Только во второй половине дня около дома была выставлена охрана.
До этого времени любой, кому вздумается, мог туда войти и делать там все, что ему захочется.
Дитерихс так описывает ситуацию: «Сильное волнение распространилось среди офицерства, вступившего в город, когда стало известным, в каком состоянии находится дом Ипатьева, где содержится Царская семья.
Все, что было свободным от службы и боевых порядков, все потянулись к дому. Каждому хотелось повидать это последнее пристанище Августейшей Семьи; каждому хотелось принять самое активное участие в выяснении мучившего всех вопроса: ГДЕ ЖЕ ОНИ?
Кто осматривал дом, взламывал некоторые заколоченные двери, кто набрасывался на разбор валявшихся вещей, вещиц, бумаг, обрывков бумаг, кто выгребал пепел из печей и ворошил его, кто бегал по саду, двору, заглядывал во все подвалы, и каждый действовал сам за себя, не доверяя другому, опасаясь друг друга и стремясь найти какие-нибудь указания — ответ на волновавший всех вопрос».
Так возник вопрос: ГДЕ ЖЕ ОНИ?
Появившийся в доме 28 июля исполняющий должность прокурора Екатеринбургского суда Кутузов, после краткого осмотра дома Ипатьева выразил уверенность, что «здесь совершено убийство и ограбление».
И вот это утверждение уверенности вне зависимости от наличия фактов или их серьезной проверки с одновременным отбрасыванием всего, что противоречило бы этой уверенности, легло тяжким проклятием на весь следственный процесс.
В книге Дитерихса очень ярко и эмоционально описывается обстановка, в которой началось следствие: после осмотра в доме Ипатьева и нахождения в лесу горелого места с остатками вещей, принадлежавших Царской семье «всем стало ясно, что большевики жгли в коптевском лесу одежду членов Царской семьи. Отсюда, как логическое следствие впечатления, вынесенного от осмотра дома Ипатьева, родилось страшное и определенное убеждение: Августейшая Семья убита; тела вывезены преступниками в лес, там Их обыскали, раздели и бросили в шахту, а одежду, белье и прочее сожгли, чтобы скрыть следы».
А раз так, то всего-то дел — найти трупы, сброшенные в шахту.
Инициативу взяла на себя группа молодых офицеров во главе с капитаном Малиновским. Капитан Дмитрий Аполлонович Малиновский был слушателем Императорской Военной академии, которая по иронии судьбы была эвакуирована именно в столицу Красного Урала Екатеринбург. Еще при Советской власти в июне — июле 1918 года капитан Малиновский собрал вокруг себя единомышленников, решивших спасти Николая Романова и его семью, но ничего из этого не вышло: с одной стороны сказался недостаток финансовых средств, а с другой — их деятельность была уже под контролем ЧК.
И вот этот человек, в руки которого попали найденные в лесу обожженные вещи, среди которых был изумрудный крест, опознанный как принадлежащий одной из великих княжон, с группой таких же молодых и горячих офицеров, уверенных в том, что трупы находятся в лесу в затопленной шахте, с энергией молодости, начитавшийся Ната Пинкертона и Ника Картера, бросился откачивать воду из шахт, чтобы извлечь останки Царской семьи.
Но, видя безразличное отношение судебных властей к этим поискам и сознавая свою некомпетентность в следственном деле, он буквально силой заставил принять участие в этой работе следователя по особо важным делам Наметкина.
Следственные власти все-таки были вынуждены начать официальное следствие после того, как к ним поступил донос некоего Горшкова, через третьих и четвертых лиц получившего информацию о расстреле Царской семьи в доме Ипатьева. Дело, открытое 30 июля 1918 года, называлось так: «Дело об убийстве бывшего Императора Николая II и членов Его Семьи». Вести это следствие было поручено тому же Наметкину, которого уже привлек капитан Малиновский. Правда, Наметкин не долго занимался этим делом. Его попытки вести следствие привычными для него методами, то есть сначала методично собрать факты, а потом уж обосновать с их помощью версию, натолкнулись на непонимание офицеров, считавших, что надо быстрее искать трупы.
В результате следователь Наметкин, проработавший всего несколько дней, уже 12 августа был отстранен от следствия. Тем не менее, он оставил в следственном производстве единственный документ, в котором подробно описана обстановка верхнего этажа дома Ипатьева, как ее застали следственные органы.
Чем закончились поиски в шахте — известно. Товарищ Прокурора Екатеринбургского Окружного суда Н.Н. Магницкий в представлении прокурору от 30 декабря 1918 года писал: «…если мне зададут вопрос, где царские трупы, я прямо скажу: я их не нашел, — но они в урочище «Четыре Брата».