его упорно преследовали".
Действительно, неутомимый полковник Дж. Э. Б. Стюарт продвинул свою кавалерию до Фэрфакс-Корт-Хауса, наступая генералу Макдауэллу на пятки, в десяти милях от Потомака. Стюарт докладывал, что "по эту сторону Александрии нет ни одного войска [Союза]", но было уже слишком поздно. Не хватало только, по словам одного историка, "генерала, который бы понимал все значение победы", но этот человек находился в Ричмонде.
На данный момент Борегар был героем часа на всем Юге, а Джонстон занимал почетную, но второстепенную роль. Несмотря на его ключевую роль в сражении, очередь Стоунволла Джексона оказаться в центре внимания была еще впереди. Тот факт, что победа была организована Ли, не был оценен широкой общественностью. Должно быть, Ли было неприятно осознавать, что в ночь на 21 июля ведомые Дж. Э. Б. Стюарта находились менее чем в десяти милях от Арлингтона, дома Ли.
В Кинлохе Мэри Ли и ее девочки находились достаточно близко к Манассасу, чтобы "слышать слабый, но отчетливый звук канонады" вдалеке, разносившийся в жарком, неподвижном летнем воздухе весь день и вечер 21 июля. На следующий день, под проливным дождем, они увидели, как кареты скорой помощи несут тяжелораненых солдат Конфедерации в соседнее поместье, превращенное в импровизированный госпиталь. Милдред и Мэри Кьюстис вызвались работать там медсестрами, подавляя свой ужас перед зловонием и страшными ранами - ведь раны на поле боя и хирургия были не для слабонервных в те дни, когда врачи еще не знали теории микробов, а у хирургов не было никаких средств лечения, кроме скальпеля и пилы. Раны в голову или туловище считались смертельными, и обычно так и было. Инфекция, если она заносилась, тоже часто приводила к летальному исходу. Для девушек это было грубым пробуждением к реалиям войны.
Они были не одиноки. Хотя потери при Булл-Ране были незначительными по сравнению с великими сражениями, которые предстояли в будущем - чуть менее 3 000 человек со стороны Союза и чуть менее 2 000 со стороны Конфедерации * - сообщение о том, что "мертвые и умирающие покрывают поле", как записала Мэри Чеснат в своем дневнике, пронеслось по Югу так же быстро, как и новость о победе армии Конфедерации. В гостинице "Спотсвуд" в Ричмонде, где миссис Чеснат остановилась вместе с президентом и миссис Дэвис и Робертом Э. Ли, среди постояльцев было много горя. Миссис Чеснат рассказала, как сама миссис Дэвис разбудила жену полковника Фрэнсиса Барстоу. "Бедняжка! [Миссис Барстоу лежала в своей постели. Миссис Дэвис постучала. "Войдите". Увидев, что это миссис Дэвис, она поднялась, готовая вскочить на ноги, но тут в бледном лице миссис Дэвис появилось что-то такое, что выбило из нее жизнь. Она уставилась на миссис Дэвис, а затем отступила назад. Она закрыла лицо рукой. "Это плохие новости для меня? Миссис Дэвис молчала. "Он убит?"... Как только она увидела лицо миссис Дэвис, она поняла все в одно мгновение - она поняла это еще до того, как накинула шаль на голову". На следующий день миссис Барстоу упала в обморок во время похоронной церемонии. "Пустое седло и ведомый боевой конь - мы все это видели и слышали", - писала миссис Чеснат. "И теперь мы никогда не покидаем Мертвый марш в Соле. Он идет и идет, пока мне не хочется заткнуть уши и закричать".
Ли прекрасно понимал, что вокруг него страдают, а также осознавал, что это только начало. На Севере поражение породило новую решимость увеличить численность войск и лучше их обучить. Генерал Макклеллан вскоре должен был прибыть в Вашингтон, чтобы заменить Макдауэлла, а вскоре и престарелого и все более немощного Скотта. На Юге ликование по поводу победы сдерживалось осознанием того, что она не закончила войну. "Не горюй о храбрых мертвецах, - писал Ли Мэри из Ричмонда. "Скорбите о тех, кого они оставили после себя. Первые покоятся. Вторые должны страдать". Написав о победе при Булл-Ране, он сообщил ей, что хотел бы "принять участие в прежней борьбе и сожалеет о своем отсутствии, но президент счел более важным, чтобы я был здесь". Он также сообщил, что наконец-то принимает полевое командование: "Завтра я отправляюсь в Северо-Западную армию. . . . Не могу сказать, надолго ли, но напишу вам".
Как ни рад был Ли оказаться за пределами Ричмонда и командовать войсками, его назначение руководить военными операциями на территории современной Западной Вирджинии было незавидным. Военная ситуация "неуклонно ухудшалась". Силы Конфедерации были разделены на три взаимно антагонистических командования, главное из которых возглавлял бригадный генерал Уильям Лоринг, смелый и опытный профессиональный солдат, потерявший руку в Мексиканской войне. * Он только что прибыл на место скончавшегося генерала Гарнетта. Два других состояли из набранных на месте "легионов", один из которых возглавлял бывший губернатор Генри А. Уайз, а другой - бывший военный министр США Джон Б. Флойд. Политики-соперники, Флойд и Уайз ненавидели друг друга, и оба не желали подчиняться приказам Лоринга, который, по крайней мере, понимал свое дело - ни Флойд, ни Уайз не имели значительного военного опыта, если не считать того, что Флойд подозревался в использовании своего поста военного министра для переброски более 150 000 винтовок и мушкетов и многих тонн тяжелых боеприпасов в арсеналы на Юге после рейда Джона Брауна в 1859 году. Флойд был откровенной помехой в военном деле, а Уайз - и того меньше. Позиция самого Ли была двусмысленной - "у него не было письменных инструкций"; он должен был давать советы по стратегии и пытаться заставить трех генералов сотрудничать друг с другом достаточно долго, чтобы провести атаку; но он все еще не обладал всей полнотой власти главнокомандующего, возможно, потому, что Флойд и Уайз все еще имели политическое влияние, чтобы помешать этому. Президент Дэвис не понимал, как важно однозначно и твердо передать командование в руки одного человека, или, возможно, он все еще считал этим человеком себя. Как бы то ни было, Ли прибыл в Стонтон в качестве миротворца между враждующими генералами - роль, для которой он, по сути, подходил лучше, чем для того, чтобы сшибать головы друг другу. Если у Ли и была какая-то слабость, то это его нелюбовь к открытой конфронтации. Хорошие манеры и мягкое обращение с несогласными с ним людьми были для Ли инстинктивными, но не всегда эффективными.