Согласно Геродоту, однако, во времена первых египетских царей Дельта была полностью затоплена водой; сообразуясь с этим сообщением, археологические данные говорят о том, что раннее государство в Египте возникло в Верховье. Мы выдвигаем гипотезу, что Дельта оказалась наводнена в результате катастрофической трансгрессии Средиземного моря, качественно изменившей геополитическую ситуацию в стране. Резкое сокращение жизненного пространства в Нижнем Египте ориентировочно в конце герзейского периода мы рассматриваем как важнейшее условие Первого социально-экологического кризиса древнеегипетской цивилизации.
Для оценки реального воздействия средиземноморской трансгрессии IV-гo тыс. до н. э. на дельту Нила мы приняли во внимание различные геофизические реконструкции эвстатического процесса во второй половине голоцена. Поначалу все они сводились к двум основным моделям. Одна из них допускала, что уровень Мирового океана в IV тыс. до н. э. мог превзойти современный нуль глубин на 3–4 м и в дальнейшем испытывать затухающие колебания с периодом в сотни лет и амплитудой ±1–3 м, другая исключала такую возможность, описывая приближение океанского зеркала к его современному уровню кривой наподобие экспоненты. Впоследствии, с учетом тектонических и изостатических процессов, деформаций геоида и некоторых других факторов, была вскрыта пространственно-временная неоднородность динамики позднеголоценовой эвстазии, предусматривающая для различных береговых линий как наличие, так и отсутствие превышения морями их современного уровня. При этом литостратиграфия Нижнего Египта дает основание для предварительного заключения, что в обоих случаях в IV тыс. до н. э., на пике послеледниковой трансгрессии, Дельту ожидало катастрофическое затопление Средиземным морем.
Приняв это заключение в качестве рабочей гипотезы, можно выдвинуть принципиально новую версию образования государства в Египте, при этом объяснив феномен 120 тыс. "пленников", которых якобы захватил в Низовье правитель 0-й династии Нармер. Цифра эта (если считать, что она не символична, а реальна), несомненно, слишком велика, чтобы поверить в ее адекватность масштабам межплеменных войн, однако лишается загадочности, если допустить, что "пленники" являлись беженцами, в массовом порядке покидавшими Нижний Египет по мере приближения кульминационной фазы трансгрессии. Именно это демографическое явление мы бы поставили в связь с зарождением в Долине государства: по-видимому, одна из тамошних племенных группировок в сравнительно короткий срок выросла настолько, что условием ее дальнейшего существования стала стремительная иерархизация. В то же время, полагая, что демографический взрыв в Верхнем Египте носил характер локальной аномалии, раннединастическое государственное образование должно было представлять собой подобие "продвинутой" социально-политической субсистемы, которая первоначально занимала ограниченную часть территории страны и лишь постепенно распространяла свое влияние на остальной Египет. Исходя из этих соображений, мы бы квалифицировали древнеегипетское Раннее царство как "нулевой" Переходный период к зрелому централизованному государству, окончательно сформировавшемуся, как мы думаем, при III династии; социально-политической системе Египта времен I–II династий, на наш взгляд, больше подходит дефиниция "раннее государство".
Массовой миграции жителей Дельты в Верхний Египет, вероятно, благоприятствовал так называемый "неолитический спад" — значительное уменьшение стока и, соответственно, разливов Нила, завершающая стадия которого, по нашим оценкам, совпала с правлением I династии. Сокращение затапливаемой Нилом площади Долины, улучшив экологические условия региона, с одной стороны, как можно допустить, смягчило социальный катаклизм, связанный с колоссальной миграцией, с другой — должно было способствовать развитию ирригационной сети и дальнейшей интеграции населения раннединастического Египта.
Эпоха, предварявшая переход к государству в долине Нила, характеризовалась глобальным изменением климата. Большой атлантический оптимум с его увлажненностью сменило похолодание, развивавшееся на протяжении почти всего IV тыс. до н. э. и сопровождавшееся аридизацией Северо-Восточной Африки. Вместе с тем примерно до 3800–3700 гг. до н. э. климат Египта, по-видимому, оставался сравнительно теплым и влажным. Резко похолодало лишь ближе к 3600 г. до н. э., причем нельзя не отметить, что эта климатическая веха совпадает с археологической: переходом от амратского (Нагада I) к герзейскому (Нагада II) периоду в истории додинастического Египта. Похолодание продолжалось примерно до 3200 г. до н. э.; в целом среднеполушарная температура понизилась по отношению к атлантическому оптимуму на 2,4 °C. В разгар этой климатической аномалии в Северо-Восточной Африке было гораздо суше и, возможно, несколько жарче, чем теперь. Таким образом, зарождение раннеегипетской государственности происходило в условиях сильных засух в Египте, что, не исключено, нашло отражение в "незрелости" социально-политической системы Раннего царства.