Названия сел, которые принято считать прародителями нынешнего Наро-Фоминска, впервые встречаются в Духовной грамоте Ивана Калиты от 1328 года: Фоминское и Нарьское. В дальнейшем, вплоть до официального преображения его в 1926 году в город, во всех письменных источниках и на картах село сохраняет именно такое наименование: Фоминское. В отличие от него Нарское (или Нарьское) в дальнейшем ни в одном известном нам историческом документе не встречается. Поэтому продолжает существовать сильное сомнение в том, что упомянутое Иваном Калитой село располагалось именно здесь, в границах нынешнего города или по соседству. Остается предположить, что его и не существовало, а в тексте было другое название, например — Нерское, а мы просто прочли грамоту, как нам было удобнее.
По утверждению автора очерка о Наро-Фоминске Г.Чупыриной ("Города Подмосковья", кн. 3), в ХVII — ХVIII веках деревня Малая Нара входила в состав вотчин Саввино-Сторожевского монастыря. Существование Малой Нары вытекает только из версии краеведа Чупыриной. В документах, в частности, на географических картах, не встречается ни Малой, ни Большой Нары. Нет ее даже на географической карте 1850 года. Г.Чупырина утверждает, что "Малая Нара, расположенная напротив Фоминского по другую сторону р. Нары", была реальностью, и именно по соседству с ней помещики Скуратов и Лукин построили бумагопрядильную фабрику. Случилось сие в 1840 году.
А на левом берегу реки Нары располагалось великолепное имение князей Щербатовых. Последний отпрыск родовитой российской знати — Сергей Александрович Щербатов обладал недюжинным художественным талантом и, достаточно сказать, привлекался самим Щусевым к участию в росписи интерьеров строившегося в то время здания Казанского вокзала в Москве. Будучи в эмиграции, Сергей Александрович написал интереснейшую книгу воспоминаний под названием "Художник в ушедшей России". Определенный объем текста занимают страницы, в той или иной мере отражающие впечатления автора от подмосковной усадьбы. (Как и многие аристократы, Щербатовы имели еще имение в Полтавской губернии, приличные дома в Москве и Петербурге). И когда он вспоминает подмосковную, то называет ее коротко — Нара.
Почти семьсот страниц книги воспоминаний, и ни разу не упомянуто Фоминское, словно его и не существует в окрестностях
В 1890 году на карте появляется первый вариант топонима из двух знакомых нам слов — Нары Фоминские. В литературе встречается и другой вариант приспособления гидронима, но и он возвращает нас к своему истоку. Нара-река — что означает это название?
В "Кратком топонимическом словаре" В.Никонова дается следующее объяснение: город в Московской области на реке Нара, по которой и назван. В XVI веке село Фоминское, также Фоминский мыт (мыт — феодальная пошлина, взимаемая на заставе с провозимых товаров, затем слово стало означать саму заставу и место ее).
Имение Щербатовых, село Малая Нара, фабрика в Нарах Фоминских — все эти топонимы заимствованы и перенесены с названия реки. А вот как Никонов подходит к объяснению происхождения гидронима: "Нара — левый приток реки Ока. Название, содержащее всего четыре звука, легко связать с очень разнообразными корнями и трудно проверить достоверность". Никонов отвергает происхождение названия от финно-угорских и балтийских языков. Тем не менее, он более лоялен к гипотезе А.Погодина, крупного русского ученого-слависта, доктора славянской филологии, считавшего, что нара означает всего лишь "петля", "изгиб".
Другой крупный специалист в области топонимики — Э.Мурзаев также не уходит далеко от Погодина и Никонова, указывая, что слово "нара" в литовском языке означает "поток", а в одном из своих значений "петля", "изгиб реки". Правда, Мурзаев упоминает и Капанцяна, в связи с его гипотезой о происхождении гидронима Нара от имени древнеармянской богини воды, морей, дождей, рек, источников — Нар. У греков морской бог имел имя — Нерей, а его пятьдесят дочерей — Нереиды. Никто, однако, не решается на окончательный вариант этимологии гидронима Нара.
Вторая часть нашего прославленного топонима — Фоминское или Фоминск не так стара и загадочна, как первая. Образовано от имени человека. Прямой связи с ним, конечно, не имеет, но все же в переводе с древнееврейского означает "близнец". Образовано от церкви, построенной в честь апостола Фомы. Могла быть и в честь средневекового теолога, канонизированного католической церковью, Фомы Аквинского. Все могло быть, в том числе и светский вариант происхождения названия — от имени первого мытаря. Нам этого никогда не узнать.