Гарнизон второго по величине острова Хийумаа составляли 6 береговых батарей, 36-я кавдивизия без двух кавполков и один стрелковый полк из состава 16-й сд. После начала войны из трех строительных батальонов и местного призывного контингента на острове был развернут еще один стрелковый полк. На аэродроме Кярдла размещались истребительный и бомбардировочный полки флотской авиации. Командовал гарнизоном острова командир кавдивизии генерал-майор Е. С. Зыбин. Один из кавполков 36-й дивизии был дислоцирован отдельными подразделениями на малых островах архипелага: Осмуссааре, Вормси, Муху, Рухну и других.
На полуострове Ханко, арендованном у Финляндии после Зимней войны, размещались 4 береговые батареи, стрелковая бригада, дивизион торпедных катеров и истребительный авиаполк.
После ликвидации немецкого прорыва у Саласпилса, окружения 4-й танковой группы и разгрома немецкого конвоя в Рижском заливе Ставка ВГК сделала вывод, что опасаться немецкого морского десанта на материковое побережье Латвии и Эстонии больше нет оснований. Поэтому появилась возможность сосредоточить усилия командования 27-й армии на обороне Моонзундского архипелага. 18 июля был отдан приказ на передислокацию управления 27-й армии на Сааремаа. На командующего армией генерал-майора Н. Э. Берзарина было возложено командование всеми силами БОБР. Контр-адмирал Кабанов стал его заместителем по флоту, береговой артиллерии и флотской авиации. Одновременно был отдан приказ на передислокацию 6-й кавдивизии с материка на острова Сааремаа и Хийумаа. К 21 июля передислокация дивизии была завершена. В первой половине июля усилиями органов НКВД, флотских радистов и военной контрразведки была ликвидирована вражеская агентура на островах Сааремаа и Хийумаа. Были запеленгованы и ликвидированы пять агентурных радиопередатчиков. Поэтому переброска штаба 27-й армии и 6-й кавдивизии не была своевременно вскрыта немецкой разведкой.
Командование КБФ сочло недостаточными силы флота в Рижском заливе. Туда дополнительно были переброшены два дивизиона эсминцев, еще один дивизион малых подводных лодок и легкие крейсеры «Киров» и «Максим Горький». Поскольку выход из Финского залива контролировали немецкие тяжелые крейсеры, корабли пришлось проводить через мелководный пролив Суур между островом Муху и материком. Так как минимальная глубина пролива составляла всего 6 метров, а осадка крейсеров – 6,9 метра, для проводки пришлось снять с кораблей весь боекомплект, якоря, топливо и большую часть экипажа. Корабли провели через пролив на буксире. Кроме того, все боеспособные подводные лодки были развернуты на позициях в море. Два дивизиона подводных лодок типа «Щ» развернули вдоль морского побережья архипелага и в завесе поперек устья Ботнического залива. Минные заградители продолжали еженощно выставлять минные банки у Кенигсберга, Лиепаи, у входа в Ботнический залив.
Двадцать первого июля дозорные подводные лодки в завесе у острова Готланд зафиксировали прохождение на восток эскадры в составе новейшего линкора «Тирпиц», двух легких крейсеров и четырех миноносцев. Произведенная воздушная разведка установила, что «Тирпиц» в сопровождении миноносцев и крейсеров на экономической скорости направился вдоль шведского побережья к Ботническому заливу. 22 июля в 18:00 дозор у острова Готланд обнаружил эскадру из двух старых линкоров «Шлезиен» и «Шлезвиг-Гольштейн», большого числа тральщиков, катеров и десантных паромов. Экипаж лодки С-22 выпустил с большого расстояния 4 торпеды, попаданий не было.
Практически одновременно подводная лодка Щ-14, из состава дивизиона, развернутого у входа в Ботнический залив, обнаружила большую группу транспортов в сопровождении тральщиков и катеров, следующую из залива курсом на юго-юго-восток. Экипажу лодки удалось торпедировать один тральщик. Высланные туда воздушные разведчики насчитали в конвое 15 транспортов в сопровождении шести тральщиков и пяти катеров. Командование КБФ и БОБР объявили полную боевую готовность и активизировали воздушную разведку. «Тирпиц» с двумя миноносцами на траверсе острова Хийумаа повернул на восток к устью Финского залива и в 20 часов встретился с крейсировавшими там «карманными» линкорами «Лютцов» и «Адмирал Шеер», которые после встречи с «Тирпицем» направились на юго-запад на пересечение с курсом транспортов. Легкие крейсеры с двумя миноносцами тоже пошли навстречу конвою.