Утром 29 ноября катера с «Севастополя» встретили и провели к Порт-Артуру шедший из Бомбея английский пароход «Кинг-Артур» с 50 тыс. пудов муки на борту для осаждённой крепости.
В ночь на 30 ноября в третью атаку на «Севастополь» вышли 14-й и 20-й отряды миноносцев, два минных катера и отряд прикрытия. Миноносцы 20-го отряда были обнаружены береговыми постами, но прорвались сквозь открытый береговыми батареями и «Севастополем» огонь, с дистанции около 1,5 км выпустили торпеды и скрылись в темноте. Миноносцы получили сильные повреждения, один из них (№ 64) лишился хода и был приведён на базу на буксире миноносца № 65.
Около 4 ч утра в атаку пошли минные катера с броненосцев «Микаса» и «Фудзи». Им удалось очень близко подойти к «Севастополю» и в упор выпустить в броненосец по торпеде. Только после этого катера были обнаружены и обстреляны. Катера получили незначительные повреждения и самостоятельно вернулись на базу. Обе торпеды попали в броненосец. Одна завязла в сетях и, не взорвавшись, затонула. Другая взорвалась в сетях, броненосец получил пробоину в подводной части шириной в 90 см, было затоплено помещение торпедных аппаратов. К утру пробоину заделали деревянным пластырем и откачали воду из затопленного помещения.
Днём 30 ноября «Севастополь» завёл с кормы к берегу стоп-кран и подтянулся к берегу кормой, насколько позволяла глубина. За день носовую часть броненосца защитили дополнительной бронёй.
В эту ночь в 37 милях к югу от Порт-Артура подорвался на русской мине японский бронепалубный крейсер «Такасаго», на следующий день он затонул, погибло 280 членов экипажа.
В ночь на 1 декабря погода испортилась, задул свежий ветер, началась пурга. Перед бухтой Белый Волк встал дозор русских миноносцев и минных катеров. Пять японских миноносцев подошли к бухте, выпустили торпеды с большой дистанции и отошли. Одна торпеда попала в японский миноносец № 53, и он затонул со всем экипажем. (По другой версии, он был потоплен огнём орудий «Севастополя».)
В ночь на 2 декабря погода улучшилась, лишь после полуночи пошёл снег. По приказу адмирала Ямада в атаку на русский броненосец пошли все имеющиеся в распоряжении блокадного флота миноносцы 2-го, 6-го, 9-го, 10-го, 12-го, 14-го, 15-го, 16-го и 21-го отрядов и минный катер с «Фудзи». Как только скрылась луна и пошёл снег, в атаку двинулись японские миноносцы 6-го и 12-го отрядов. Невзирая на сильный артиллерийский огонь с «Севастополя», ослепленные прожекторами, они упорно шли вперёд. Пробившись через заградительный огонь, головной миноносец № 56 подошёл к «Севастополю» на предельно близкое расстояние и выпустил торпеду. Следующий миноносец, № 58, получивший двадцать попаданий, всё же сблизился с русским броненосцем и выпустил торпеду. Шедший концевым миноносец № 52 выпустил две торпеды.
Схема 31. Бронепалубный крейсер «Такасаго»
Около 2 ч ночи в атаку пошли миноносцы второй волны — «Хибари», «Саги», «Удзура» и «Хаситака». Затем двинулись третья, четвёртая и пятая волны японских миноносцев. Огнём с «Севастополя» и русских миноносцев был повреждён миноносец № 49 и потоплен миноносец № 42. Шестой волной пошли миноносцы 14-го отряда «Чидори», «Касасаги» и «Манадзуру», седьмой волной — миноносцы 9-го отряда «Аотака», «Цубаме», «Кари» и «Хато». «Севастополь» вёл огонь орудиями всех калибров. В судно «Аотака» попало несколько снарядов, была разбита носовая кочегарка, два человека убито и три ранено. На «Цубаме» разбита паровая машина, один матрос убит и шестеро ранено. При выходе из атаки «Кари» столкнулся с «Аотака», оба миноносца получили серьёзные повреждения.
В эту ночь «Севастополь» атаковали 23 миноносца и один минный катер. Они выпустили около 30 торпед в броненосец и его охранение, пять торпед попали в развёрнутые вокруг броненосца противоторпедные сети, четыре из них взорвались. Одна торпеда прошла между бонами у носа «Севастополя» и взорвалась в навесной сети, спущенной на особых стрелах для ограждения форштевня. Взрывом повредило обшивку около тарана, и всё таранное отделение было затоплено.
В ночь на 2 декабря «Севастополь» выпустил девять 305-мм снарядов, 41 — 142-мм и несколько десятков 75–37-мм снарядов. Утром на берегу нашли пятнадцать японских торпед, из которых для нужд крепости извлекли около полутора тонн пироксилина и мелинита.