Гус обличал также продажность и лицемерие служителей божьих: «Мало есть священников, которые бы не купили своих мест и не собирали бы о ворующих податей, — гневно звучал ого голос, — и вот, одного ставят попом за деньги, другого назначает король или пан, а он между тем настолько малограмотен, что не смог бы пасти даже свиней». Многие пронырливые попы, указывал Гус, умудрились захватить по несколько доходных мест в чешской церкви и теперь проводят время в обжорстве и беспробудном пьянстве. При этом они даже не выполняют своих пастырских обязанностей, а помышляют лишь о том, как бы обменять свои приходы на еще более богатые.
Католические церковники всегда изощрялись в изыскании новых средств для пополнения своей мошны. Почти в каждой церкви или часовне хранились чудотворные мощи какого-либо из бесчисленных христианских святых. В пражском храме святого Вита верующие могли, например, за особую плату узреть пеленки Иисуса Христа, молоко богоматери, руку Лазаря и подобные им «святыни». Разжигая фанатизм и нагло эксплуатируя религиозные чувства верующих, попы наживали большие деньги. Не довольствуясь этим, они часто создавали новые «чудеса», фабриковали новые реликвии, продавали особые разрешительное грамоты (индульгенции), которые, согласно уверениям католических проповедников, давали купившему их грешнику прощение п небесное блаженство.
В своих первых проповедях Ян Гус выступал главным образом против немецкого засилья в Чехии, обличал недостойное поведение попов и монахов. С течением времени он переходит к последовательной критике всей католической церкви, углубляя и заостряя каждое следующее выступление, каждую новую проповедь. А так как католическая церковь являлась в то время важнейшей составной частью средневекового феодального общества и освящала это общество своим авторитетом, то такое решительное и последовательное выступление против церкви подрывало устои феодальных порядков вообще.
Проповеди Гуса, снискавшие ему широкую популярность, произносились на чешском языке. Гус выступал в так называемой Вифлеемской часовне, священником которой он являлся. Кроме того Гус читал лекции в Пражском университете. Гус пользовался авторитетом и уважением среди студентов и магистров университета, два раза его избирали даже ректором. При его непосредственном участии управление университетскими делами перешло от немцев к чехам. А так как значение университета в жизни страны было велико, то эти изменения явились важным событием в истории чешской культуры, сыгравшим немалую роль в борьбе с немецким засильем.
Ян Гус выступал против католической церкви с бюргерских позиций. Но он был тесно связан с народом, из рядов которого вышел, и его проповеди с каждым разом приобретали все более и более революционный характер. В своей борьбе Ян Гус был не одинок. Одновременно с ним против церковников выступал его ближайший друг и ученик Иероним Пражский. Это был ученый человек и в то же время страстный борец за народное дело. Его пламенные речи и проповеди звучали не только с университетской кафедры или с церковного амвона — он безбоязненно выступал на улицах и площадях. Иероним много путешествовал, и повсюду его взволнованные, идущие от сердца слова зажигали слушателей желанием встать в ряды народных борцов.
Выступления Гуса и его соратников против церкви наносили сокрушительные удары не одним церковникам, но и вообще феодальным властителям. Гус не только разоблачал попов, но и требовал лишить их награбленного имущества, разогнать продажных монахов. Впоследствии враги обвиняли Гуса в том, что он выступал перед «множеством простых людей» и призывал их «препоясаться мечом» и встать на защиту справедливости. И если сначала Гус предлагал лишить земельной собственности лишь распутных и недостойных священников, то в дальнейшем он прямо провозглашал, что церкви по подобает владеть богатством. «Отними у собак кость, — говорил Гус, — они перестанут грызться, отними имущество у церкви — не найдешь для нее попа». Поэтому он делал вывод, что очистить ряды духовенства от жадных, распутных и невежественных попов можно лишь в том случае, если отобрать у них землю и богатство. Такие высказывания вызвали бешеную ненависть к смелому проповеднику в среде чешского духовенства. Правда, до поры до времени его не осмеливались трогать. Но вскоре последовало открытое выступление Гуса против продажи индульгенций, которое и привело к окончательному его разрыву с католической церковью. Гус был вынужден покинуть Прагу и провести много месяцев в изгнании. Он был даже отлучен от церкви, однако любовь и преданность простого народа повсюду сопровождали Гуса, давая ему силы в неравной борьбе.