В половине одиннадцатого Валчик подал сигнал: автомобиль был уже близко. Габчик вслепую собрал под перекинутым через руку плащом свой автомат “Стэн”. Машина Гейдриха подъехала к перекрестку; одновременно с ней к находившейся там же остановке подъехал обычный трамвай. Перед крутым поворотом направо обершарфюрер СС Клейн слегка притормозил. Внезапно перед автомобилем появился невзрачный человек с плащом на руке. Решив, вероятно, что это какой-то недотепа-чех, рискуя жизнью, торопится на трамвай, Клейн резко затормозил. И тут в руках “недотепы” блеснуло оружие. Всего несколько шагов отделяли Габчика от эсэсовца № 2. Но вместо выстрелов послышались только сухие щелчки — английский автомат “Стэн” отказал в самый неподходящий момент! Бесполезно провозившись с ним пару секунд, Габчик отбросил его и пустился бежать.
Пассажиры “мерседеса” очень быстро пришли в себя. Гейдрих и Клейн выхватили пистолеты, не отрывая взглядов от незадачливого террориста, обане заметили, как перед автомобилем, словно из-под земли, вырос Кубиш, который по плану должен был лишь подстраховывать своего товарища и после расстрела Гейдриха забрать из машины документы. Ян Кубиш бросил в “мерседес” гранату, которая упала где-то позади Гейдриха, за сиденьем. Раздался взрыв. Иссеченный осколками, весь в крови, Кубиш побежал к велосипеду, оставленному им на противоположной стороне улицы…
Все это произошло в какие-то секунды. В задней правой части автомобиля, у колеса, взрывом вырвало небольшой кусок обшивки; осколки пробили шину. Никаких других особых повреждений заметно не было. Словно завороженные, Гейдрих и Клейн видели только бегущего Габчика. Гейдрих встал с сиденья, вышел из машины и разрядил вслед ему всю обойму своего пистолета. Осколками гранаты и щепками от сиденья его ранило в спину, и бежать за кем-либо у него просто не было сил. Клейн же, легко раненный взрывом, бросился, наконец, в погоню за Габчиком. Отстреливаясь из пистолета, Габчик попытался скрыться во дворе мясного магазинчика некоего Браунера. Но бдительный Браунер выбежал на улицу и указал эсэсовцу Клейну, где именно скрылся беглец. Габчику, однако, удалось ранить Клейна в ногу и оторваться от преследования. Из-за потери крови и шока Гейдрих потерял сознание. Осколки повредили селезенку, в рану попали частицы разорванных сидений, еще какая-то грязь. Самый опасный человек в нацистском руководстве истекал кровью на земле на глазах толпы.
А на остановке ведь стояли люди. В одних источниках свидетельствуют, что окровавленному Гейдриху никто не помог, но в других пишут однозначно: законопослушные, трудолюбивые и цивилизованные чехи, видя, как второй после Гиммлера эсэсовец, совершенно один, пребывает в беспомощном состоянии, а ранивший его террорист, с окровавленным лицом, бежит прочь и явно намеревается уйти от заслуженного наказания, поступили как это было и положено: одна группа законопослушных чехов, преграждая Кубишу дорогу, бросилась его ловить, и, только распугав их выстрелами в воздух, Ян Кубиш добежал-таки до велосипеда и скрылся, другая же группа кинулась на помощь одинокому раненому обергруппенфюреру СС, так торопившемуся в Берлин по вызову фюрера.
Первой подоспела пани Мария Наваррова, которая оказала Гейдриху необходимую помощь, а затем остановила проезжавший мимо экспедиторский автомобиль фирмы “Голан”, уже через десять минут доставивший раненого в близлежащую больницу на Буловке. Непонятным остается и тот факт, что бывшие на месте покушения два других парашютиста Йозеф Валчик и Адольф Опалка, видя, что покушение, в сущности, не достигло цели, а Рейнхард Гейдрих только ранен, не попытались его добить, но вполне вероятно, что огромное давление на их психику оказало то, что его в те минуты заслонили собою “простые чехи”…
Граната взорвалась примерно в 10.35 утра, а уже в 12.50 взбешенный Гитлер по телефону устроил Карлу Франку разнос, приказав тому немедленно объявить о награде в миллион рейхсмарок за поимку террористов и объявить, что всякий, кто окажет им помощь, будет расстрелян вместе с семьей. Одновременно Гитлер поручил тому же Франку временно исполнять обязанности наместника вплоть до выздоровления Гейдриха, но категорически запретил ему ездить без соответствующего сопровождения. Кроме того, в качестве ответной меры фюрер предложил арестовать и затем расстрелять 10 тысяч “подозрительных” чехов (впоследствии Франку удалось добиться отмены этого решения).