Одновременно были выключены все навигационные огни, произведено полное затемнение, повышена готовность к открытию огня батарей береговой обороны и зенитных, выставлен корабельный дозор в районе восточных и западных островов и к югу от Руссаре. В 3.30 катер МО-313 вышел в дозор западнее острова Руссаре.
Самолеты и торпедные катера были рассредоточены и замаскированы. Катерам установлена готовность — 15 минут. На складах и в отделах тыла установлено круглосуточное дежурство.
Около часу ночи 22 июня посты СНИС Ханко обнаружили три неизвестных больших корабля, идущих курсом от острова Хиума (Даго) на северо-запад, в шхеры. Начальник штаба базы сообщил об этом в разведсводке, направленной вне всякой очереди в штаб КБФ. Но там, видимо, не придали большого значения этому донесению и поплатились. На следующий день, 23 июня, на подходах к Хиума на минах погиб эсминец «Гневный» и подорвался крейсер «Максим Горький». Возможно, корабли попали на минное заграждение, выставленное именно теми кораблями, которых обнаружили наблюдатели с Ханко.
В 4.50 22 июня Военный совет КБФ объявил по флоту: «Германия начала нападение на наши базы. Силой оружия отражать всякую попытку нападения противника».
В шесть часов утра 22 июня с Ханко ушли последние три подводные лодки. Казалось бы, место лодок как раз на Ханко, чтобы действовать в районе Або-Аландских шхер. Но штаб флота принял иное решение. В Ханко осталась береговая база подплава и большой запас торпед (14 вагонов).
К этому времени все части ВМБ Ханко были развернуты на своих боевых участках. Так как указаний о начале военных действий со стороны Финляндии не было, частям было отдано приказание: «По противнику, находящемуся за границей базы, огонь не открывать; противника, перешедшего границу, — уничтожать».
Финны же пока ничего не предпринимали, ограничиваясь наблюдением за нашей территорией. Не вступая одновременно с Германией в войну против Советского Союза, Финляндия 22 июня 1941 г. приступила к операции «Регата» — оккупации Финляндией «демилитаризованных» Аландских островов, запирающих вход в Ботнический залив и поэтому очень важных в стратегическом отношении.
Для выполнения этой задачи в Турку и ближайшем к Аландским островам финском порту Раума были сосредоточены войска, весь военно-морской флот и торговые суда. В ночь с 21 на 22 июня 1941 г. 5 тыс. солдат и офицеров, 24 миномета, 55 полевых пушек и 14 береговых орудий были переброшены на Аландские острова. Операцию прикрывали броненосцы береговой обороны. 1 июля финны закончили вооружение Аландских островов, и часть финского военно-морского флота передислоцировалась в опорные пункты западнее Ханко, где она оставалась до тех пор, пока гарнизон военно-морской базы не был вывезен в Ленинград и Кронштадт. Финны сумели хорошо замаскировать операцию, и на Ханко, как, впрочем, и в штабе флота, ничего об этом не знали.
Непрерывное прибытие немецких воинских частей, сосредоточение немецкой авиации на аэродромах Финляндии и другие провокационные действия говорили о фактическом начале военных действий финнов против СССР без официального объявления войны.
Поскольку Указ Президиума Верховного Совета ввел в стране военное положение, командир базы генерал С. И. Кабанов своим приказом немедленно объявил: все находящиеся на полуострове Ханко воинские части, независимо от принадлежности к разным ведомствам, в целях создания единства командования, необходимого для выполнения задач, стоящих перед базой, подчинены ему.
В соответствии с мобилизационным планом погранотряд майора А. Д. Губина подчинялся командиру 8-й ОСБ полковнику Н. П. Симоняку. Катера морпогранотряда НКВД были переданы в состав ОВРа капитана 2-го ранга М. Д. Полегаева. Из катеров ОВРа и морпогранотряда был сформирован 3-й дивизион сторожевых катеров (7 катеров типа МО-2 и МО-4 и разъездной катер типа ЗИС), который базировался на острове Густавсверн. Командиром 3-го ДСКА был назначен старший лейтенант Г. И. Лежепеков. 25 июля 1941 г. катера, вошедшие в состав дивизиона, получили новые бортовые номера (см. приложение), но в период обороны Ханко в документах фигурировали под старыми. Корабли ОВРа на Ханко в шутку назвали «эскадра Полегаева».
В Ханко после мобилизации должны были придти три сторожевых корабля, 9 тральщиков типа «Ижорец», пять БТЩ, три СКА типа МО. Ни один из этих кораблей в Ханко не прибыл. В приказе командующего КБФ № 31/г. от 25.7.1941 сказано, что «7-й ДТЩ прикомандировывается к бригаде траления ввиду невозможности базировать по обстановке его в Ханко».