Между тем в 1890 году Жане возобновил свои клинические исследования, наблюдая за пациентами Сальпетриер мадам Д., Марселем. Исабель и Ахиллом, которые сыграли важную роль в становлении его теории. На основании своих наблюдений он создал теорию истерии, которая была изложена им сначала в различных научных журналах, а затем в его дипломной работе 1893 года. Его известность вышла за пределы Франции; в июле 1893 года он прочел доклад о связи между амнезией и бессознательными навязчивыми идеями на Международном конгрессе экспериментальной психологии в Лондоне?29
Шарко уже в течение длительного периода интересовался психологией. Совместно с Шарлем Рише он основал Общество Физиологической Психологии. Пытаясь внедрить экспериментальную психологию в созданный им в Сальпетриере исследовательский центр, он открыл для этой цели лабораторию, руководство которой поручил Пьеру Жане. Поскольку Шарко нуждался в Жане для выполнения этой работы, а Жане нужен был Шарко чтобы иметь возможность получать богатый клинический материал, извлекаемый из работы с пациентами в Сальпетриере, это обещало стать началом длительного и плодотворного сотрудничества. Но 7 августа 1893 года, всего через три недели после защиты Жане диплома, на которой присутствовал Шарко, пришло известие о внезапной кончине мастера.
В период с 1893 по 1902 год Жане работал в Сальпетриере с относительной свободой. Профессор Фюльжанс Реймон, занявший место Шарко, лично не интересовался исследованиями в области неврозов, но психологическая лаборатория в Сальпетриере продолжала работать, и он одобрительно относился к деятельности Жане. Поскольку статьи Жане касались пациентов Сальпетриера, большинство из них в течение нескольких лет публиковались за подписью Жане и Реймона. Для Жане это был период энергичной работы и в других областях. Он преподавал философию в Коллеж Ролле вплоть до 1897 года, а в течение 1897-98 учебного года - в Коллеж Кондорсе. Вскоре он был назначен сначала ответственным (charge de cours) за занятия экспериментальной психологией в Сорбонне (1898-1899 гг.), а затем доцентом (1898-1903 гг.). В тот же период Рибо просил Жане заменить его на время с декабря 1895 года по август 1897 года в Коллеж де Франс.30 В 1894 году Жане опубликовал учебник по философии, над которым работал в течение двенадцати лет и о котором мы поговорим позднее.
В личной жизни Жане тоже произошли изменения. В 1894 году он женился на Маргарите Дюшен, дочери аукционера из Гавра, которая после смерти отца переехала в Париж. Молодые супруги сняли квартиру на Рю де Бельшас, а в 1889 году переехали на Рю Барбе де Жюи недалеко от Латинского Квартала. У них было трое детей: Элен (которая впоследствии вышла замуж за Эдуарда Пишона), Фанни (ставшая учительницей французского языка) и Мишель (он был по образованию инженером и умер в молодом возрасте). Жане вел обычную жизнь преподавателя французского коллежа: в течение девяти месяцев в году он преподавал в Париже, затем три месяца отдыхал, готовя во время отпуска лекции к следующему учебному году и занимаясь написанием научных работ. Жане обычно проводил лето в Фонтенбло; его любимым занятием были длительные прогулки по лесу, во время которых он изучал жизнь растений. 22 октября 1894 года в возрасте восьмидесяти двух лет скончался его отец.
В этот период интересы Жане охватывали широкий спектр научных проблем, как это видно из написанных им рецензий на книги, посвященные самым различным темам, начиная от гистологии мозга и кончая экспериментальной психологией и криминологией. Фокус его научных исследований постепенно сдвигался из области истерии в область неврастении. Исследовательская работа Жане была одновременно и экстенсивной, поскольку он осматривал множество больных в клинике и в больнице, и интенсивной, так как он выбирал небольшое количество пациентов, за которыми вел тщательное постоянное наблюдение, длящееся иногда многие годы. Среди таких пациентов была женщина, которую Жане называл «Мадлен», поступившая в Сальпетриер в феврале 1896 года по поводу приступов религиозного экстаза и появления у нее стигматов. Ей предстояло на протяжении нескольких лет играть важную роль в его научных исследованиях. Кроме того, Жане имел собственную врачебную практику и принимал частных пациентов в санатории в Ванвесе. К тому времени он уже завоевал репутацию одного из ведущих специалистов в области неврозов, многие пациенты приезжали к нему лечиться из-за границы. В 1896 году он прочитал на международном конгрессе психологов в Мюнхене доклад по «сомнамбулическому влиянию», в котором подверг дальнейшему развитию старое понятие «раппорт».